ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Heliconia collinsiana plastid

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_020362TTTA336471225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
2NC_020362CAG48318421233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %45606143
3NC_020362AAGT39379471150 %25 %25 %0 %9 %45606143
4NC_020362TTC419761987120 %66.67 %0 %33.33 %8 %45606143
5NC_020362AGAA3239124011175 %0 %25 %0 %9 %45606143
6NC_020362TCTTT327622776150 %80 %0 %20 %6 %45606143
7NC_020362A173741375717100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
8NC_020362ATTACT3439344101833.33 %50 %0 %16.67 %0 %Non-Coding
9NC_020362TCTCT351315144140 %60 %0 %40 %7 %45606143
10NC_020362TTTG356475657110 %75 %25 %0 %9 %45606143
11NC_020362ATTG3586058711225 %50 %25 %0 %0 %45606143
12NC_020362AT6708970991150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
13NC_020362ATTT3812581351125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_020362T1787648780170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
15NC_020362TTA4904990591133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
16NC_020362GA6914891591250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
17NC_020362TAAA3924892591275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
18NC_020362TCTAT9937094134420 %60 %0 %20 %9 %Non-Coding
19NC_020362ATT4951595261233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_020362A139568958013100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
21NC_020362TAAT3985998691150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
22NC_020362ATTTT310342103561520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
23NC_020362A13104211043313100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
24NC_020362AT1110448104682150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_020362TATAAT410471104922250 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
26NC_020362TTA411763117751333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
27NC_020362GAAA311877118871175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
28NC_020362TATTT314402144171620 %80 %0 %0 %6 %45606143
29NC_020362A14144301444314100 %0 %0 %0 %7 %45606143
30NC_020362TTTA315166151771225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_020362TTTC31605616067120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
32NC_020362CATT316072160831225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
33NC_020362TGCAA316214162271440 %20 %20 %20 %7 %Non-Coding
34NC_020362TAATAT316327163441850 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
35NC_020362AAT416464164751266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
36NC_020362TA816486165001550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
37NC_020362TA616510165201150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
38NC_020362TA616548165581150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
39NC_020362CTATAA416562165842350 %33.33 %0 %16.67 %8 %Non-Coding
40NC_020362ACAT316902169141350 %25 %0 %25 %7 %Non-Coding
41NC_020362TAA517068170821566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
42NC_020362CTTTTT31886118879190 %83.33 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
43NC_020362TCAA319333193441250 %25 %0 %25 %8 %45606144
44NC_020362T122099721008120 %100 %0 %0 %8 %45606144
45NC_020362T122110421115120 %100 %0 %0 %8 %45606144
46NC_020362ATT423754237651233.33 %66.67 %0 %0 %0 %45606144
47NC_020362TCT42475124761110 %66.67 %0 %33.33 %9 %45606144
48NC_020362GTT42617126182120 %66.67 %33.33 %0 %8 %45606144
49NC_020362TAG1227632276653433.33 %33.33 %33.33 %0 %5 %45606144
50NC_020362GTTCCA327766277821716.67 %33.33 %16.67 %33.33 %5 %45606144
51NC_020362GAAA328853288651375 %0 %25 %0 %7 %45606144
52NC_020362TAAA329827298381275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
53NC_020362CTAT330043300541225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
54NC_020362T123087430885120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
55NC_020362GAAA331425314361275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
56NC_020362TTTC33229232302110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
57NC_020362TA632822328331250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
58NC_020362ATA532925329391566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
59NC_020362TTTA335497355071125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
60NC_020362ATTT336412364231225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
61NC_020362TCT43647336485130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
62NC_020362TTATT336778367911420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
63NC_020362TATAAG336832368481750 %33.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
64NC_020362GAAA338520385311275 %0 %25 %0 %8 %45606144
65NC_020362TTATTT339497395141816.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
66NC_020362T163952339538160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
