ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Dasypogon bromeliifolius plastid

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_020367AAGT38248341150 %25 %25 %0 %9 %45606186
2NC_020367CAAG3157315831150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
3NC_020367TAT6171517311733.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
4NC_020367AAAT3173217431275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_020367CTT419541965120 %66.67 %0 %33.33 %8 %45606186
6NC_020367A132372238413100 %0 %0 %0 %7 %45606186
7NC_020367TCTTT327442758150 %80 %0 %20 %6 %45606186
8NC_020367GATGG3289329061420 %20 %60 %0 %7 %45606186
9NC_020367ATAAAA3308931061883.33 %16.67 %0 %0 %5 %45606186
10NC_020367TGAA3318331931150 %25 %25 %0 %9 %45606186
11NC_020367ATA4373937491166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
12NC_020367AAAT3427442851275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
13NC_020367AACAA3473347461480 %0 %0 %20 %7 %Non-Coding
14NC_020367CTTT348644875120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
15NC_020367TCTCT350425055140 %60 %0 %40 %7 %45606186
16NC_020367GAAA3557055821375 %0 %25 %0 %7 %45606186
17NC_020367TCTA4607660911625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
18NC_020367GAAGA3710571181460 %0 %40 %0 %7 %Non-Coding
19NC_020367ATCTA3717771911540 %40 %0 %20 %0 %Non-Coding
20NC_020367GA6807880891250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
21NC_020367ATTTTT3827182891916.67 %83.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
22NC_020367TAT4855485641133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
23NC_020367AT9861786331750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
24NC_020367CAA4907190821266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
25NC_020367ATTATA3916391811950 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
26NC_020367TTATT3918291971620 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
27NC_020367TTAC3920992211325 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
28NC_020367AT6925792691350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
29NC_020367TAT4926792791333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
30NC_020367A149428944114100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
31NC_020367TAT410484104951233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
32NC_020367TTTA313091131021225 %75 %0 %0 %0 %45606187
33NC_020367AATT314121141321250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
34NC_020367TAA414184141941166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
35NC_020367CATT314643146541225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
36NC_020367AT614798148121550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
37NC_020367TA814861148751550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
38NC_020367TTA616222162391833.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
39NC_020367CTTTT31697416987140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
40NC_020367TTA517092171071633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
41NC_020367AT917155171711750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
42NC_020367TCAA317435174461250 %25 %0 %25 %8 %45606187
43NC_020367T121911119122120 %100 %0 %0 %8 %45606187
44NC_020367T131921719229130 %100 %0 %0 %7 %45606187
45NC_020367GA619875198861250 %0 %50 %0 %8 %45606187
46NC_020367TCT42283622846110 %66.67 %0 %33.33 %9 %45606187
47NC_020367GTT42427924290120 %66.67 %33.33 %0 %8 %45606187
48NC_020367T122690026911120 %100 %0 %0 %8 %45606187
49NC_020367GAAA326925269371375 %0 %25 %0 %7 %45606187
50NC_020367CATA327670276811250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
51NC_020367TAT428154281641133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
52NC_020367A16286442865916100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
53NC_020367TA730612306241350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
54NC_020367TTTA330654306651225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
55NC_020367TTAGA330948309621540 %40 %20 %0 %6 %Non-Coding
56NC_020367ATA530986309991466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
57NC_020367TAT531691317041433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
58NC_020367CAT532962329751433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
59NC_020367GAAC333125331361250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
60NC_020367AGTAAA333216332331866.67 %16.67 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
61NC_020367TA833350333641550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
62NC_020367TTA433702337131233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
63NC_020367TTA433819338321433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
64NC_020367GAAA336099361101275 %0 %25 %0 %8 %45606188
65NC_020367AG637245372551150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
66NC_020367ACTA337394374061350 %25 %0 %25 %7 %Non-Coding
67NC_020367TC63785837868110 %50 %0 %50 %9 %45606188
68NC_020367TAA437981379921266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
69NC_020367AAT438006380161166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
