ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Delias hyparete mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020428	ATTT	3	454	464	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45635142
2	NC_020428	TAT	4	617	628	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635142
3	NC_020428	ATTA	3	806	816	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45635142
4	NC_020428	TAAATT	3	919	936	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	45635142
5	NC_020428	ATTT	3	948	959	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45635142
6	NC_020428	CTTT	3	965	976	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	45635142
7	NC_020428	ATT	4	1017	1029	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45635142
8	NC_020428	AT	8	1045	1059	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	45635142
9	NC_020428	TTA	4	1084	1094	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45635142
10	NC_020428	TTAAAA	3	1156	1173	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	45635142
11	NC_020428	CTTT	3	1196	1207	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	45635142
12	NC_020428	TTTA	3	1241	1252	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45635142
13	NC_020428	TCT	7	2008	2028	21	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45635142
14	NC_020428	AGG	4	2101	2112	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	45635142
15	NC_020428	GAAA	3	2220	2231	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	45635142
16	NC_020428	ATA	4	2831	2842	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635142
17	NC_020428	TTAA	3	3319	3331	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45635142
18	NC_020428	T	24	3883	3906	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	45635143
19	NC_020428	ATTT	3	4348	4360	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	45635143
20	NC_020428	AATT	3	4366	4376	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45635143
21	NC_020428	ATT	4	4595	4605	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45635143
22	NC_020428	TAAT	3	4681	4692	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	45635143
23	NC_020428	ATT	5	4838	4851	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45635143
24	NC_020428	AAT	5	5146	5161	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45635143
25	NC_020428	AT	7	5489	5501	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_020428	TAT	4	5841	5851	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45635143
27	NC_020428	ATT	4	6330	6341	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635143
28	NC_020428	ATT	4	6374	6386	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45635143
29	NC_020428	ATAA	3	6518	6529	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45635143
30	NC_020428	TAT	4	6662	6673	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45635143
31	NC_020428	ATA	4	6751	6762	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635143
32	NC_020428	AAAT	3	6901	6912	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45635143
33	NC_020428	TAAA	4	7523	7537	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	45635143
34	NC_020428	ATTC	3	7553	7563	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	45635143
35	NC_020428	AATATA	3	7986	8003	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	45635143
36	NC_020428	TAT	7	8027	8049	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_020428	TTTAA	4	8095	8113	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
38	NC_020428	TAAA	3	8151	8162	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45635143
39	NC_020428	ATA	4	8186	8198	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45635143
40	NC_020428	AAAT	3	9027	9037	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45635143
41	NC_020428	CAAA	3	9113	9123	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	45635143
42	NC_020428	TAA	4	9171	9182	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635143
43	NC_020428	AT	8	9571	9585	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	45635143
44	NC_020428	ATT	5	9843	9856	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_020428	ATTTT	4	10018	10037	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	45635143
46	NC_020428	T	14	10158	10171	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	45635143
47	NC_020428	ATTT	3	10236	10246	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45635143
48	NC_020428	T	14	10671	10684	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	45635143
49	NC_020428	GTT	4	10756	10767	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	45635143
50	NC_020428	TAA	4	10772	10783	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635143
51	NC_020428	ATTT	3	10994	11004	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45635143
52	NC_020428	CT	7	11927	11939	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	45635143
53	NC_020428	AATTAA	4	12061	12085	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45635143
54	NC_020428	A	15	12226	12240	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	45635143
55	NC_020428	TAAAT	4	12245	12264	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	45635143
56	NC_020428	TAA	4	12265	12275	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45635143
57	NC_020428	AAT	5	12325	12338	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45635143
58	NC_020428	ATT	4	12700	12710	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_020428	ATT	4	13346	13356	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_020428	TTA	4	13378	13389	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_020428	AAAT	3	13426	13438	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_020428	TTAA	3	13589	13599	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_020428	TATT	3	14711	14722	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_020428	TAAAA	3	14730	14744	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_020428	TTTA	3	14803	14814	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_020428	T	23	14833	14855	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_020428	TTTC	5	14890	14908	19	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
68	NC_020428	TA	6	15006	15018	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_020428	AT	8	15083	15098	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Delias hyparete mitochondrion