ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ministeria vibrans mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020370	ATT	4	239	249	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_020370	TACTT	5	319	342	24	20 %	60 %	0 %	20 %	4 %	Non-Coding
3	NC_020370	TA	7	651	664	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_020370	TA	6	786	798	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_020370	TTA	4	842	853	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_020370	CTTT	3	1046	1056	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_020370	TAT	4	1780	1790	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284996
8	NC_020370	CTTTT	3	1992	2005	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	45284996
9	NC_020370	TAT	6	2038	2055	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	45284996
10	NC_020370	TTTAT	3	2111	2124	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	45284996
11	NC_020370	AGAA	3	2595	2606	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	45284996
12	NC_020370	GAA	4	2622	2633	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284996
13	NC_020370	TCTT	4	3071	3086	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	45284996
14	NC_020370	TCT	4	3157	3168	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284996
15	NC_020370	ATT	4	3173	3183	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284996
16	NC_020370	AT	6	3308	3318	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284996
17	NC_020370	TTC	4	3663	3673	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284996
18	NC_020370	TAT	4	3771	3782	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284996
19	NC_020370	TTTA	3	3850	3862	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	45284996
20	NC_020370	TCT	11	3958	3990	33	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284996
21	NC_020370	TCT	4	4810	4821	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284996
22	NC_020370	ATCT	3	4959	4969	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	45284996
23	NC_020370	ATTTTT	3	4998	5016	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	45284996
24	NC_020370	TTGA	3	5046	5057	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	45284996
25	NC_020370	TAT	4	5343	5356	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284996
26	NC_020370	TAT	4	5507	5518	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_020370	CTTT	4	6841	6856	16	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	45284996
28	NC_020370	TTTTTA	3	7041	7059	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	45284996
29	NC_020370	TCT	4	7122	7132	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284996
30	NC_020370	TTTC	4	7471	7485	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	45284996
31	NC_020370	TCT	4	7563	7575	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	45284996
32	NC_020370	AT	6	7718	7728	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284996
33	NC_020370	TATTT	3	8396	8409	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	45284996
34	NC_020370	ATT	4	8522	8534	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284996
35	NC_020370	TTC	4	8621	8635	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	45284996
36	NC_020370	TTTAA	3	8703	8716	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	45284996
37	NC_020370	TAT	4	8915	8927	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284996
38	NC_020370	ATTT	4	8999	9014	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	45284996
39	NC_020370	TTTCTT	3	9039	9056	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	45284996
40	NC_020370	TCT	4	9243	9254	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284996
41	NC_020370	ATTT	3	9638	9649	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45284996
42	NC_020370	TTTA	3	10001	10011	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284996
43	NC_020370	TAT	4	10331	10341	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284996
44	NC_020370	TCT	4	10365	10376	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284996
45	NC_020370	TTC	4	10403	10414	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284996
46	NC_020370	TTTATT	4	10789	10812	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	45284996
47	NC_020370	ATACTT	3	11207	11224	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	45284996
48	NC_020370	TTTA	3	11236	11247	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45284996
49	NC_020370	ATTT	3	11306	11316	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284996
50	NC_020370	TTTC	3	11428	11438	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	45284996
51	NC_020370	ATC	4	11587	11597	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	45284996
52	NC_020370	TAT	8	11911	11936	26	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284996
53	NC_020370	TTTA	3	11971	11983	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	45284996
54	NC_020370	TAT	6	12012	12029	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	45284996
55	NC_020370	CTTT	3	13120	13130	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	45284996
56	NC_020370	TCT	4	13436	13446	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284996
57	NC_020370	TTC	4	13455	13465	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284996
58	NC_020370	TTTC	3	13559	13570	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	45284996
59	NC_020370	TCT	5	13828	13842	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	45284996
60	NC_020370	TCT	5	13846	13860	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	45284996
61	NC_020370	TTTAT	4	13909	13927	19	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	45284996
62	NC_020370	TCT	4	14269	14281	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	45284996
63	NC_020370	TAT	4	14361	14372	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284996
64	NC_020370	TCTA	3	14382	14392	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	45284996