70NC_020367ATA438037380471166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
71NC_020367AAT438061380711166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
72NC_020367ATT438070380821333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
73NC_020367AAT438099381091166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
74NC_020367AT1138217382362050 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
75NC_020367ATG440582405921133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %45606188
76NC_020367AAGA341676416871275 %0 %25 %0 %8 %45606188
77NC_020367AATG342075420861250 %25 %25 %0 %8 %45606188
78NC_020367GCA442480424911233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %45606188
79NC_020367TG64251742527110 %50 %50 %0 %9 %45606188
80NC_020367ATTTAG444117441402433.33 %50 %16.67 %0 %8 %Non-Coding
81NC_020367CCAA344306443161150 %0 %0 %50 %9 %Non-Coding
82NC_020367TTAA344319443301250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
83NC_020367TTTC34520445215120 %75 %0 %25 %8 %45606188
84NC_020367TAGAG346674466881540 %20 %40 %0 %0 %Non-Coding
85NC_020367ATTT346761467721225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
86NC_020367TC64711847129120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
87NC_020367AGT447702477131233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606188
88NC_020367TCTA448503485171525 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
89NC_020367TTATAT349377493941833.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
90NC_020367TTCTA350163501761420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
91NC_020367TATAAT352470524881950 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
92NC_020367TATAAT352668526841750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
93NC_020367TAT852686527082333.33 %66.67 %0 %0 %4 %Non-Coding
94NC_020367TAA452908529191266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
95NC_020367TTTC35295252962110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
96NC_020367TAG456458564691233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606189
97NC_020367TGCA358165581771325 %25 %25 %25 %7 %45606189
98NC_020367AGTGAT359750597671833.33 %33.33 %33.33 %0 %5 %45606189
99NC_020367ATT561305613201633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
100NC_020367AAT461408614181166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
101NC_020367ATA761436614572266.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
102NC_020367TA661460614711250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
103NC_020367AGAT361486614961150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
104NC_020367CATA361723617331150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
105NC_020367TTATTT363020630361716.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
106NC_020367AATG363875638861250 %25 %25 %0 %0 %45606189
107NC_020367TCCT36664066651120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
108NC_020367AAAGT367016670291460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
109NC_020367CATATA368537685551950 %33.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
110NC_020367TATTT368713687261420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
111NC_020367TAGTT468727687451920 %60 %20 %0 %10 %Non-Coding
112NC_020367AAAT368771687811175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
113NC_020367GAAA369086690971275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
114NC_020367TTC46943769447110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
115NC_020367GAAA369687696981275 %0 %25 %0 %8 %45606190
116NC_020367AT669784697951250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
117NC_020367AATA369920699311275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
118NC_020367TTAATC370422704381733.33 %50 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
119NC_020367AAAT371094711041175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
120NC_020367TGA671811718291933.33 %33.33 %33.33 %0 %10 %45606193
121NC_020367AAGAA372229722421480 %0 %20 %0 %7 %45606193
122NC_020367TAA472766727761166.67 %33.33 %0 %0 %9 %45606193
123NC_020367CCTATA373559735771933.33 %33.33 %0 %33.33 %5 %45606193
124NC_020367ATAAA374383743971580 %20 %0 %0 %0 %45606193
125NC_020367ATTT376006760171225 %75 %0 %0 %8 %45606193
126NC_020367CTTGA376039760531520 %40 %20 %20 %6 %45606193
127NC_020367GAATA377058770711460 %20 %20 %0 %7 %45606193
128NC_020367TTTCT37994879961140 %80 %0 %20 %7 %45606193
129NC_020367A13799697998113100 %0 %0 %0 %7 %45606193
130NC_020367TTTCTT38023380251190 %83.33 %0 %16.67 %10 %45606193
131NC_020367TCC48032580336120 %33.33 %0 %66.67 %8 %45606193
132NC_020367ATA481030810411266.67 %33.33 %0 %0 %8 %45606193
133NC_020367TTCT38185181862120 %75 %0 %25 %8 %45606193
134NC_020367TTTC38269082701120 %75 %0 %25 %8 %45606193
135NC_020367TATTTA382837828551933.33 %66.67 %0 %0 %5 %45606193
136NC_020367GAAA383270832801175 %0 %25 %0 %9 %45606193
137NC_020367AGAA383293833041275 %0 %25 %0 %8 %45606193
138NC_020367GTT48331283323120 %66.67 %33.33 %0 %8 %45606193
139NC_020367AAT483863838771566.67 %33.33 %0 %0 %6 %45606193
140NC_020367TAT584482844951433.33 %66.67 %0 %0 %7 %45606193
