ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Calamus caryotoides plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020365	CAG	5	726	740	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	45633087
2	NC_020365	TTC	4	1835	1846	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45633087
3	NC_020365	TAT	4	3836	3846	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_020365	AAT	4	3890	3901	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_020365	TTA	4	13109	13119	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_020365	TAA	4	13477	13487	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_020365	TCT	4	22155	22165	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45633088
8	NC_020365	GTT	4	23588	23599	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	45633088
9	NC_020365	ATA	4	27384	27395	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_020365	TCT	4	30295	30307	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
11	NC_020365	ATC	4	31521	31532	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_020365	ATA	4	36217	36228	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_020365	ATG	4	38711	38721	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45633089
14	NC_020365	GCA	4	40609	40620	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45633089
15	NC_020365	AGT	4	45794	45805	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45633089
16	NC_020365	ATT	5	50996	51009	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_020365	ATA	4	59916	59928	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_020365	CTT	5	60457	60471	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
19	NC_020365	TTA	4	60486	60498	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_020365	ATT	4	60499	60511	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_020365	ATT	4	60514	60526	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_020365	ATA	4	60616	60628	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_020365	TTA	4	66781	66792	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_020365	TAT	4	68660	68672	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_020365	TTC	4	68761	68772	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_020365	AGA	4	71612	71624	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	45633093
27	NC_020365	TAT	5	72007	72022	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45633093
28	NC_020365	TCT	4	72547	72558	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45633093
29	NC_020365	TTA	4	80317	80327	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45633093
30	NC_020365	GAG	4	81514	81525	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	45633093
31	NC_020365	TTA	4	83758	83770	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45633093
32	NC_020365	CTT	4	86228	86239	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45633093
33	NC_020365	GAT	4	88060	88070	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45633093
34	NC_020365	GAT	4	91109	91120	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45633093
35	NC_020365	TGA	4	92824	92835	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45633093
36	NC_020365	TAC	4	100577	100588	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45633093
37	NC_020365	AAT	6	114884	114900	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	45633095
38	NC_020365	ATA	5	114908	114921	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45633095
39	NC_020365	ATT	4	115958	115968	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45633095
40	NC_020365	TAT	4	116075	116085	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45633095
41	NC_020365	CTT	4	116857	116867	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45633095
42	NC_020365	AGA	4	122868	122878	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	45633095
43	NC_020365	GTT	4	123328	123338	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45633095
44	NC_020365	CTT	4	126691	126702	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45633095
45	NC_020365	GTA	4	142208	142219	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45633095
46	NC_020365	ATC	4	151676	151687	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45633095
47	NC_020365	ATC	4	154726	154736	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Calamus caryotoides plastid