ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Microbotryum lychnidis-dioicae strain MvSl135HT1 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020353	T	13	71	83	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_020353	AAAGG	3	561	576	16	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_020353	TTC	4	1218	1229	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_020353	TAT	4	1419	1430	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020353	T	18	1555	1572	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_020353	A	14	2526	2539	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_020353	TAA	11	2781	2812	32	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_020353	T	23	3023	3045	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_020353	T	15	3047	3061	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_020353	TA	6	3236	3246	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_020353	T	12	3906	3917	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_020353	TCGT	3	4326	4337	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
13	NC_020353	A	16	4366	4381	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	45284970
14	NC_020353	CAAA	3	4826	4837	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	45284970
15	NC_020353	G	12	6202	6213	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_020353	T	27	7003	7029	27	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_020353	ATTT	4	7408	7423	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_020353	AAAAAG	3	7511	7529	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_020353	ATTT	3	7673	7685	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_020353	TAAT	3	9672	9683	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020353	TTC	4	10425	10436	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284970
22	NC_020353	CTTT	3	11442	11453	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020353	TAT	4	11464	11475	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_020353	AT	6	11667	11678	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_020353	TGTT	14	11862	11916	55	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_020353	AT	7	12122	12134	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_020353	TATT	4	12584	12599	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_020353	TAG	4	12670	12681	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_020353	ACTA	3	12852	12863	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020353	TA	7	12940	12953	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_020353	T	14	13191	13204	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020353	ATAA	3	13245	13256	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_020353	A	13	13771	13783	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_020353	TG	6	15173	15184	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_020353	TTTTC	3	15337	15350	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
36	NC_020353	TTTA	3	15584	15594	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_020353	AAATAA	3	15775	15792	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
38	NC_020353	TAGT	3	15903	15913	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	45284970
39	NC_020353	TAA	4	15939	15949	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284970
40	NC_020353	AGG	4	16839	16849	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	45284971
41	NC_020353	T	12	17059	17070	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	45284971
42	NC_020353	TAAAAA	3	18554	18570	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	45284971
43	NC_020353	AAAG	3	18825	18835	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	45284971
44	NC_020353	A	13	20062	20074	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	45284971
45	NC_020353	T	22	21264	21285	22	0 %	100 %	0 %	0 %	9 %	45284971
46	NC_020353	AAAAAG	3	21450	21467	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	45284971
47	NC_020353	A	13	21544	21556	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	45284971
48	NC_020353	TTATT	3	22154	22167	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	45284971
49	NC_020353	ATAAA	4	22216	22235	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	45284971
50	NC_020353	CTA	4	22358	22368	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	45284971
51	NC_020353	TCC	4	22574	22584	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	45284971
52	NC_020353	A	14	22779	22792	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	45284971
53	NC_020353	TA	6	23133	23143	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284971
54	NC_020353	ATT	4	23206	23218	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284971
55	NC_020353	TTATT	4	23557	23576	20	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	45284971
56	NC_020353	AAAT	3	24292	24302	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45284971
57	NC_020353	TAAA	3	24787	24799	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	45284971
58	NC_020353	GA	6	24813	24823	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	45284971
59	NC_020353	TTTA	3	25189	25199	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284971
60	NC_020353	ATTT	3	25995	26005	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284971
61	NC_020353	TG	6	29523	29533	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	45284971
62	NC_020353	CTA	4	30035	30046	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45284971
63	NC_020353	TGTT	3	30170	30182	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	45284971
64	NC_020353	GGGAA	4	30964	30983	20	40 %	0 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020353	A	29	31502	31530	29	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_020353	AGT	4	33145	33155	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_020353	TAAA	3	33500	33511	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45284971
68	NC_020353	ATTTTT	3	33766	33784	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	45284971
69	NC_020353	TAAA	4	33977	33992	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	45284971
70	NC_020353	ATA	4	34582	34593	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284971
71	NC_020353	AACT	3	34616	34626	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	45284971
72	NC_020353	AT	6	34871	34882	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_020353	ATTTT	5	34956	34980	25	20 %	80 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_020353	TTTA	3	35259	35270	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_020353	CTTT	3	35547	35557	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
