ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Microbotryum cf. violaceum BFL-2013 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020354	AAAAAT	4	19	43	25	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_020354	AAAAAT	5	2835	2865	31	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_020354	TTTTTC	4	5376	5399	24	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
4	NC_020354	TTTTTA	4	6459	6482	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
5	NC_020354	CTTTTT	3	6750	6767	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
6	NC_020354	AAAAAG	3	7982	8000	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	45284976
7	NC_020354	AAAAAT	4	8065	8088	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	45284976
8	NC_020354	CCTTTT	3	10362	10380	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
9	NC_020354	TAAAAA	3	10951	10969	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_020354	TTTTTA	3	11057	11074	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
11	NC_020354	TTTTTG	3	11513	11529	17	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_020354	TTATTT	3	11726	11744	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
13	NC_020354	GAAAGG	5	11983	12018	36	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_020354	TAAAAA	3	12408	12424	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_020354	TTTTTA	3	12850	12868	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
16	NC_020354	ATAAAA	3	12993	13011	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_020354	AATAAA	3	14270	14288	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
18	NC_020354	TTTATT	3	14506	14524	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
19	NC_020354	AAATAA	3	14563	14581	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
20	NC_020354	TTTTTA	3	15255	15273	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
21	NC_020354	AAAAGA	4	15549	15572	24	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_020354	TTATTT	3	16003	16021	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
23	NC_020354	CTTTTT	3	16763	16781	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
24	NC_020354	GTTTTT	5	17195	17224	30	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_020354	GTTTTT	4	17586	17609	24	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_020354	TAAAAA	3	17695	17713	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
27	NC_020354	TATTTT	3	21529	21546	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_020354	CTTTTC	3	21970	21987	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020354	AAAAGA	3	22309	22327	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
30	NC_020354	CTTTTT	3	24382	24400	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
31	NC_020354	TTTTTA	3	33166	33182	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	45284978
32	NC_020354	TTTTTA	5	33309	33339	31	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	6 %	45284978
33	NC_020354	TATTTT	4	33454	33477	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	45284978
34	NC_020354	TTTTAT	4	39952	39975	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	45284978
35	NC_020354	ATAAAA	4	41028	41052	25	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	45284978
36	NC_020354	TAGCTT	3	41938	41955	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45284978
37	NC_020354	TTTTAT	5	42753	42780	28	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	45284978
38	NC_020354	TTTTTA	3	45699	45715	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	45284978
39	NC_020354	TAAAAA	3	45737	45753	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	45284978
40	NC_020354	ATAAAA	3	47924	47942	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
41	NC_020354	TTATTT	3	49005	49022	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
42	NC_020354	TTTTTA	3	50343	50361	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
43	NC_020354	AAAAAT	3	55835	55852	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_020354	ACAAAA	3	55937	55954	18	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
45	NC_020354	TTATTT	4	57292	57316	25	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
46	NC_020354	AAATAA	3	57325	57343	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_020354	AAAATA	3	63213	63231	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
48	NC_020354	TTATTT	3	64514	64531	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
49	NC_020354	GTTTTT	3	65281	65299	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
50	NC_020354	TTTATT	3	66657	66675	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_020354	ATATTC	3	66688	66704	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
52	NC_020354	TTTTTA	3	68788	68805	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
53	NC_020354	TTTTTA	3	68945	68963	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_020354	AAATAA	3	68970	68988	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_020354	TATTTT	8	69377	69423	47	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_020354	TAAAAA	4	71245	71268	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_020354	TTTTAT	3	72104	72121	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_020354	TTTTTA	3	72402	72420	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
59	NC_020354	TTTATT	3	72453	72470	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
60	NC_020354	TTTATT	4	73623	73645	23	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_020354	AAAATA	4	73675	73698	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_020354	GTTTTT	3	73731	73749	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
63	NC_020354	TATTTT	3	74240	74257	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_020354	TTATTT	3	74392	74410	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
65	NC_020354	GAAAAG	3	74511	74528	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020354	TTTTTA	4	75987	76010	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_020354	AAATAA	3	76051	76069	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
68	NC_020354	AAAAAG	3	77640	77658	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
69	NC_020354	AAATAA	4	77722	77746	25	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_020354	AAAAAC	3	77829	77847	19	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
71	NC_020354	GTTTTT	3	78173	78190	18	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
72	NC_020354	AAAAAC	3	78622	78640	19	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
73	NC_020354	GTTTTT	3	80678	80695	18	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	45284979
74	NC_020354	ATTTTT	3	80696	80714	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	45284979
75	NC_020354	AAAAAG	3	84615	84632	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	45284979
76	NC_020354	TTTTTA	3	84873	84890	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
77	NC_020354	ATAAAA	4	84930	84954	25	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_020354	AAATAA	4	85032	85054	23	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_020354	TTTTTA	5	85560	85590	31	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_020354	TAAAAA	5	85660	85690	31	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_020354	AGGTCT	3	86484	86501	18	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
82	NC_020354	TTGTTT	4	86502	86526	25	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_020354	TATTTT	4	86687	86710	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_020354	AAATAA	3	86841	86859	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
85	NC_020354	TGTTTT	3	87449	87466	18	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
86	NC_020354	TAAAAA	3	88592	88610	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
87	NC_020354	AAAAAC	3	88700	88718	19	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
88	NC_020354	TTTTAT	3	89069	89087	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
89	NC_020354	ACAAAA	3	89306	89323	18	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
90	NC_020354	CTTTTT	3	89761	89778	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
91	NC_020354	TTATTT	3	89814	89830	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
92	NC_020354	TATTTT	4	90642	90665	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_020354	AAAAAC	3	90801	90819	19	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
94	NC_020354	TTTTAT	3	91375	91392	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
95	NC_020354	AAATAA	3	91445	91463	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
96	NC_020354	TTTATT	4	92076	92099	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Microbotryum cf. violaceum BFL-2013 mitochondrion