ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Bismarckia nobilis plastid

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_020366AATATA352691866.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
2NC_020366TACT31041151225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
3NC_020366TAA41201301166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
4NC_020366AAGT39659751150 %25 %25 %0 %9 %45606175
5NC_020366AT6146214731250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_020366AGA4161216231266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
7NC_020366TTC419681979120 %66.67 %0 %33.33 %8 %45606175
8NC_020366TTTG321052116120 %75 %25 %0 %8 %45606175
9NC_020366ACT5260526191533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %45606175
10NC_020366TCTTT327632777150 %80 %0 %20 %6 %45606175
11NC_020366GAAA3277927891175 %0 %25 %0 %9 %45606175
12NC_020366ATAAAA3311431311883.33 %16.67 %0 %0 %5 %45606175
13NC_020366GTAT4349035041525 %50 %25 %0 %6 %Non-Coding
14NC_020366AT6352135321250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
15NC_020366A173753376917100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
16NC_020366AAAT3427542861275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
17NC_020366ATCT3468646971225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
18NC_020366C1350295041130 %0 %0 %100 %0 %Non-Coding
19NC_020366TCTCT352395252140 %60 %0 %40 %7 %45606175
20NC_020366AGAA3546754781275 %0 %25 %0 %8 %45606175
21NC_020366TTTG357435753110 %75 %25 %0 %9 %45606175
22NC_020366TCTA4630163161625 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
23NC_020366A137131714313100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
24NC_020366GAA4763276431266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
25NC_020366A158283829715100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
26NC_020366GA6856385741250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
27NC_020366TATAAC3904390591750 %33.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
28NC_020366TTTA3906590771325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
29NC_020366AAAT3922392331175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
30NC_020366T1295869597120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_020366TA710021100361650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
32NC_020366GAAA310163101731175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
33NC_020366TATTTG512657126852916.67 %66.67 %16.67 %0 %10 %45606175
34NC_020366TAA413804138141166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
35NC_020366TTTC31440314414120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
36NC_020366CATT314419144301225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
37NC_020366AT614593146041250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
38NC_020366AT814622146361550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
39NC_020366GTATTT314884149011816.67 %66.67 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
40NC_020366AACT315791158021250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
41NC_020366TTATT416821168391920 %80 %0 %0 %5 %Non-Coding
42NC_020366AATC316872168821150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
43NC_020366TCAA317185171961250 %25 %0 %25 %8 %45606176
44NC_020366AT620322203321150 %50 %0 %0 %9 %45606176
45NC_020366TCT42258922599110 %66.67 %0 %33.33 %9 %45606176
46NC_020366TTCA323070230811225 %50 %0 %25 %8 %45606176
47NC_020366T122308523096120 %100 %0 %0 %0 %45606176
48NC_020366GTT42403324044120 %66.67 %33.33 %0 %8 %45606176
49NC_020366GAAAA326681266951580 %0 %20 %0 %6 %45606176
50NC_020366ATGTA327439274531540 %40 %20 %0 %0 %Non-Coding
51NC_020366AATA328376283861175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
52NC_020366TGG42928129292120 %33.33 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
53NC_020366ATCA329651296611150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
54NC_020366A16298682988316100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
55NC_020366TTTTAT329897299131716.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
56NC_020366TAAT329998300081150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
57NC_020366A15301123012615100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
58NC_020366TA630352303641350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
59NC_020366TCT43112331135130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
60NC_020366ATT431827318371133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
61NC_020366ATC432306323171233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
62NC_020366ATTT332420324301125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
63NC_020366TAAA332659326701275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
64NC_020366CATT332729327401225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
65NC_020366TA733426334381350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
66NC_020366GAAA335103351141275 %0 %25 %0 %8 %45606176
67NC_020366TTTA336076360861125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
68NC_020366AG636210362201150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