67NC_020362AG639645396551150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
68NC_020362TC64024740257110 %50 %0 %50 %9 %45606144
69NC_020362TTAT340264402741125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
70NC_020362AT1140417404362050 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
71NC_020362AAAT340591406011175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
72NC_020362TAG540632406471633.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
73NC_020362C244067940702240 %0 %0 %100 %4 %Non-Coding
74NC_020362ATG442819428291133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %45606145
75NC_020362AAGA343913439241275 %0 %25 %0 %8 %45606145
76NC_020362GCA444717447281233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %45606145
77NC_020362TG64475444764110 %50 %50 %0 %9 %45606145
78NC_020362TTAA346533465441250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
79NC_020362TTTC34743847449120 %75 %0 %25 %8 %45606145
80NC_020362A13484074841913100 %0 %0 %0 %7 %45606145
81NC_020362ATA450786507971266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
82NC_020362TATTAA350970509881950 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
83NC_020362AAAGAT351123511401866.67 %16.67 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
84NC_020362CAAA351455514661275 %0 %0 %25 %0 %Non-Coding
85NC_020362TTGA351547515591325 %50 %25 %0 %7 %Non-Coding
86NC_020362TA751862518741350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
87NC_020362TAGTAA452351523752550 %33.33 %16.67 %0 %8 %Non-Coding
88NC_020362ATTT355098551081125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
89NC_020362TTGTT35586355876140 %80 %20 %0 %7 %Non-Coding
90NC_020362TAA455891559011166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
91NC_020362AGA456109561191166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
92NC_020362ATT556546565601533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
93NC_020362T155655656570150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
94NC_020362AAACT356666566801560 %20 %0 %20 %6 %Non-Coding
95NC_020362TCTA359998600081125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
96NC_020362TA662148621591250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
97NC_020362ATTT362678626901325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
98NC_020362ATTT464370643851625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
99NC_020362AT1264387644102450 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
100NC_020362TACT364482644931225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
101NC_020362TATAA564510645342560 %40 %0 %0 %8 %Non-Coding
102NC_020362TTTC36470464715120 %75 %0 %25 %8 %45606146
103NC_020362ATATG364814648281540 %40 %20 %0 %6 %Non-Coding
104NC_020362CTAA665771657922250 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
105NC_020362GAAA368372683831275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
106NC_020362AAAG368580685911275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
107NC_020362AT968749687651750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
108NC_020362TATAAG369057690802450 %33.33 %16.67 %0 %8 %Non-Coding
109NC_020362TAAAA370788708011480 %20 %0 %0 %7 %Non-Coding
110NC_020362TTA470994710051233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
111NC_020362TTACTT371054710711816.67 %66.67 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
112NC_020362TTGAA371431714451540 %40 %20 %0 %6 %45606146
113NC_020362ATT471812718221133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
114NC_020362AAAG372780727901175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
115NC_020362T267314673171260 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
116NC_020362GAAA373418734291275 %0 %25 %0 %8 %45606147
117NC_020362TTTC37453974551130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
118NC_020362AAAT374694747041175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
119NC_020362TA975335753521850 %50 %0 %0 %5 %45606149
120NC_020362TGA675394754121933.33 %33.33 %33.33 %0 %10 %45606149
121NC_020362AAG475794758051266.67 %0 %33.33 %0 %8 %45606149
122NC_020362TTC47587775887110 %66.67 %0 %33.33 %9 %45606149
123NC_020362TTTA375996760071225 %75 %0 %0 %8 %45606149
124NC_020362T137607276084130 %100 %0 %0 %7 %45606149
125NC_020362TAT576281762961633.33 %66.67 %0 %0 %6 %45606149
126NC_020362A13767277673913100 %0 %0 %0 %7 %45606149
127NC_020362TTTC37676376774120 %75 %0 %25 %8 %45606149
128NC_020362TTTC37727677286110 %75 %0 %25 %9 %45606149
129NC_020362TTTAT377637776511520 %80 %0 %0 %6 %45606149
130NC_020362AT880579805931550 %50 %0 %0 %6 %45606149
131NC_020362A12809838099412100 %0 %0 %0 %8 %45606149
132NC_020362AAAG381080810901175 %0 %25 %0 %9 %45606149
133NC_020362AGAAAA383504835211883.33 %0 %16.67 %0 %5 %45606149
134NC_020362TTTCTT38376283780190 %83.33 %0 %16.67 %10 %45606149
135NC_020362TCC48385483865120 %33.33 %0 %66.67 %8 %45606149
136NC_020362ATACTA384559845751750 %33.33 %0 %16.67 %5 %45606149
137NC_020362GAG485743857541233.33 %0 %66.67 %0 %8 %45606149
138NC_020362TAA487371873811166.67 %33.33 %0 %0 %9 %45606149
139NC_020362TATAGA387471874891950 %33.33 %16.67 %0 %5 %45606149
140NC_020362TAT487872878841333.33 %66.67 %0 %0 %7 %45606149
141NC_020362TTCT38798287993120 %75 %0 %25 %8 %45606149
142NC_020362T148822788240140 %100 %0 %0 %0 %45606149
143NC_020362CTT48955289563120 %66.67 %0 %33.33 %8 %45606149
144NC_020362CTT49030490315120 %66.67 %0 %33.33 %8 %45606149
145NC_020362GAT492140921501133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %45606149
146NC_020362TTTA392993930041225 %75 %0 %0 %8 %45606149
147NC_020362TTCT39381193821110 %75 %0 %25 %9 %45606149
148NC_020362GAT495153951641233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606149
149NC_020362GA695578955881150 %0 %50 %0 %9 %45606149
150NC_020362TGAT396826968381325 %50 %25 %0 %7 %45606149
151NC_020362TGA496877968881233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606149
152NC_020362AATA397721977331375 %25 %0 %0 %7 %45606149
153NC_020362TTTC39778397794120 %75 %0 %25 %8 %45606149
154NC_020362TTGA398604986161325 %50 %25 %0 %7 %45606149
155NC_020362TCCGG3100716100730150 %20 %40 %40 %6 %45606149
156NC_020362TTTGTT3103717103735190 %83.33 %16.67 %0 %10 %45606149
157NC_020362TAC41046121046231233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %45606149
158NC_020362ATCC31090581090691225 %25 %0 %50 %8 %45606151
159NC_020362TCTA31094471094581225 %50 %0 %25 %8 %45606151
160NC_020362GAGG31122941123051225 %0 %75 %0 %8 %45606151
161NC_020362AGGT31125061125171225 %25 %50 %0 %8 %45606151
162NC_020362CATT31150771150871125 %50 %0 %25 %9 %45606151
163NC_020362GGAA31156481156581150 %0 %50 %0 %9 %45606151
164NC_020362TAAT41166181166341750 %50 %0 %0 %5 %45606151
165NC_020362ATA41166851166961266.67 %33.33 %0 %0 %8 %45606151
166NC_020362AGTT31183181183281125 %50 %25 %0 %9 %45606151
167NC_020362AAAT31192701192801175 %25 %0 %0 %9 %45606151
168NC_020362TTAA31193781193891250 %50 %0 %0 %8 %45606151
169NC_020362CGTAA31194921195061540 %20 %20 %20 %6 %45606151
170NC_020362AT91195251195421850 %50 %0 %0 %5 %45606151
171NC_020362TA91202041202201750 %50 %0 %0 %5 %45606151
172NC_020362TTAA31205331205431150 %50 %0 %0 %9 %45606151
173NC_020362ATT41205731205831133.33 %66.67 %0 %0 %9 %45606151
174NC_020362TAT41206841206941133.33 %66.67 %0 %0 %9 %45606151
175NC_020362CTT4121487121497110 %66.67 %0 %33.33 %9 %45606151
176NC_020362CAA41235971236071166.67 %0 %0 %33.33 %9 %45606151
177NC_020362CAA41242181242281166.67 %0 %0 %33.33 %9 %45606151
178NC_020362TAA41244001244121366.67 %33.33 %0 %0 %7 %45606151
179NC_020362ATA41245281245421566.67 %33.33 %0 %0 %6 %45606151
180NC_020362AAT51245391245541666.67 %33.33 %0 %0 %6 %45606151
181NC_020362ATTTT31247471247621620 %80 %0 %0 %6 %45606151
182NC_020362ATTT41252841252981525 %75 %0 %0 %6 %45606151
183NC_020362GTA41255351255451133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %45606151
184NC_020362TTAA31259921260041350 %50 %0 %0 %7 %45606151
185NC_020362ATT41260601260701133.33 %66.67 %0 %0 %9 %45606151
186NC_020362ATAA41279251279401675 %25 %0 %0 %6 %45606151
187NC_020362GTT4128357128367110 %66.67 %33.33 %0 %9 %45606151
188NC_020362GAAT31284041284141150 %25 %25 %0 %9 %45606151
189NC_020362ATTC31302531302631125 %50 %0 %25 %9 %45606151
190NC_020362CTTTT3130627130640140 %80 %0 %20 %7 %45606151
191NC_020362TAT41306791306891133.33 %66.67 %0 %0 %9 %45606151
192NC_020362ATA41319591319711366.67 %33.33 %0 %0 %7 %45606151
193NC_020362TAA41321891322001266.67 %33.33 %0 %0 %8 %45606151
194NC_020362CATT31327671327781225 %50 %0 %25 %0 %45606151
195NC_020362TATTAG31330051330221833.33 %50 %16.67 %0 %5 %45606151
196NC_020362T12133403133414120 %100 %0 %0 %8 %45606151
197NC_020362AAAT31335461335571275 %25 %0 %0 %8 %45606151
198NC_020362AAAAAT31342951343111783.33 %16.67 %0 %0 %5 %45606151
199NC_020362TTCC3136188136198110 %50 %0 %50 %9 %45606151
200NC_020362GGAT31427771427881225 %25 %50 %0 %8 %45606151
201NC_020362A1314667914669113100 %0 %0 %0 %7 %45606151
202NC_020362TTA41468221468331233.33 %66.67 %0 %0 %8 %45606151
203NC_020362GTA41472231472341233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %45606151
204NC_020362ACCGG31511151511291520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
205NC_020362AGCA31523201523301150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
206NC_020362TCAA31532301532421350 %25 %0 %25 %7 %45606151
207NC_020362TGAA31540511540621250 %25 %25 %0 %8 %45606151
208NC_020362ATCA31550321550441350 %25 %0 %25 %7 %45606151
209NC_020362CTTT3155053155063110 %75 %0 %25 %9 %45606151
210NC_020362TGAT31551271551391325 %50 %25 %0 %7 %45606151
211NC_020362TC6156282156292110 %50 %0 %50 %9 %45606151
212NC_020362ATC41567061567171233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %45606151
213NC_020362ATTT31579221579331225 %75 %0 %0 %8 %45606151
214NC_020362ATAA31588651588761275 %25 %0 %0 %8 %45606151
215NC_020362ATC41597201597301133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
216NC_020362CATT31617581617681125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding