ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cantharellus cibarius mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020368	TTA	4	751	762	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020368	TAT	4	869	881	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_020368	TAG	4	2667	2678	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_020368	TTA	4	3659	3671	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_020368	ACA	4	5183	5194	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45284988
6	NC_020368	TAT	4	8289	8300	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_020368	TTA	5	8917	8931	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_020368	ATT	5	9038	9051	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_020368	TAT	4	9471	9482	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284988
10	NC_020368	TTC	4	12301	12312	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284989
11	NC_020368	TTA	4	13091	13102	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_020368	AAT	4	13104	13115	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020368	TAT	4	14311	14322	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284989
14	NC_020368	ATT	4	14654	14665	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284989
15	NC_020368	ATA	4	14864	14875	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_020368	AAT	4	15716	15726	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284989
17	NC_020368	ATA	5	15833	15847	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45284989
18	NC_020368	TAT	4	16740	16752	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_020368	TGA	4	16825	16835	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_020368	AAT	4	17128	17138	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_020368	TAT	4	20581	20592	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284989
22	NC_020368	AGT	4	21062	21072	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45284989
23	NC_020368	TAT	4	21676	21687	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284989
24	NC_020368	TAA	4	21733	21744	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284989
25	NC_020368	TAT	4	26058	26068	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284989
26	NC_020368	ATT	4	28979	28989	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_020368	TAT	4	29699	29709	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284989
28	NC_020368	ATT	5	29743	29757	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45284989
29	NC_020368	ATA	4	31718	31729	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_020368	TTA	4	35479	35489	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_020368	TAA	4	35735	35747	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284991
32	NC_020368	TAT	4	38666	38677	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284991
33	NC_020368	TAA	4	40721	40732	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284991
34	NC_020368	TAT	6	41369	41385	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	45284991
35	NC_020368	TTA	4	41888	41898	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284991
36	NC_020368	TAA	4	44541	44552	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284991
37	NC_020368	ATC	4	45911	45922	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45284991
38	NC_020368	ATT	4	46366	46376	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_020368	ATT	4	46542	46552	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_020368	TAT	4	47418	47429	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_020368	ATA	5	47457	47471	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_020368	TTA	4	48480	48491	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_020368	ATA	4	49123	49133	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_020368	CTT	4	51734	51746	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	45284991
45	NC_020368	TAT	4	56717	56727	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_020368	TAT	5	57134	57147	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_020368	TAA	4	57304	57315	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_020368	TAT	5	57992	58007	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45284991
49	NC_020368	ATT	4	58304	58315	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_020368	TTA	4	58639	58649	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284991

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cantharellus cibarius mitochondrion