ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Microbotryum lychnidis-dioicae strain MvSl135HT1 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020353	TTC	4	1218	1229	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_020353	TAT	4	1419	1430	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020353	TAA	11	2781	2812	32	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_020353	TTC	4	10425	10436	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284970
5	NC_020353	TAT	4	11464	11475	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_020353	TAG	4	12670	12681	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_020353	TAA	4	15939	15949	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284970
8	NC_020353	AGG	4	16839	16849	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	45284971
9	NC_020353	CTA	4	22358	22368	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	45284971
10	NC_020353	TCC	4	22574	22584	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	45284971
11	NC_020353	ATT	4	23206	23218	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284971
12	NC_020353	CTA	4	30035	30046	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45284971
13	NC_020353	AGT	4	33145	33155	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_020353	ATA	4	34582	34593	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284971
15	NC_020353	ATA	4	37768	37780	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_020353	TTA	4	41131	41143	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284971
17	NC_020353	CAA	4	44775	44785	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	45284971
18	NC_020353	AAG	4	47137	47148	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_020353	ACT	4	48075	48086	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45284971
20	NC_020353	TAA	4	48728	48739	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284971
21	NC_020353	GCT	4	51124	51135	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_020353	TAT	4	51828	51838	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284972
23	NC_020353	TAT	4	55649	55659	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_020353	GAA	4	56866	56877	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284972
25	NC_020353	ACT	4	58941	58952	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45284972
26	NC_020353	AAT	5	63792	63805	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284972
27	NC_020353	GAA	4	65392	65406	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	45284972
28	NC_020353	AAG	4	67066	67076	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_020353	AGA	5	67714	67728	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_020353	ATT	4	67822	67833	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020353	TTA	4	69472	69483	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_020353	TAA	4	69603	69613	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_020353	TAA	4	77922	77934	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_020353	TTA	4	80177	80188	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_020353	ACA	4	81326	81336	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	45284973
36	NC_020353	TAA	4	84126	84137	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_020353	TAT	4	86076	86087	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284974
38	NC_020353	ATT	4	86486	86497	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_020353	TAT	4	94702	94712	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_020353	ATA	4	96925	96936	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284974
41	NC_020353	ATG	4	97975	97985	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45284975
42	NC_020353	TAT	4	104216	104226	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_020353	ATA	4	106147	106158	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_020353	ATA	4	106582	106592	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284975

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Microbotryum lychnidis-dioicae strain MvSl135HT1 mitochondrion