69NC_020366GTTC33623936249110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
70NC_020366AT636449364591150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
71NC_020366ATA436971369821266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
72NC_020366TTACT337006370201520 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
73NC_020366AT1137065370842050 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
74NC_020366CATTA337388374011440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
75NC_020366ATT438010380211233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
76NC_020366ATG439502395121133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %45606176
77NC_020366AAGA340596406071275 %0 %25 %0 %8 %45606177
78NC_020366AATG340995410061250 %25 %25 %0 %8 %45606177
79NC_020366GCA441400414111233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %45606177
80NC_020366TATTT342736427501520 %80 %0 %0 %0 %Non-Coding
81NC_020366TTAA343227432381250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
82NC_020366TTAA343581435931350 %50 %0 %0 %7 %45606177
83NC_020366AAGAA343762437751480 %0 %20 %0 %7 %45606177
84NC_020366T124407644087120 %100 %0 %0 %8 %45606177
85NC_020366TTTC34411544126120 %75 %0 %25 %8 %45606177
86NC_020366AGT446589466001233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606177
87NC_020366GAAT346962469741350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
88NC_020366ATTAT347389474041640 %60 %0 %0 %6 %Non-Coding
89NC_020366ATTT447545475601625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
90NC_020366TAAGA347623476371560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
91NC_020366AT647783477941250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
92NC_020366TTGA348055480671325 %50 %25 %0 %7 %Non-Coding
93NC_020366AT1048366483862150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
94NC_020366TA649157491681250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
95NC_020366CTTTTT34924049258190 %83.33 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
96NC_020366A22493274934822100 %0 %0 %0 %4 %Non-Coding
97NC_020366T145171051723140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
98NC_020366TCTCTA351796518141916.67 %50 %0 %33.33 %10 %Non-Coding
99NC_020366TAAAAT351822518391866.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
100NC_020366AAAAAG351865518811783.33 %0 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
101NC_020366GAAAA352086521001580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
102NC_020366AAAT352124521341175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
103NC_020366AATAT352143521561460 %40 %0 %0 %7 %Non-Coding
104NC_020366TTGTT35263452647140 %80 %20 %0 %7 %Non-Coding
105NC_020366AATC352944529551250 %25 %0 %25 %0 %Non-Coding
106NC_020366TTTTTA353266532841916.67 %83.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
107NC_020366CTTA458786588011625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
108NC_020366C145921359226140 %0 %0 %100 %0 %Non-Coding
109NC_020366A13592275923913100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
110NC_020366AAAT360065600751175 %25 %0 %0 %9 %45606177
111NC_020366AAAAT361153611671580 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
112NC_020366AAATAA361215612321883.33 %16.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
113NC_020366TAGA361386613971250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
114NC_020366A15629416295515100 %0 %0 %0 %6 %45606178
115NC_020366AATG363618636291250 %25 %25 %0 %0 %45606178
116NC_020366AT1065570655881950 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
117NC_020366TTTCA367098671121520 %60 %0 %20 %0 %Non-Coding
118NC_020366A13675146752613100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
119NC_020366ATTT367625676361225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
120NC_020366TTA467695677061233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
121NC_020366TTGAA368016680301540 %40 %20 %0 %6 %45606178
122NC_020366A16690516906616100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
123NC_020366TTA669582696001933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
124NC_020366TAT569599696131533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
125NC_020366TTC46974669757120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
126NC_020366GAAA369997700081275 %0 %25 %0 %8 %45606179
127NC_020366AGGAAG370042700591850 %0 %50 %0 %5 %Non-Coding
128NC_020366TTTA370148701591225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
129NC_020366TA970164701811850 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
130NC_020366TGAA370252702641350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
131NC_020366AAAT370707707171175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
132NC_020366TTTC37126771279130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
133NC_020366A12714407145112100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
134NC_020366TGA672118721361933.33 %33.33 %33.33 %0 %10 %45606181
135NC_020366TTTA372721727321225 %75 %0 %0 %8 %45606181
136NC_020366TAT573016730311633.33 %66.67 %0 %0 %6 %45606181
137NC_020366ATAA373262732731275 %25 %0 %0 %0 %45606181
138NC_020366TTTCT37349873512150 %80 %0 %20 %6 %45606181
139NC_020366TCT47354673557120 %66.67 %0 %33.33 %8 %45606181
140NC_020366A13736017361313100 %0 %0 %0 %7 %45606181
141NC_020366TTTC37744177451110 %75 %0 %25 %9 %45606181
142NC_020366AAAT377708777191275 %25 %0 %0 %8 %45606181
143NC_020366TTCT48019380207150 %75 %0 %25 %6 %45606181
144NC_020366AGA480235802461266.67 %0 %33.33 %0 %8 %45606181
145NC_020366TCC48057980590120 %33.33 %0 %66.67 %8 %45606181
146NC_020366GAG482490825011233.33 %0 %66.67 %0 %8 %45606181
147NC_020366T138297182983130 %100 %0 %0 %0 %45606181
148NC_020366ATA484124841341166.67 %33.33 %0 %0 %9 %45606181
149NC_020366ATA984152841782766.67 %33.33 %0 %0 %7 %45606181
150NC_020366ATT484181841911133.33 %66.67 %0 %0 %9 %45606181
151NC_020366TAA484203842151366.67 %33.33 %0 %0 %7 %45606181
152NC_020366TATT384269842801225 %75 %0 %0 %0 %45606181
153NC_020366TTTA584765847842025 %75 %0 %0 %5 %45606181
154NC_020366TTCT38489784908120 %75 %0 %25 %8 %45606181
155NC_020366T168511385128160 %100 %0 %0 %0 %45606181
156NC_020366GATC386070860811225 %25 %25 %25 %8 %45606181
157NC_020366TTTATA386455864721833.33 %66.67 %0 %0 %5 %45606181
158NC_020366CTT48710287113120 %66.67 %0 %33.33 %8 %45606181
159NC_020366GAT488934889441133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %45606181
160NC_020366TTCT39062990639110 %75 %0 %25 %9 %45606181
161NC_020366GAT491977919881233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606181
162NC_020366TGAT393641936531325 %50 %25 %0 %7 %45606181
163NC_020366TGA493692937031233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606181
164NC_020366AATA394530945421375 %25 %0 %0 %7 %45606181
165NC_020366TTTC39459294603120 %75 %0 %25 %8 %45606181
166NC_020366CTTA395712957221125 %50 %0 %25 %9 %45606181
167NC_020366TCTA396775967861225 %50 %0 %25 %8 %45606181
168NC_020366TCCGG39752997543150 %20 %40 %40 %6 %45606181
169NC_020366TTTGTT3100544100562190 %83.33 %16.67 %0 %10 %45606181
170NC_020366TAC41014391014501233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %45606181
171NC_020366TATTAG31025341025562333.33 %50 %16.67 %0 %8 %45606182
172NC_020366ATCC31058431058541225 %25 %0 %50 %8 %45606182
173NC_020366TCTA31062331062441225 %50 %0 %25 %8 %45606182
174NC_020366GAGG31090851090961225 %0 %75 %0 %8 %45606182
175NC_020366AGGT31092971093081225 %25 %50 %0 %8 %45606182
176NC_020366TAAG31104171104271150 %25 %25 %0 %9 %45606182
177NC_020366CT6112414112424110 %50 %0 %50 %9 %45606182
178NC_020366GGAA31124471124571150 %0 %50 %0 %9 %45606182
179NC_020366A1211349811350912100 %0 %0 %0 %8 %45606182
180NC_020366A1311592811594013100 %0 %0 %0 %7 %45606182
181NC_020366AAAATA41159421159662583.33 %16.67 %0 %0 %8 %45606182
182NC_020366AT71159621159741350 %50 %0 %0 %7 %45606182
183NC_020366ATA41159871159971166.67 %33.33 %0 %0 %9 %45606182
184NC_020366TA91160221160381750 %50 %0 %0 %5 %45606182
185NC_020366TGTTA31160411160551520 %60 %20 %0 %6 %45606182
186NC_020366AAATC31168421168551460 %20 %0 %20 %7 %45606182
187NC_020366ATT41170541170641133.33 %66.67 %0 %0 %9 %45606182
188NC_020366TAT41171661171761133.33 %66.67 %0 %0 %9 %45606182
189NC_020366TTCAAT31172991173171933.33 %50 %0 %16.67 %10 %45606182
190NC_020366CAA41199951200051166.67 %0 %0 %33.33 %9 %45606182
191NC_020366T16121898121913160 %100 %0 %0 %6 %45606182
192NC_020366ATT51220411220561633.33 %66.67 %0 %0 %6 %45606182
193NC_020366AT61235781235891250 %50 %0 %0 %8 %45606182
194NC_020366A1412376012377314100 %0 %0 %0 %7 %45606182
195NC_020366TC6125653125664120 %50 %0 %50 %8 %45606182
196NC_020366ATTC31260841260941125 %50 %0 %25 %9 %45606182
197NC_020366ATTAA31261681261811460 %40 %0 %0 %7 %45606182
198NC_020366TATT31265861265971225 %75 %0 %0 %8 %45606182
199NC_020366AT61268951269061250 %50 %0 %0 %8 %45606182
200NC_020366ATTTG31286961287101520 %60 %20 %0 %6 %45606182
201NC_020366ATA41288781288901366.67 %33.33 %0 %0 %7 %45606182
202NC_020366TCTT3129153129163110 %75 %0 %25 %9 %45606182
203NC_020366AAT41299021299121166.67 %33.33 %0 %0 %9 %45606182
204NC_020366TTCC3132273132283110 %50 %0 %50 %9 %45606182
205NC_020366AG61323061323161150 %0 %50 %0 %9 %45606182
206NC_020366GA61336181336281150 %0 %50 %0 %9 %45606182
207NC_020366CTTA31343031343131125 %50 %0 %25 %9 %45606182
208NC_020366GGAT31388761388871225 %25 %50 %0 %8 %45606182
209NC_020366ACTAAT41421731421952350 %33.33 %0 %16.67 %8 %45606182
210NC_020366AAAT31427481427591275 %25 %0 %0 %8 %45606182
211NC_020366GTA41432801432911233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606182
212NC_020366ACCGG31471861472001520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
213NC_020366TAGA31479441479551250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
214NC_020366TGAA31501261501371250 %25 %25 %0 %8 %45606183
215NC_020366TGAT31511721511841325 %50 %25 %0 %7 %45606183
216NC_020366ATC41527421527531233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %45606183
217NC_020366ATTT31539641539751225 %75 %0 %0 %8 %45606183
218NC_020366ATC41557861557961133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
219NC_020366CATT31578311578411125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding