ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pavlova lutheri chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020371	ATT	4	3346	3357	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45606197
2	NC_020371	GAA	4	6755	6766	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45606208
3	NC_020371	AAG	4	8747	8758	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45606198
4	NC_020371	TGC	4	9277	9287	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	45606198
5	NC_020371	TAA	4	12331	12342	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	45606199
6	NC_020371	TTA	4	19193	19204	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_020371	CTT	4	19810	19820	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45606200
8	NC_020371	TAG	4	22451	22462	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606200
9	NC_020371	CTT	4	24893	24904	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45606200
10	NC_020371	CAA	4	27880	27891	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45606200
11	NC_020371	TCA	11	28236	28268	33	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	45606208
12	NC_020371	ATT	4	28440	28451	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45606208
13	NC_020371	TCT	4	28488	28499	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45606208
14	NC_020371	CTT	4	31630	31641	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45606201
15	NC_020371	TAA	4	36600	36610	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45606202
16	NC_020371	ATT	4	37345	37356	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45606202
17	NC_020371	TAC	5	39612	39626	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	45606203
18	NC_020371	ATT	4	42066	42076	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45606203
19	NC_020371	CTG	4	43427	43438	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45606203
20	NC_020371	ATT	4	50585	50595	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45606204
21	NC_020371	TAG	4	52558	52569	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606204
22	NC_020371	AAG	4	57474	57485	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45606204
23	NC_020371	ATT	4	60814	60825	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_020371	ATT	4	65131	65141	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45606205
25	NC_020371	AAT	4	71268	71279	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45606206
26	NC_020371	AGA	4	73395	73405	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	45606206
27	NC_020371	AAC	4	75620	75631	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45606206
28	NC_020371	ATA	4	78978	78988	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_020371	GCT	4	80190	80201	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45606207
30	NC_020371	GCA	4	81145	81156	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45606207
31	NC_020371	AAG	4	81410	81420	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	45606207
32	NC_020371	AAT	4	82279	82290	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_020371	ACA	4	86396	86408	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	45606207
34	NC_020371	GTA	4	92046	92057	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606208
35	NC_020371	TTC	4	93309	93320	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pavlova lutheri chloroplast