ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Microbotryum cf. violaceum BFL-2013 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020354	AAAAAT	4	19	43	25	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_020354	AAT	4	384	396	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_020354	CTTT	3	564	574	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
4	NC_020354	T	16	597	612	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_020354	A	15	618	632	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_020354	TAT	4	811	821	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284975
7	NC_020354	CATT	3	2391	2401	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	45284975
8	NC_020354	AAAAAT	5	2835	2865	31	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_020354	AAAT	3	2890	2901	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020354	AAAT	3	3120	3130	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_020354	TTTA	3	3512	3523	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_020354	TTTC	3	3531	3542	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
13	NC_020354	A	15	3564	3578	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_020354	A	15	4270	4284	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_020354	TTTTTC	4	5376	5399	24	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
16	NC_020354	ATTTA	3	5538	5552	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_020354	TAT	4	6076	6087	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284975
18	NC_020354	TTTTTA	4	6459	6482	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
19	NC_020354	CTTTTT	3	6750	6767	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
20	NC_020354	AAAAAG	3	7982	8000	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	45284976
21	NC_020354	TTAT	3	8031	8041	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284976
22	NC_020354	AAAAAT	4	8065	8088	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	45284976
23	NC_020354	TTATT	3	8117	8131	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_020354	TTTA	3	9874	9885	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45284976
25	NC_020354	CCTTTT	3	10362	10380	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
26	NC_020354	TA	6	10754	10764	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_020354	A	15	10902	10916	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_020354	TAAAAA	3	10951	10969	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_020354	TTTTTA	3	11057	11074	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
30	NC_020354	T	26	11132	11157	26	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_020354	AAGGG	3	11290	11303	14	40 %	0 %	60 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_020354	TTTTTG	3	11513	11529	17	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_020354	TTATTT	3	11726	11744	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_020354	GAAAGG	5	11983	12018	36	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_020354	TAAAAA	3	12408	12424	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
36	NC_020354	CTTT	4	12688	12703	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
37	NC_020354	TTTTTA	3	12850	12868	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
38	NC_020354	ATAAAA	3	12993	13011	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_020354	AAAT	3	13667	13677	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_020354	TTTC	3	13816	13826	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_020354	AATAAA	3	14270	14288	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
42	NC_020354	TTTATT	3	14506	14524	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
43	NC_020354	AAATAA	3	14563	14581	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
44	NC_020354	TTTTTA	3	15255	15273	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
45	NC_020354	TTTTA	4	15369	15389	21	20 %	80 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
46	NC_020354	AAAAGA	4	15549	15572	24	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_020354	TTATTT	3	16003	16021	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
48	NC_020354	ATA	4	16175	16186	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_020354	A	13	16403	16415	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_020354	A	16	16495	16510	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_020354	CTTTTT	3	16763	16781	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
52	NC_020354	TAAA	3	16897	16907	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_020354	ATT	4	17053	17064	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_020354	TTG	4	17082	17093	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_020354	GTTTTT	5	17195	17224	30	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_020354	GTTT	3	17497	17507	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_020354	GTTTTT	4	17586	17609	24	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_020354	TAAAAA	3	17695	17713	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
59	NC_020354	TTTA	3	17869	17879	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_020354	CAAA	3	17892	17902	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
61	NC_020354	TATT	3	18050	18061	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_020354	TTAT	3	18203	18213	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_020354	TATT	3	18231	18241	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_020354	GA	7	18827	18840	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_020354	TAT	5	18879	18894	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45284976
66	NC_020354	ACA	4	19453	19463	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	45284976
67	NC_020354	TTCG	3	20648	20660	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	45284976
68	NC_020354	TATTTT	3	21529	21546	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_020354	GGAA	4	21729	21743	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_020354	CTTTTC	3	21970	21987	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020354	AAAAGA	3	22309	22327	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
72	NC_020354	ATT	4	22631	22643	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284976
