ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Gynaephora menyuanensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020342	TTTAT	3	133	147	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_020342	AATT	3	790	800	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284954
3	NC_020342	TATT	4	851	866	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	45284954
4	NC_020342	T	14	885	898	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	45284954
5	NC_020342	AATAT	3	899	912	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	45284954
6	NC_020342	TAATTA	4	1071	1094	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45284954
7	NC_020342	ATTA	3	1322	1333	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020342	AAATT	3	1418	1431	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_020342	AT	9	1433	1449	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_020342	AGG	4	2207	2218	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	45284954
11	NC_020342	GAAA	3	2326	2337	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	45284954
12	NC_020342	ATT	4	2942	2954	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284954
13	NC_020342	TAA	4	3526	3536	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284954
14	NC_020342	AATT	3	3817	3827	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284954
15	NC_020342	ATT	4	3946	3957	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_020342	AATT	3	4485	4495	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284955
17	NC_020342	ATT	4	4966	4976	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284955
18	NC_020342	T	13	5095	5107	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	45284955
19	NC_020342	AATT	3	5602	5612	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284955
20	NC_020342	ATT	4	5653	5664	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_020342	TAATA	3	5665	5678	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	45284955
22	NC_020342	ATT	4	5712	5723	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284955
23	NC_020342	TAT	5	5731	5746	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45284955
24	NC_020342	AAT	4	6072	6083	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_020342	AAATT	3	6210	6224	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_020342	AT	34	6305	6372	68	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_020342	AAAT	3	6448	6459	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020342	TAAA	3	6560	6571	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	45284955
29	NC_020342	ATAA	3	6723	6734	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45284955
30	NC_020342	TAAT	3	7016	7028	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45284955
31	NC_020342	AATAT	3	7089	7103	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	45284955
32	NC_020342	TTA	4	7385	7396	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284955
33	NC_020342	ATA	5	7490	7504	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	45284955
34	NC_020342	AAAT	3	7729	7739	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45284955
35	NC_020342	TAA	4	7928	7940	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284955
36	NC_020342	AATAA	3	7960	7975	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	45284955
37	NC_020342	A	17	8209	8225	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	45284955
38	NC_020342	AT	7	8263	8277	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_020342	TAA	4	8908	8919	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284955
40	NC_020342	TTAATT	3	8929	8946	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	45284955
41	NC_020342	TAAA	3	9146	9156	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45284955
42	NC_020342	AAAT	3	9230	9240	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45284955
43	NC_020342	AAAAT	3	9319	9332	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	45284955
44	NC_020342	TATAA	3	9359	9372	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	45284955
45	NC_020342	AAAAAT	3	9400	9417	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	45284955
46	NC_020342	TAT	4	9581	9591	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284955
47	NC_020342	ATT	4	9639	9650	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	45284955
48	NC_020342	TAAA	4	9812	9827	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	45284955
49	NC_020342	A	13	9825	9837	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	45284955
50	NC_020342	TATAA	3	9914	9927	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	45284955
51	NC_020342	ATT	5	10069	10083	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_020342	TTTA	3	10270	10282	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	45284955
53	NC_020342	ATT	4	10378	10390	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284955
54	NC_020342	ATTAAT	3	10487	10504	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	45284955
55	NC_020342	ATATTA	3	10545	10561	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	45284955
56	NC_020342	ATTT	4	10565	10580	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	45284955
57	NC_020342	AT	12	10639	10660	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284955
58	NC_020342	AT	6	10834	10844	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284955
59	NC_020342	AATTTT	3	11568	11585	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	45284955
60	NC_020342	TTA	4	11715	11725	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284955
61	NC_020342	TAAT	3	11825	11836	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020342	ATA	4	11958	11968	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284955
63	NC_020342	TAAA	4	12082	12097	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	45284955
64	NC_020342	A	13	12342	12354	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	45284955
65	NC_020342	TAA	4	12525	12537	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284955
66	NC_020342	AATAA	3	12593	12608	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	45284955
67	NC_020342	ATT	7	12875	12898	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_020342	AT	11	12957	12977	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_020342	TTTTA	3	13439	13452	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_020342	TAAAT	3	13696	13709	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_020342	TAA	4	13862	13872	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_020342	TAT	4	13908	13919	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_020342	TTAA	3	13979	13990	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020342	TTAA	3	14097	14107	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_020342	TTTA	3	14346	14357	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_020342	AAATT	3	14365	14378	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_020342	TA	7	14484	14498	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_020342	TA	13	14516	14543	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_020342	AAATT	3	14633	14647	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_020342	TAT	5	14778	14792	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020342	TTTA	3	15048	15058	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_020342	ACTA	4	15098	15113	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
83	NC_020342	TAAAT	4	15277	15297	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_020342	ATT	4	15310	15322	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_020342	T	24	15346	15369	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_020342	TA	6	15377	15389	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_020342	AT	9	15468	15485	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
88	NC_020342	TAA	4	15494	15505	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_020342	TAT	4	15508	15519	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_020342	AATT	3	15558	15568	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_020342	TAAA	3	15619	15630	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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