ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Dasypogon bromeliifolius plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020367	TAT	6	1715	1731	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_020367	CTT	4	1954	1965	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45606186
3	NC_020367	ATA	4	3739	3749	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_020367	TAT	4	8554	8564	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_020367	CAA	4	9071	9082	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_020367	TAT	4	9267	9279	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_020367	TAT	4	10484	10495	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_020367	TAA	4	14184	14194	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_020367	TTA	6	16222	16239	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_020367	TTA	5	17092	17107	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_020367	TCT	4	22836	22846	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45606187
12	NC_020367	GTT	4	24279	24290	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	45606187
13	NC_020367	TAT	4	28154	28164	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_020367	ATA	5	30986	30999	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_020367	TAT	5	31691	31704	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_020367	CAT	5	32962	32975	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
17	NC_020367	TTA	4	33702	33713	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020367	TTA	4	33819	33832	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_020367	TAA	4	37981	37992	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_020367	AAT	4	38006	38016	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_020367	ATA	4	38037	38047	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_020367	AAT	4	38061	38071	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_020367	ATT	4	38070	38082	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_020367	AAT	4	38099	38109	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_020367	ATG	4	40582	40592	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45606188
26	NC_020367	GCA	4	42480	42491	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45606188
27	NC_020367	AGT	4	47702	47713	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606188
28	NC_020367	TAT	8	52686	52708	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
29	NC_020367	TAA	4	52908	52919	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_020367	TAG	4	56458	56469	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606189
31	NC_020367	ATT	5	61305	61320	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_020367	AAT	4	61408	61418	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_020367	ATA	7	61436	61457	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_020367	TTC	4	69437	69447	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_020367	TGA	6	71811	71829	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10 %	45606193
36	NC_020367	TAA	4	72766	72776	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45606193
37	NC_020367	TCC	4	80325	80336	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	45606193
38	NC_020367	ATA	4	81030	81041	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45606193
39	NC_020367	GTT	4	83312	83323	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	45606193
40	NC_020367	AAT	4	83863	83877	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45606193
41	NC_020367	TAT	5	84482	84495	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45606193
42	NC_020367	TAT	4	84502	84514	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45606193
43	NC_020367	TTA	5	84516	84531	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45606193
44	NC_020367	TAT	4	85781	85791	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45606193
45	NC_020367	CTT	4	86904	86915	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45606193
46	NC_020367	GAT	4	88751	88761	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45606193
47	NC_020367	GAT	4	91794	91805	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606193
48	NC_020367	TGA	4	93509	93520	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606193
49	NC_020367	TAC	4	101301	101312	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45606193
50	NC_020367	ATT	4	113149	113161	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45606194
51	NC_020367	TAT	4	116587	116597	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45606194
52	NC_020367	TGA	4	120263	120274	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606194
53	NC_020367	TTC	5	122661	122675	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	45606194
54	NC_020367	TAT	4	122943	122954	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	45606194
55	NC_020367	TTC	4	130013	130024	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45606194
56	NC_020367	GTA	4	142837	142848	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606194
57	NC_020367	ATC	4	152344	152355	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45606194
58	NC_020367	ATC	4	155388	155398	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Dasypogon bromeliifolius plastid