65	NC_020370	CTT	4	14441	14451	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284996
66	NC_020370	TCT	4	14755	14765	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284996
67	NC_020370	TTTA	3	15127	15137	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_020370	TAAT	3	15316	15328	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_020370	ATT	4	15351	15361	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_020370	CTTT	3	15661	15671	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	45284997
71	NC_020370	TTTTA	3	15761	15774	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	45284997
72	NC_020370	TTTTA	3	15994	16007	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_020370	ATTT	3	16109	16119	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_020370	CTTT	3	16537	16548	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	45284997
75	NC_020370	TAA	4	17151	17162	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284997
76	NC_020370	ATTC	3	17884	17894	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	45284997
77	NC_020370	CTT	4	18021	18032	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45284997
78	NC_020370	ATAA	3	18289	18300	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45284997
79	NC_020370	TAT	4	18570	18580	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284997
80	NC_020370	ATTT	4	18612	18628	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	45284997
81	NC_020370	CATTTT	3	18638	18656	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	45284997
82	NC_020370	TTA	4	18765	18776	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284997
83	NC_020370	CTTTCT	4	19524	19547	24	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284997
84	NC_020370	TTC	4	19952	19962	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284997
85	NC_020370	ATTT	3	20031	20041	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284997
86	NC_020370	TTTCA	3	20065	20079	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	45284997
87	NC_020370	ATTT	3	20101	20111	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284997
88	NC_020370	CTT	4	20532	20542	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284997
89	NC_020370	CTT	4	20783	20794	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284997
90	NC_020370	ATTT	3	21013	21023	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284997
91	NC_020370	TCAAAT	3	21033	21050	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	45284997
92	NC_020370	ATT	4	21236	21246	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284997
93	NC_020370	TTA	4	21362	21373	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284997
94	NC_020370	ATT	4	21778	21789	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284997
95	NC_020370	TAT	5	21811	21825	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_020370	TCA	4	23012	23023	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45284997
97	NC_020370	ATA	5	24225	24239	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45284997
98	NC_020370	T	14	25929	25942	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	45284997
99	NC_020370	TATTTA	3	26227	26244	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
100	NC_020370	TTTATC	3	26261	26278	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
101	NC_020370	TTTTA	3	26602	26615	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_020370	AGGAA	3	27349	27362	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	45284997
103	NC_020370	TCTT	5	27631	27651	21	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	45284997
104	NC_020370	ATT	4	28112	28122	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284997
105	NC_020370	TAT	4	28636	28647	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284997
106	NC_020370	ATT	5	28816	28831	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45284997
107	NC_020370	TTA	4	28848	28859	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284997
108	NC_020370	TTA	4	29168	29179	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284997
109	NC_020370	ATA	4	29321	29332	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_020370	ATA	4	29571	29582	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_020370	TTAT	3	29915	29927	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	45284997
112	NC_020370	TAA	4	29953	29963	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284997
113	NC_020370	TTA	4	31161	31172	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_020370	AAT	5	32287	32301	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
115	NC_020370	TTTAAA	4	32548	32571	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_020370	AAAT	3	32747	32758	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_020370	AAT	5	33153	33168	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45284997
118	NC_020370	AAAT	3	33169	33179	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_020370	AATA	4	33180	33194	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_020370	ATA	4	33192	33203	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_020370	GTA	4	35405	35415	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45284998
122	NC_020370	TTA	4	35623	35634	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	45284998
123	NC_020370	TCA	4	36469	36480	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
124	NC_020370	AT	6	37064	37074	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_020370	AAAT	3	37542	37553	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_020370	AAT	4	37578	37588	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_020370	AAT	4	37686	37697	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_020370	AT	6	38228	38238	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_020370	AAT	4	39324	39335	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284998
130	NC_020370	TAT	4	40231	40241	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284998
