ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pseudophoenix vinifera plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020364	CAG	4	766	777	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45606163
2	NC_020364	CTT	4	1882	1893	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45606163
3	NC_020364	ATA	4	3960	3970	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_020364	ACA	4	4291	4301	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_020364	AAG	5	8563	8577	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_020364	TAA	4	13779	13789	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_020364	TCT	4	22479	22489	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45606164
8	NC_020364	GTT	4	23917	23928	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	45606164
9	NC_020364	TCT	4	30490	30502	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
10	NC_020364	ATG	4	31665	31676	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_020364	ATC	4	31674	31685	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_020364	ATA	4	36390	36401	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_020364	ATG	4	38828	38838	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45606165
14	NC_020364	GCA	4	40726	40737	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45606165
15	NC_020364	AGT	4	45900	45911	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606166
16	NC_020364	ATT	4	46723	46735	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_020364	ATT	4	50809	50821	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_020364	TTA	4	50893	50903	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_020364	ATT	4	61035	61045	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_020364	TTA	4	67159	67170	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_020364	TTA	7	69059	69080	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_020364	TTC	4	69205	69216	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_020364	TGA	6	71562	71580	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10 %	45606170
24	NC_020364	TAT	5	72458	72473	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45606170
25	NC_020364	TCT	4	72986	72997	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45606170
26	NC_020364	TCC	4	80055	80066	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	45606170
27	NC_020364	GAG	4	81997	82008	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	45606170
28	NC_020364	AAT	4	83578	83589	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45606170
29	NC_020364	CTT	4	86398	86409	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45606170
30	NC_020364	GAT	4	88230	88240	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45606170
31	NC_020364	GAT	4	91264	91275	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606170
32	NC_020364	TGA	4	92979	92990	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606170
33	NC_020364	TAC	4	100746	100757	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45606170
34	NC_020364	ATA	4	115319	115331	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45606171
35	NC_020364	ATT	4	116374	116384	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45606171
36	NC_020364	TAT	4	116486	116496	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45606171
37	NC_020364	CTT	4	117265	117275	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45606171
38	NC_020364	AAT	4	120050	120060	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45606171
39	NC_020364	ATA	4	120097	120108	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45606171
40	NC_020364	ATT	5	121595	121610	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45606171
41	NC_020364	AGA	4	123302	123312	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	45606171
42	NC_020364	CTT	4	127090	127101	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45606171
43	NC_020364	ATT	7	128350	128370	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45606171
44	NC_020364	GTA	4	142809	142820	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606171
45	NC_020364	ATC	4	152291	152302	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45606172
46	NC_020364	ATC	4	155326	155336	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pseudophoenix vinifera plastid