73	NC_020354	TAT	4	23687	23697	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284976
74	NC_020354	TTTA	3	24275	24285	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284976
75	NC_020354	AAAT	3	24357	24367	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45284976
76	NC_020354	CTTTTT	3	24382	24400	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
77	NC_020354	TAAA	3	24431	24441	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_020354	TAA	4	24860	24871	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_020354	ATTT	3	25241	25252	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_020354	TTTA	3	25437	25448	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_020354	GAAA	3	25637	25647	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_020354	CTC	4	27057	27068	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	45284977
83	NC_020354	TTTA	3	28637	28647	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_020354	TTTC	3	29019	29029	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
85	NC_020354	T	15	29059	29073	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_020354	GTA	4	30152	30163	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	45284978
87	NC_020354	TTTTTA	3	33166	33182	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	45284978
88	NC_020354	TTTTTA	5	33309	33339	31	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	6 %	45284978
89	NC_020354	TTTTA	3	33364	33378	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	45284978
90	NC_020354	TATTTT	4	33454	33477	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	45284978
91	NC_020354	T	16	33527	33542	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	45284978
92	NC_020354	TTAA	3	34574	34585	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45284978
93	NC_020354	TAA	4	35296	35307	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284978
94	NC_020354	GAT	4	37110	37121	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45284978
95	NC_020354	CTTT	3	38432	38443	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	45284978
96	NC_020354	TAT	4	38499	38510	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284978
97	NC_020354	ATTT	3	38673	38685	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	45284978
98	NC_020354	TTTA	3	39864	39874	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284978
99	NC_020354	TTTTAT	4	39952	39975	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	45284978
100	NC_020354	CAAA	3	40272	40282	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	45284978
101	NC_020354	ACTT	3	40809	40819	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	45284978
102	NC_020354	ATAAAA	4	41028	41052	25	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	45284978
103	NC_020354	TTTA	3	41084	41094	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284978
104	NC_020354	AT	6	41483	41493	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284978
105	NC_020354	TAGCTT	3	41938	41955	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45284978
106	NC_020354	TTTA	3	42584	42594	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284978
107	NC_020354	TTTTAT	5	42753	42780	28	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	45284978
108	NC_020354	TAATC	3	44344	44357	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	45284978
109	NC_020354	CTTT	3	44391	44401	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	45284978
110	NC_020354	AAAT	3	44873	44883	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45284978
111	NC_020354	AAAT	3	45533	45543	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45284978
112	NC_020354	TTTTTA	3	45699	45715	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	45284978
113	NC_020354	TAAAAA	3	45737	45753	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	45284978
114	NC_020354	AATTG	3	47278	47291	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	45284978
115	NC_020354	ATAAAA	3	47924	47942	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
116	NC_020354	ATTA	3	48373	48384	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45284978
117	NC_020354	ATAA	3	48907	48917	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_020354	TTATTT	3	49005	49022	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
119	NC_020354	GTAA	3	49155	49166	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_020354	GAAA	3	49589	49599	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_020354	TTTA	3	49713	49725	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_020354	TTTTTA	3	50343	50361	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
123	NC_020354	TA	8	51365	51380	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
124	NC_020354	ACTTC	3	51564	51577	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
125	NC_020354	AT	7	52549	52561	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_020354	T	18	55811	55828	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
127	NC_020354	AAAAAT	3	55835	55852	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
128	NC_020354	AATAA	3	55859	55872	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_020354	ACAAAA	3	55937	55954	18	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
130	NC_020354	AGA	4	56051	56062	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284978
131	NC_020354	AAT	4	56422	56433	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_020354	ATTA	3	57023	57034	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020354	TTATTT	4	57292	57316	25	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
134	NC_020354	AAATAA	3	57325	57343	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
135	NC_020354	AAAATA	3	63213	63231	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
136	NC_020354	TTTA	3	63317	63327	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_020354	AAAT	3	63385	63395	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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240	NC_020354	AAATAA	3	91445	91463	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
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242	NC_020354	TTAT	3	91624	91634	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
243	NC_020354	TTTATT	4	92076	92099	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Microbotryum cf. violaceum BFL-2013 mitochondrion