ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ceratocystis cacaofunesta mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020430	TAAA	3	287	297	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_020430	AT	6	670	681	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_020430	TAT	4	989	999	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_020430	GAAA	3	2219	2229	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_020430	AAGG	3	2348	2358	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_020430	A	12	2603	2614	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020430	TGA	5	2615	2629	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_020430	TGATTT	3	3354	3371	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	45635150
9	NC_020430	A	13	5718	5730	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	45635145
10	NC_020430	TTTA	3	5768	5778	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45635145
11	NC_020430	AT	9	6027	6043	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	45635145
12	NC_020430	TAA	5	6581	6595	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_020430	A	13	6594	6606	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020430	TTTA	5	6748	6767	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_020430	AGAT	3	7201	7211	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	45635150
16	NC_020430	AGA	4	7549	7560	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45635150
17	NC_020430	TA	6	8256	8268	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_020430	TTA	4	8269	8279	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_020430	TAT	4	8690	8702	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_020430	AT	6	8767	8778	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_020430	C	16	8812	8827	16	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	Non-Coding
22	NC_020430	TCCG	3	9138	9148	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
23	NC_020430	TTTA	3	9429	9439	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_020430	TAT	4	9841	9853	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_020430	A	13	10085	10097	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_020430	TTTA	3	10135	10146	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_020430	TAA	4	10595	10606	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_020430	G	18	11081	11098	18	0 %	0 %	100 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_020430	T	12	11245	11256	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020430	TAC	4	11274	11286	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
31	NC_020430	AATT	3	11322	11332	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_020430	TTTA	3	11412	11423	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_020430	TAAA	3	11911	11921	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_020430	AAT	4	12182	12193	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_020430	G	13	14363	14375	13	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020430	GTTA	3	14391	14402	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020430	TAA	4	14940	14951	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_020430	TAA	4	15007	15018	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_020430	A	12	15358	15369	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020430	AATTAT	3	15529	15547	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
41	NC_020430	T	13	16334	16346	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020430	ATTTT	4	16500	16520	21	20 %	80 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_020430	T	13	16673	16685	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020430	TAT	4	16888	16899	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_020430	ATA	4	16910	16920	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_020430	ATAG	3	16939	16950	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_020430	G	15	17479	17493	15	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020430	AAATA	4	17698	17716	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
49	NC_020430	ATT	4	17781	17792	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_020430	TA	7	18124	18139	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_020430	TAAG	3	18406	18417	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_020430	TTTA	3	19516	19527	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45635145
53	NC_020430	CTA	4	20029	20040	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45635145
54	NC_020430	TA	6	20147	20157	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45635145
55	NC_020430	ATT	4	20537	20547	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45635145
56	NC_020430	AT	6	20577	20587	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45635145
57	NC_020430	TAT	4	20617	20628	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635145
58	NC_020430	TTTA	3	20730	20740	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45635145
59	NC_020430	T	13	20924	20936	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_020430	TAA	4	20946	20958	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_020430	T	14	21208	21221	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020430	ATA	5	21238	21252	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	45635145
63	NC_020430	TA	6	21416	21426	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45635145
64	NC_020430	AATT	3	21560	21570	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45635145
65	NC_020430	TTA	4	22046	22056	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45635145
66	NC_020430	TAAA	3	22064	22075	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45635145
67	NC_020430	AAG	4	23595	23605	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	45635145
68	NC_020430	ATA	6	24039	24056	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	45635145
69	NC_020430	A	15	24203	24217	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	45635145
70	NC_020430	AAGA	3	24536	24546	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	45635145
71	NC_020430	AAT	4	25759	25771	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45635145
72	NC_020430	GTA	4	25942	25953	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45635145
73	NC_020430	AAG	4	26093	26104	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45635145
74	NC_020430	AAAT	3	26336	26346	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45635145
75	NC_020430	TAA	4	27065	27077	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45635145
76	NC_020430	TTC	5	28232	28246	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	45635145
77	NC_020430	TATT	3	28457	28468	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45635145
78	NC_020430	ATT	4	28672	28683	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635145
79	NC_020430	AGAAA	4	28982	29001	20	80 %	0 %	20 %	0 %	5 %	45635145
