ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Salvia miltiorrhiza chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020431	AAT	4	7564	7574	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_020431	CAA	4	8665	8676	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_020431	CTT	4	10100	10111	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45901447
4	NC_020431	TAA	5	12424	12438	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45901447
5	NC_020431	ATT	4	27016	27027	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_020431	ATA	4	31794	31805	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_020431	AGA	4	35537	35548	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_020431	ATG	4	37983	37993	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45901449
9	NC_020431	GCA	4	39879	39889	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	45901449
10	NC_020431	ATG	4	40207	40217	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45901449
11	NC_020431	TTG	4	43390	43400	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45901449
12	NC_020431	GTA	4	44010	44020	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_020431	TAT	4	45796	45808	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_020431	ATA	4	45809	45821	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_020431	ATT	4	50155	50165	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_020431	AGA	4	50423	50434	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_020431	TTA	4	50846	50857	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_020431	ATA	4	53793	53803	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45901450
19	NC_020431	TAA	4	59972	59983	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_020431	ATA	4	65779	65790	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_020431	GAA	4	70074	70084	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	45901447
22	NC_020431	TCT	4	72595	72606	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45901447
23	NC_020431	ATA	4	77598	77609	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45901447
24	NC_020431	CAT	4	78092	78102	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	45901447
25	NC_020431	CTT	4	82850	82861	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45901447
26	NC_020431	GAT	4	87716	87727	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45901447
27	NC_020431	TGA	4	89404	89415	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45901447
28	NC_020431	TTC	4	97159	97170	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45901451
29	NC_020431	ATT	4	108929	108941	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45901451
30	NC_020431	TAA	4	109346	109357	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45901451
31	NC_020431	GAA	4	110332	110343	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45901451
32	NC_020431	AAT	4	111847	111859	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45901451
33	NC_020431	TTA	4	116511	116521	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45901451
34	NC_020431	TTC	5	117647	117661	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	45901451
35	NC_020431	GAA	4	136854	136865	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45901451
36	NC_020431	ATC	4	146297	146308	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45901455
37	NC_020431	GAA	5	151162	151176	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	45901455

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Salvia miltiorrhiza chloroplast