ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Zingiber spectabile plastid

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_020363CAG47998101233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %45606153
2NC_020363TTC419621973120 %66.67 %0 %33.33 %8 %45606153
3NC_020363TCT433543366130 %66.67 %0 %33.33 %7 %45606153
4NC_020363AAT4351935301266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_020363ATA4372137331366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
6NC_020363ATT4799480051233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_020363TTA4851985291133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
8NC_020363ATT4882688361133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
9NC_020363CAA4906990791166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
10NC_020363ATA512710127241566.67 %33.33 %0 %0 %6 %45606154
11NC_020363ATA414175141861266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
12NC_020363TAC414333143431133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
13NC_020363ATA414543145551366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
14NC_020363CAA418107181181266.67 %0 %0 %33.33 %8 %45606154
15NC_020363TTA621896219131833.33 %66.67 %0 %0 %5 %45606154
16NC_020363TCT52289222905140 %66.67 %0 %33.33 %7 %45606154
17NC_020363GTT42432124332120 %66.67 %33.33 %0 %8 %45606154
18NC_020363TCA426675266851133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %45606154
19NC_020363TAT427945279561233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_020363ATT433351333621233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_020363TTG43346333475130 %66.67 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
22NC_020363TCT53375633771160 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
23NC_020363TTG43617736187110 %66.67 %33.33 %0 %9 %45606155
24NC_020363TAG437919379291133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
25NC_020363TAT438568385781133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
26NC_020363ATG440073400831133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %45606155
27NC_020363GCA441971419821233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %45606155
28NC_020363ATG442297423071133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %45606155
29NC_020363AAT446648466591266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_020363AAT449253492641266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_020363TAT452548525591233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
32NC_020363AAT452598526091266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
33NC_020363CTT45482854839120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
34NC_020363AAT461307613181266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
35NC_020363ATT461317613271133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
36NC_020363ATT761347613672133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
37NC_020363AAT461466614761166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
38NC_020363TCA463860638701133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
39NC_020363ATA466557665681266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
40NC_020363TAA466582665941366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
41NC_020363AAT568772687861566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
42NC_020363ATT568862688751433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
43NC_020363TTC47183771847110 %66.67 %0 %33.33 %9 %45606160
44NC_020363TAT572244722591633.33 %66.67 %0 %0 %6 %45606160
45NC_020363ATA480610806211266.67 %33.33 %0 %0 %8 %45606160
46NC_020363CTG48086680877120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %45606160
47NC_020363GGA481779817901233.33 %0 %66.67 %0 %8 %45606160
48NC_020363ATG485080850911233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606160
49NC_020363CTT48636286373120 %66.67 %0 %33.33 %8 %45606160
50NC_020363GGT48899589006120 %33.33 %66.67 %0 %8 %45606160
51NC_020363GAT491016910271233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606160
52NC_020363TGA492749927601233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606160
53NC_020363CAA493665936761266.67 %0 %0 %33.33 %8 %45606160
54NC_020363GAA494373943841266.67 %0 %33.33 %0 %8 %45606160
55NC_020363TAC41001221001331233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %45606160
56NC_020363GAG41109071109191333.33 %0 %66.67 %0 %7 %45606161
57NC_020363ATT41114051114161233.33 %66.67 %0 %0 %8 %45606161
58NC_020363TAA41114731114831166.67 %33.33 %0 %0 %9 %45606161
59NC_020363AAG41130631130741266.67 %0 %33.33 %0 %8 %45606161
60NC_020363ATA51150421150551466.67 %33.33 %0 %0 %7 %45606161
61NC_020363ATT41153601153701133.33 %66.67 %0 %0 %9 %45606161
62NC_020363TAA41153781153891266.67 %33.33 %0 %0 %0 %45606161
63NC_020363TAT41155001155101133.33 %66.67 %0 %0 %9 %45606161
64NC_020363CAA41184191184291166.67 %0 %0 %33.33 %9 %45606161
65NC_020363AGT41188811188921233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606161
66NC_020363TAT41191201191301133.33 %66.67 %0 %0 %9 %45606161
67NC_020363ATA41192391192511366.67 %33.33 %0 %0 %7 %45606161
68NC_020363TAT41207321207431233.33 %66.67 %0 %0 %8 %45606161
69NC_020363ATA41223751223861266.67 %33.33 %0 %0 %8 %45606161
70NC_020363GTT4122936122946110 %66.67 %33.33 %0 %9 %45606161
71NC_020363TAT51252671252811533.33 %66.67 %0 %0 %6 %45606161
72NC_020363ATA41252901253021366.67 %33.33 %0 %0 %7 %45606161
73NC_020363CTA41273241273351233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %45606161
74NC_020363TCT7128808128829220 %66.67 %0 %33.33 %9 %45606161
75NC_020363TTC4129341129352120 %66.67 %0 %33.33 %8 %45606161
76NC_020363TTC5129362129376150 %66.67 %0 %33.33 %6 %45606161
77NC_020363GTA41417101417211233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606161
78NC_020363CTT4145695145705110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
79NC_020363TCA41490831490941233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %45606161
80NC_020363ATC41508161508271233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %45606161
81NC_020363ATC41536131536231133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding