ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cantharellus cibarius mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020368	TTA	4	751	762	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020368	AAGGA	3	787	801	15	60 %	0 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020368	TAT	4	869	881	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_020368	AATT	3	989	999	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_020368	GAAA	3	1996	2006	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	45284988
6	NC_020368	TTATAT	3	2058	2076	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	45284988
7	NC_020368	AT	7	2440	2453	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45284988
8	NC_020368	TAG	4	2667	2678	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_020368	TTA	4	3659	3671	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_020368	TGAC	3	4780	4791	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_020368	GATA	3	4857	4868	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_020368	ACA	4	5183	5194	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45284988
13	NC_020368	TTTA	3	7548	7559	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_020368	TA	6	7853	7865	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_020368	AATTT	3	7937	7951	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_020368	CACT	4	7963	7978	16	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
17	NC_020368	GTGA	4	8029	8043	15	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_020368	TAT	4	8289	8300	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_020368	TGAG	3	8536	8547	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_020368	TTA	5	8917	8931	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_020368	ATT	5	9038	9051	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_020368	AT	9	9143	9159	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
23	NC_020368	TAT	4	9471	9482	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284988
24	NC_020368	ATTT	3	10030	10042	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	45284988
25	NC_020368	TA	10	11399	11419	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_020368	TTC	4	12301	12312	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284989
27	NC_020368	TTA	4	13091	13102	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_020368	AAT	4	13104	13115	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020368	TTAATT	3	13233	13250	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
30	NC_020368	TGAG	3	13368	13379	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_020368	TA	6	13619	13629	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_020368	TAT	4	14311	14322	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284989
33	NC_020368	ATT	4	14654	14665	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284989
34	NC_020368	AATT	4	14758	14772	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_020368	ATA	4	14864	14875	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_020368	AAAAT	3	15554	15568	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	45284989
37	NC_020368	AAT	4	15716	15726	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284989
38	NC_020368	ATA	5	15833	15847	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45284989
39	NC_020368	CTTA	3	16438	16448	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	45284989
40	NC_020368	TAT	4	16740	16752	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_020368	TTAT	4	16760	16775	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_020368	TGA	4	16825	16835	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_020368	C	13	16851	16863	13	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020368	AAT	4	17128	17138	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_020368	TG	6	17307	17318	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_020368	TTAT	3	17711	17722	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_020368	AT	6	18039	18050	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_020368	ATAA	5	19110	19129	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
49	NC_020368	GCTATT	3	19432	19450	19	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
50	NC_020368	TTATA	3	20068	20081	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_020368	TCAC	3	20225	20236	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
52	NC_020368	AATAT	4	20506	20524	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
53	NC_020368	TA	7	20522	20534	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_020368	TAT	4	20581	20592	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284989
55	NC_020368	AGT	4	21062	21072	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45284989
56	NC_020368	TTAA	3	21319	21329	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284989
57	NC_020368	GGTG	3	21485	21496	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_020368	TAT	4	21676	21687	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284989
59	NC_020368	TAA	4	21733	21744	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284989
60	NC_020368	TTTA	3	22744	22754	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284989
61	NC_020368	TTATTT	3	23931	23948	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	45284989
62	NC_020368	ATTA	3	24403	24413	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_020368	TA	7	24481	24493	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_020368	CTAAC	3	24801	24814	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
65	NC_020368	TA	6	24885	24895	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_020368	ACAA	3	24926	24937	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
67	NC_020368	AT	6	25237	25247	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284989
68	NC_020368	TAT	4	26058	26068	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284989
69	NC_020368	TATAT	3	26969	26982	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	45284989
70	NC_020368	ATTT	3	27019	27029	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284989
71	NC_020368	CACT	4	27355	27370	16	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
72	NC_020368	TTATA	3	28175	28188	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_020368	TTAA	3	28451	28461	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_020368	TTATAT	3	28927	28944	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
75	NC_020368	ATT	4	28979	28989	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_020368	TAT	4	29699	29709	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284989
77	NC_020368	ATT	5	29743	29757	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45284989
78	NC_020368	ATA	4	31718	31729	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_020368	AAGT	3	31856	31868	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_020368	TTTC	3	32253	32263	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	45284990
81	NC_020368	AT	7	35107	35119	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_020368	TTA	4	35479	35489	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_020368	TAA	4	35735	35747	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284991
84	NC_020368	GTTAT	3	35748	35762	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	45284991
85	NC_020368	TA	7	36315	36328	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45284991
86	NC_020368	ATTA	4	36758	36772	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	45284991
87	NC_020368	TAT	4	38666	38677	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284991
88	NC_020368	ATTT	4	38726	38740	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	45284991
89	NC_020368	AAAT	3	39244	39255	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45284991
90	NC_020368	TAA	4	40721	40732	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284991
91	NC_020368	GTTA	3	40961	40971	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	45284991
92	NC_020368	CCAC	3	41239	41250	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	45284991
93	NC_020368	TAT	6	41369	41385	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	45284991
94	NC_020368	TTA	4	41888	41898	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284991
95	NC_020368	TTAA	3	42388	42399	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45284991
96	NC_020368	TAA	4	44541	44552	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284991
97	NC_020368	ATC	4	45911	45922	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45284991
98	NC_020368	ATT	4	46366	46376	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_020368	ATT	4	46542	46552	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_020368	TAT	4	47418	47429	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_020368	ATA	5	47457	47471	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_020368	AT	6	47948	47958	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_020368	TTA	4	48480	48491	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_020368	ATTC	3	48637	48648	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
105	NC_020368	GGTG	3	48794	48805	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_020368	ATA	4	49123	49133	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_020368	CTTTA	3	49353	49366	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	45284991
108	NC_020368	CTT	4	51734	51746	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	45284991
109	NC_020368	TAGA	3	52427	52437	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	45284991
110	NC_020368	CT	6	53317	53327	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	45284991
111	NC_020368	ACTT	3	53519	53530	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	45284991
112	NC_020368	AAAG	3	54060	54070	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	45284991
113	NC_020368	TA	7	54341	54354	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45284991
114	NC_020368	TA	6	54833	54844	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45284991
115	NC_020368	TCTA	3	55894	55905	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	45284991
116	NC_020368	TAT	4	56717	56727	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_020368	T	13	57052	57064	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_020368	ATATT	3	57089	57103	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
119	NC_020368	TAT	5	57134	57147	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_020368	TAA	4	57304	57315	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_020368	ATCA	3	57852	57864	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	45284991
122	NC_020368	TATTTA	3	57966	57982	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	45284991
123	NC_020368	TAT	5	57992	58007	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45284991
124	NC_020368	TTTA	3	58065	58076	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_020368	ATT	4	58304	58315	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_020368	TTA	4	58639	58649	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284991

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All Imperfect Repeats of Cantharellus cibarius mitochondrion