76	NC_020353	TTCT	3	35797	35807	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
77	NC_020353	AAAAT	3	35860	35874	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020353	CAGA	3	37011	37022	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
79	NC_020353	AAAT	3	37307	37319	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_020353	ATA	4	37768	37780	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_020353	AT	6	38811	38822	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_020353	AAAAT	4	39786	39804	19	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_020353	TAAA	3	40450	40461	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_020353	TTTTA	6	40514	40544	31	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_020353	AAAAAT	3	40550	40566	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
86	NC_020353	A	14	40685	40698	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_020353	TTA	4	41131	41143	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284971
88	NC_020353	TC	6	41697	41707	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	45284971
89	NC_020353	AAAT	3	42017	42027	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45284971
90	NC_020353	A	16	42193	42208	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	45284971
91	NC_020353	A	13	42223	42235	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	45284971
92	NC_020353	CAGGA	6	42715	42743	29	40 %	0 %	40 %	20 %	6 %	45284971
93	NC_020353	TTAT	3	43465	43476	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	45284971
94	NC_020353	A	13	43962	43974	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	45284971
95	NC_020353	CAA	4	44775	44785	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	45284971
96	NC_020353	AT	6	46084	46094	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284971
97	NC_020353	ATAAAA	3	46231	46248	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
98	NC_020353	ATAAAA	3	46441	46458	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
99	NC_020353	AAAAG	3	47052	47066	15	80 %	0 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020353	AAAG	3	47122	47132	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_020353	AAG	4	47137	47148	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_020353	T	14	47271	47284	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_020353	TTTTTA	3	47301	47319	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
104	NC_020353	TTCT	3	47576	47587	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
105	NC_020353	AAAT	3	47716	47726	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_020353	ATAAAA	3	47793	47811	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
107	NC_020353	ACT	4	48075	48086	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45284971
108	NC_020353	TAA	4	48728	48739	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284971
109	NC_020353	A	12	48891	48902	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_020353	A	14	48944	48957	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_020353	GGAAA	4	48953	48972	20	60 %	0 %	40 %	0 %	5 %	Non-Coding
112	NC_020353	ACTT	3	49068	49078	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
113	NC_020353	AAAT	3	49185	49195	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_020353	AAAAT	3	49196	49210	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
115	NC_020353	A	17	50569	50585	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
116	NC_020353	GCT	4	51124	51135	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
117	NC_020353	AAAT	3	51329	51340	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_020353	TATT	3	51352	51363	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_020353	TAT	4	51828	51838	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284972
120	NC_020353	CATT	3	53336	53346	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	45284972
121	NC_020353	G	12	53924	53935	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_020353	CTTTCC	3	54201	54218	18	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
123	NC_020353	CTTT	3	54552	54564	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
124	NC_020353	TTAT	3	54652	54662	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_020353	AAAAAG	3	54712	54730	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
126	NC_020353	ATTTA	3	54776	54790	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_020353	TAT	4	55649	55659	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_020353	T	18	55753	55770	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
129	NC_020353	T	14	55881	55894	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_020353	A	16	56397	56412	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
131	NC_020353	GAA	4	56866	56877	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284972
132	NC_020353	TAAAAA	3	58396	58414	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
133	NC_020353	ACT	4	58941	58952	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45284972
134	NC_020353	AAAT	3	59522	59532	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45284972
135	NC_020353	GCTG	3	60571	60582	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	45284972
136	NC_020353	A	12	60673	60684	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	45284972
137	NC_020353	ACGA	3	62361	62373	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	45284972
138	NC_020353	T	15	62464	62478	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	45284972
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203	NC_020353	ATTAA	4	85553	85571	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
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250	NC_020353	AAAATA	3	102328	102344	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	45284975
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253	NC_020353	TTAT	3	104316	104327	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
254	NC_020353	AAGA	3	104559	104570	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_020353	A	14	105549	105562	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
256	NC_020353	CTGTTT	3	105975	105992	18	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_020353	ATA	4	106147	106158	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
258	NC_020353	T	13	106529	106541	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	45284975
259	NC_020353	ATA	4	106582	106592	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284975
260	NC_020353	TATGTT	3	106820	106836	17	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Microbotryum lychnidis-dioicae strain MvSl135HT1 mitochondrion