ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Microbotryum lychnidis-dioicae strain MvSl135HT1 mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020353	TAT	4	1419	1430	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020353	T	13	1555	1567	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020353	TAA	6	2781	2798	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020353	T	13	3026	3038	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020353	T	12	3047	3058	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020353	T	14	7003	7016	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020353	TAAT	3	9672	9683	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020353	CTTT	3	11442	11453	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020353	TGTT	12	11865	11912	48	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020353	TATT	3	12584	12595	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020353	ACTA	3	12852	12863	12	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020353	T	14	13191	13204	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020353	A	13	21544	21556	13	100 %	0 %	0 %	0 %	45284971
14	NC_020353	ATTT	4	23212	23227	16	25 %	75 %	0 %	0 %	45284971
15	NC_020353	GGGAA	4	30964	30983	20	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020353	A	13	31518	31530	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020353	ATTTT	3	34966	34980	15	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020353	AAAAT	3	35860	35874	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020353	TTTTA	3	40514	40528	15	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020353	A	12	40685	40696	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020353	CAGGA	5	42715	42739	25	40 %	0 %	40 %	20 %	45284971
22	NC_020353	TTAT	3	43465	43476	12	25 %	75 %	0 %	0 %	45284971
23	NC_020353	AAAAG	3	47052	47066	15	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020353	GAAAG	4	48954	48973	20	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020353	T	13	55753	55765	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020353	TTTTAC	3	66207	66224	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020353	AATA	3	66557	66568	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020353	AGA	4	67714	67725	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020353	ATT	4	67822	67833	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020353	AAAAGA	8	68521	68568	48	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020353	G	12	68638	68649	12	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020353	CTTT	3	69043	69054	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020353	GGGAAA	8	71307	71354	48	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020353	T	12	72449	72460	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020353	TA	6	73264	73275	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020353	AAATGA	3	73723	73740	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45284973
37	NC_020353	ATGA	3	74256	74267	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020353	CATTC	3	75366	75380	15	20 %	40 %	0 %	40 %	45284973
39	NC_020353	ATTA	3	77257	77268	12	50 %	50 %	0 %	0 %	45284973
40	NC_020353	CCGGCA	3	77453	77470	18	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	45284973
41	NC_020353	GA	6	78420	78431	12	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020353	GA	8	79213	79228	16	50 %	0 %	50 %	0 %	45284973
43	NC_020353	AG	6	79298	79309	12	50 %	0 %	50 %	0 %	45284973
44	NC_020353	A	15	79960	79974	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020353	TATT	3	80803	80814	12	25 %	75 %	0 %	0 %	45284973
46	NC_020353	T	15	84340	84354	15	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020353	TC	6	85004	85015	12	0 %	50 %	0 %	50 %	45284974
48	NC_020353	TC	8	85086	85101	16	0 %	50 %	0 %	50 %	45284974
49	NC_020353	CT	6	85882	85893	12	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020353	TGCCGG	3	86844	86861	18	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	45284974
51	NC_020353	TAAT	3	87046	87057	12	50 %	50 %	0 %	0 %	45284974
52	NC_020353	GAATG	3	88934	88948	15	40 %	20 %	40 %	0 %	45284974
53	NC_020353	TCAT	3	90047	90058	12	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020353	ATTTTC	3	90570	90587	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45284974
55	NC_020353	AT	6	91038	91049	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020353	A	12	91854	91865	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020353	CTTTCC	8	92959	93006	48	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020353	GAAA	3	95259	95270	12	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020353	TATT	3	96992	97003	12	25 %	75 %	0 %	0 %	45284974
60	NC_020353	ATGA	3	97138	97149	12	50 %	25 %	25 %	0 %	45284974
61	NC_020353	T	15	97319	97333	15	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020353	TATTTT	3	97485	97502	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020353	T	13	98640	98652	13	0 %	100 %	0 %	0 %	45284975
64	NC_020353	TTTTA	3	101545	101559	15	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020353	AATA	3	102485	102496	12	75 %	25 %	0 %	0 %	45284975
66	NC_020353	AAGA	3	104559	104570	12	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020353	CTGTTT	3	105975	105992	18	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020353	T	13	106529	106541	13	0 %	100 %	0 %	0 %	45284975

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Microbotryum lychnidis-dioicae strain MvSl135HT1 mitochondrion