ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ceratocystis cacaofunesta mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020430	TAT	4	989	999	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_020430	TGA	5	2615	2629	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_020430	TAA	5	6581	6595	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_020430	AGA	4	7549	7560	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45635150
5	NC_020430	TTA	4	8269	8279	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_020430	TAT	4	8690	8702	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_020430	TAT	4	9841	9853	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_020430	TAA	4	10595	10606	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_020430	TAC	4	11274	11286	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
10	NC_020430	AAT	4	12182	12193	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_020430	TAA	4	14940	14951	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_020430	TAA	4	15007	15018	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_020430	TAT	4	16888	16899	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_020430	ATA	4	16910	16920	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_020430	ATT	4	17781	17792	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_020430	CTA	4	20029	20040	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45635145
17	NC_020430	ATT	4	20537	20547	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45635145
18	NC_020430	TAT	4	20617	20628	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635145
19	NC_020430	TAA	4	20946	20958	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_020430	ATA	5	21238	21252	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	45635145
21	NC_020430	TTA	4	22046	22056	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45635145
22	NC_020430	AAG	4	23595	23605	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	45635145
23	NC_020430	ATA	6	24039	24056	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	45635145
24	NC_020430	AAT	4	25759	25771	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45635145
25	NC_020430	GTA	4	25942	25953	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45635145
26	NC_020430	AAG	4	26093	26104	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45635145
27	NC_020430	TAA	4	27065	27077	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45635145
28	NC_020430	TTC	5	28232	28246	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	45635145
29	NC_020430	ATT	4	28672	28683	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635145
30	NC_020430	GAA	5	29055	29069	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	45635145
31	NC_020430	ATT	4	30659	30670	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635145
32	NC_020430	TAT	4	32018	32028	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_020430	GAA	4	32488	32499	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_020430	TAT	4	35290	35301	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635146
35	NC_020430	TAT	4	36017	36028	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635146
36	NC_020430	TAT	4	36110	36121	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635146
37	NC_020430	ATA	5	36823	36837	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45635146
38	NC_020430	TAA	4	37054	37065	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635146
39	NC_020430	TAA	4	38013	38024	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635146
40	NC_020430	TAT	4	38083	38095	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45635146
41	NC_020430	AGG	4	40620	40631	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	45635146
42	NC_020430	GTA	4	42497	42508	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45635146
43	NC_020430	TAT	4	43300	43310	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45635146
44	NC_020430	TTA	4	44182	44194	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45635146
45	NC_020430	ATA	4	46480	46491	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635146
46	NC_020430	TAA	5	47186	47200	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45635146
47	NC_020430	ATA	4	47909	47919	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45635146
48	NC_020430	TTA	4	51019	51030	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_020430	AAG	4	51902	51913	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_020430	ATT	4	52512	52522	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45635146
51	NC_020430	TAA	4	53292	53304	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45635146
52	NC_020430	TAT	5	55873	55887	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45635146
53	NC_020430	ATA	4	56153	56164	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_020430	ATT	4	56547	56558	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_020430	TAA	4	57084	57095	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	45635146
56	NC_020430	ATA	4	57790	57801	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635146
57	NC_020430	ATT	4	59376	59386	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45635146
58	NC_020430	TAT	5	59885	59899	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45635146
59	NC_020430	ATA	4	67051	67061	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45635146
60	NC_020430	ATT	4	67608	67620	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45635146
61	NC_020430	TAA	4	69502	69512	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45635146
62	NC_020430	GTA	4	69810	69820	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45635146
63	NC_020430	TTC	4	70981	70992	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_020430	TAA	4	71131	71142	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_020430	ATA	5	74028	74042	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_020430	TAT	4	74230	74244	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45635146
67	NC_020430	TAA	4	76223	76234	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635146
68	NC_020430	TAA	4	78062	78073	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635145
69	NC_020430	TAA	4	79666	79678	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45635145
70	NC_020430	TAT	5	79845	79859	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45635145
71	NC_020430	CTA	4	80556	80567	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45635145
72	NC_020430	TAA	4	81550	81561	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635146
73	NC_020430	TCT	4	82439	82450	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45635146
74	NC_020430	TAT	4	83181	83191	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45635146
75	NC_020430	TTA	4	83892	83904	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45635146
76	NC_020430	ATA	4	84091	84101	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45635146
77	NC_020430	TAA	4	85596	85607	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_020430	TTA	4	87281	87292	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_020430	TAA	4	93715	93726	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635146
80	NC_020430	AAT	4	94821	94832	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635146
81	NC_020430	TAT	4	95428	95439	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635146
82	NC_020430	ATC	4	95710	95721	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45635146
83	NC_020430	ATT	4	96725	96736	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_020430	TAT	4	97306	97316	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_020430	TTA	4	98115	98126	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_020430	TAT	4	98622	98633	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635146
87	NC_020430	TTA	7	101075	101094	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	45635146
88	NC_020430	TAA	4	101143	101154	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635146

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ceratocystis cacaofunesta mitochondrion