131	NC_020370	CTAA	4	40552	40566	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
132	NC_020370	AAT	4	41257	41268	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284998
133	NC_020370	ATT	4	41269	41280	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284998
134	NC_020370	AAT	4	41636	41647	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284998
135	NC_020370	AAGA	3	42098	42108	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	45284998
136	NC_020370	AAAT	3	42439	42451	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	45284998
137	NC_020370	TA	6	42585	42596	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45284998
138	NC_020370	AT	6	42605	42615	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284998
139	NC_020370	ATG	7	42741	42761	21	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45284998
140	NC_020370	ATG	5	42774	42788	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	45284998
141	NC_020370	ATG	5	42792	42806	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	45284998
142	NC_020370	ATG	5	42810	42824	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	45284998
143	NC_020370	ATG	18	42810	42863	54	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45284998
144	NC_020370	ATA	4	42861	42872	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284998
145	NC_020370	ATG	4	42885	42896	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45284998
146	NC_020370	ATA	4	42909	42920	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284998
147	NC_020370	ATTAGT	12	44275	44346	72	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
148	NC_020370	TA	6	44373	44383	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_020370	AAAT	3	44631	44642	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
150	NC_020370	TAAATT	3	44643	44660	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
151	NC_020370	GAAA	3	44744	44754	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	45284998
152	NC_020370	ATA	4	44917	44928	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284998
153	NC_020370	AGAA	3	45128	45139	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	45284998
154	NC_020370	AATT	3	45402	45412	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284998
155	NC_020370	TAAAAA	3	45527	45545	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
156	NC_020370	A	13	46217	46229	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
157	NC_020370	GAA	4	46269	46279	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
158	NC_020370	A	14	46663	46676	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
159	NC_020370	TAA	4	46690	46700	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
160	NC_020370	ATA	4	46869	46881	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284998
161	NC_020370	AAT	4	46896	46906	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284998
162	NC_020370	AAAGA	3	47073	47088	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	45284998
163	NC_020370	AATT	3	47325	47336	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45284999
164	NC_020370	TA	6	47400	47410	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284999
165	NC_020370	AATT	3	48320	48332	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45284999
166	NC_020370	GAAA	3	48608	48620	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	45284999
167	NC_020370	AGA	4	48862	48873	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284999
168	NC_020370	AAT	4	49063	49073	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284999
169	NC_020370	TAA	4	49318	49329	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284999
170	NC_020370	TTAA	3	49719	49730	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45284999
171	NC_020370	A	13	50284	50296	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	45284999
172	NC_020370	ATA	4	50547	50557	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284999
173	NC_020370	TAA	5	50818	50831	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284999
174	NC_020370	ATAAA	3	50886	50899	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	45284999
175	NC_020370	AAAT	3	50991	51002	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45284999
176	NC_020370	GAAA	3	51275	51286	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	45284999
177	NC_020370	AAAT	3	51509	51520	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45284999
178	NC_020370	TAA	4	51894	51905	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284999
179	NC_020370	TAA	4	51996	52007	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284999
180	NC_020370	ATT	4	52015	52026	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284999
181	NC_020370	AAAT	4	52398	52412	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	45284999
182	NC_020370	AAG	4	53145	53156	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284999
183	NC_020370	AAAAG	3	53173	53187	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	45284999
184	NC_020370	AAGA	3	53669	53680	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	45284999
185	NC_020370	GAAA	3	54091	54101	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	45284999
186	NC_020370	AGA	5	54176	54190	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	45284999
187	NC_020370	TAA	4	54200	54210	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284999
188	NC_020370	AAGA	4	54285	54300	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	45284999
189	NC_020370	TAA	4	55066	55077	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
190	NC_020370	AT	7	55123	55136	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
191	NC_020370	AT	6	55258	55269	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
192	NC_020370	AAAG	3	55348	55359	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
193	NC_020370	AAGTA	5	55577	55600	24	60 %	20 %	20 %	0 %	4 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ministeria vibrans mitochondrion