80	NC_020430	GAA	5	29055	29069	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	45635145
81	NC_020430	TATT	3	29880	29890	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45635145
82	NC_020430	ATT	4	30659	30670	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635145
83	NC_020430	TTTA	3	31231	31241	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45635145
84	NC_020430	TTAA	3	31435	31445	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_020430	CATT	3	31649	31660	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020430	TAT	4	32018	32028	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_020430	GAA	4	32488	32499	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_020430	T	12	32681	32692	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_020430	ATTT	3	33009	33019	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_020430	AAAT	3	33295	33307	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_020430	GT	6	33636	33648	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_020430	G	12	33897	33908	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020430	G	15	33972	33986	15	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020430	TTTA	4	34279	34294	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_020430	TTTA	3	34313	34323	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45635146
96	NC_020430	TAT	4	35290	35301	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635146
97	NC_020430	TAT	4	36017	36028	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635146
98	NC_020430	TAT	4	36110	36121	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635146
99	NC_020430	ATA	5	36823	36837	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45635146
100	NC_020430	TCTT	3	36981	36991	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	45635146
101	NC_020430	TAA	4	37054	37065	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635146
102	NC_020430	TAA	4	38013	38024	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635146
103	NC_020430	AAAT	3	38035	38045	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45635146
104	NC_020430	TAT	4	38083	38095	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45635146
105	NC_020430	TAAA	3	39345	39356	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45635146
106	NC_020430	TAAA	3	39431	39441	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45635146
107	NC_020430	CATC	3	40451	40462	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	45635146
108	NC_020430	AGG	4	40620	40631	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	45635146
109	NC_020430	TTTA	3	40747	40759	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	45635146
110	NC_020430	TAAA	3	40778	40788	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45635146
111	NC_020430	TTAA	3	41411	41421	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45635146
112	NC_020430	TTTA	3	41461	41472	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45635146
113	NC_020430	GTA	4	42497	42508	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45635146
114	NC_020430	A	13	42645	42657	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	45635146
115	NC_020430	TTAAA	3	42847	42861	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	45635146
116	NC_020430	TAT	4	43300	43310	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45635146
117	NC_020430	TTA	4	44182	44194	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45635146
118	NC_020430	TTTA	3	44228	44238	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45635146
119	NC_020430	ATA	4	46480	46491	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635146
120	NC_020430	TA	6	46580	46590	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45635146
121	NC_020430	TAA	5	47186	47200	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45635146
122	NC_020430	GAATT	3	47514	47527	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	45635146
123	NC_020430	ATA	4	47909	47919	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45635146
124	NC_020430	TTTAT	3	48361	48374	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	45635146
125	NC_020430	T	12	48558	48569	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	45635146
126	NC_020430	TTTTA	3	48797	48810	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	45635146
127	NC_020430	AATA	4	48831	48846	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	45635146
128	NC_020430	TA	6	48967	48978	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45635146
129	NC_020430	T	12	50033	50044	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	45635146
130	NC_020430	TTAT	3	50831	50841	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45635146
131	NC_020430	TTA	4	51019	51030	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_020430	T	15	51544	51558	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
133	NC_020430	AAG	4	51902	51913	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_020430	AT	8	52153	52168	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
135	NC_020430	AATT	3	52393	52405	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45635146
136	NC_020430	ATT	4	52512	52522	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45635146
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138	NC_020430	AATAAA	3	53017	53035	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	45635146
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144	NC_020430	TA	7	55449	55461	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45635146
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149	NC_020430	T	15	56667	56681	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
150	NC_020430	AAAT	3	56750	56761	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_020430	TAA	4	57084	57095	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	45635146
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168	NC_020430	AAAT	3	69025	69036	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45635146
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174	NC_020430	TAA	4	71131	71142	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
175	NC_020430	C	12	72337	72348	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_020430	AAAT	3	73958	73968	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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204	NC_020430	TAATA	3	88187	88201	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	45635150
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231	NC_020430	TAT	4	98622	98633	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635146
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238	NC_020430	T	12	102439	102450	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_020430	G	17	102750	102766	17	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_020430	G	17	102778	102794	17	0 %	0 %	100 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ceratocystis cacaofunesta mitochondrion