141NC_020367TAT484502845141333.33 %66.67 %0 %0 %7 %45606193
142NC_020367TTA584516845311633.33 %66.67 %0 %0 %6 %45606193
143NC_020367TTCT38464984660120 %75 %0 %25 %8 %45606193
144NC_020367TAT485781857911133.33 %66.67 %0 %0 %9 %45606193
145NC_020367CTT48690486915120 %66.67 %0 %33.33 %8 %45606193
146NC_020367GAT488751887611133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %45606193
147NC_020367TTCT39045290462110 %75 %0 %25 %9 %45606193
148NC_020367GAT491794918051233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606193
149NC_020367GA692207922171150 %0 %50 %0 %9 %45606193
150NC_020367TGAT393458934701325 %50 %25 %0 %7 %45606193
151NC_020367TGA493509935201233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606193
152NC_020367AATA394377943891375 %25 %0 %0 %7 %45606193
153NC_020367TTTC39443994450120 %75 %0 %25 %8 %45606193
154NC_020367CTAATT396332963481733.33 %50 %0 %16.67 %5 %45606193
155NC_020367TCTA396631966421225 %50 %0 %25 %8 %45606193
156NC_020367TA797159971711350 %50 %0 %0 %7 %45606193
157NC_020367TCCGG39740197415150 %20 %40 %40 %6 %45606193
158NC_020367CTTT39985299864130 %75 %0 %25 %7 %45606193
159NC_020367TTTGTT3100416100434190 %83.33 %16.67 %0 %10 %45606193
160NC_020367TAC41013011013121233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %45606193
161NC_020367TATAT51023981024222540 %60 %0 %0 %8 %45606194
162NC_020367ATCC31057131057241225 %25 %0 %50 %8 %45606194
163NC_020367TCTA31061021061131225 %50 %0 %25 %8 %45606194
164NC_020367GAGG31089611089721225 %0 %75 %0 %8 %45606194
165NC_020367AGGT31091731091841225 %25 %50 %0 %8 %45606194
166NC_020367TAAG31102931103031150 %25 %25 %0 %9 %45606194
167NC_020367AGGG31106451106561225 %0 %75 %0 %8 %45606194
168NC_020367GGAA31123451123551150 %0 %50 %0 %9 %45606194
169NC_020367ATT41131491131611333.33 %66.67 %0 %0 %7 %45606194
170NC_020367TTTA31131911132011125 %75 %0 %0 %9 %45606194
171NC_020367AATT31153641153751250 %50 %0 %0 %8 %45606194
172NC_020367TA71154601154721350 %50 %0 %0 %7 %45606194
173NC_020367GCATAA31156121156291850 %16.67 %16.67 %16.67 %5 %45606194
174NC_020367TA81156661156801550 %50 %0 %0 %6 %45606194
175NC_020367AAAT31163261163361175 %25 %0 %0 %9 %45606194
176NC_020367CTAA31164321164431250 %25 %0 %25 %0 %45606194
177NC_020367TATTGA31164521164752433.33 %50 %16.67 %0 %8 %45606194
178NC_020367TAT41165871165971133.33 %66.67 %0 %0 %9 %45606194
179NC_020367ATTT31178981179091225 %75 %0 %0 %8 %45606194
180NC_020367AATTAA31179101179281966.67 %33.33 %0 %0 %10 %45606194
181NC_020367AT71193511193641450 %50 %0 %0 %7 %45606194
182NC_020367ATTCTA31201121201291833.33 %50 %0 %16.67 %5 %45606194
183NC_020367ATAG31201491201601250 %25 %25 %0 %8 %45606194
184NC_020367TGA41202631202741233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606194
185NC_020367TTGA31202921203031225 %50 %25 %0 %0 %45606194
186NC_020367TAAA31212021212141375 %25 %0 %0 %7 %45606194
187NC_020367TATT31213601213711225 %75 %0 %0 %8 %45606194
188NC_020367AAAG31214581214681175 %0 %25 %0 %9 %45606194
189NC_020367TTC5122661122675150 %66.67 %0 %33.33 %6 %45606194
190NC_020367TAT41229431229541233.33 %66.67 %0 %0 %0 %45606194
191NC_020367AAAAT31260691260821480 %20 %0 %0 %7 %45606194
192NC_020367TCAA31269451269551150 %25 %0 %25 %9 %45606194
193NC_020367CATT31282381282491225 %50 %0 %25 %0 %45606194
194NC_020367ATTG31285681285791225 %50 %25 %0 %8 %45606194
195NC_020367ATGT31286471286581225 %50 %25 %0 %8 %45606194
196NC_020367T12128785128796120 %100 %0 %0 %8 %45606194
197NC_020367TTCA31289391289511325 %50 %0 %25 %7 %45606194
198NC_020367TC6129241129251110 %50 %0 %50 %9 %45606194
199NC_020367TTC4130013130024120 %66.67 %0 %33.33 %8 %45606194
200NC_020367ATTTT31301561301701520 %80 %0 %0 %6 %45606194
201NC_020367GTTTC3131154131167140 %60 %20 %20 %7 %45606194
202NC_020367TTCC3131794131804110 %50 %0 %50 %9 %45606194
203NC_020367CCCT3133493133504120 %25 %0 %75 %8 %45606194
204NC_020367CTTA31338461338561125 %50 %0 %25 %9 %45606194
205NC_020367GGAT31384251384361225 %25 %50 %0 %8 %45606194
206NC_020367ACTAAT41417171417382250 %33.33 %0 %16.67 %9 %45606194
207NC_020367AAAT31423021423131275 %25 %0 %0 %8 %45606194
208NC_020367GTA41428371428481233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606194
209NC_020367AAAG31442851442971375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
210NC_020367ACCGG31467331467471520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
211NC_020367TA111467941468132050 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
212NC_020367AT71469771469891350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
213NC_020367TAGA31475071475181250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
214NC_020367GAAA31496991497101275 %0 %25 %0 %8 %45606194
215NC_020367ATCA31506791506911350 %25 %0 %25 %7 %45606194
216NC_020367TGAT31507741507861325 %50 %25 %0 %7 %45606194
217NC_020367TC6151932151942110 %50 %0 %50 %9 %45606194
218NC_020367ATC41523441523551233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %45606194
219NC_020367TATT31535591535701225 %75 %0 %0 %8 %45606194
220NC_020367ATC41553881553981133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
221NC_020367CATT31574461574561125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding