ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Arundinaria gigantea chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020341	CAG	4	680	691	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45284946
2	NC_020341	CTT	4	4533	4544	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284946
3	NC_020341	TAA	4	6382	6392	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_020341	CTT	4	6786	6796	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_020341	AGT	4	6919	6930	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_020341	GAA	4	9015	9026	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_020341	TTG	4	11307	11317	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45284946
8	NC_020341	TAT	4	16005	16015	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_020341	TAA	4	18099	18109	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_020341	TAT	4	18792	18802	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_020341	ATA	4	20846	20856	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_020341	CTA	4	21186	21197	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_020341	ATT	4	21294	21304	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_020341	AAC	4	24924	24935	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45284947
15	NC_020341	AAT	5	26612	26626	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45284947
16	NC_020341	GAA	4	30106	30117	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284947
17	NC_020341	ATT	4	31885	31897	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_020341	AGA	4	32374	32384	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	45284947
19	NC_020341	GTT	5	33576	33590	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	45284947
20	NC_020341	TGC	4	34566	34577	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45284947
21	NC_020341	AAG	4	44709	44720	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284948
22	NC_020341	AGT	4	45111	45121	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45284948
23	NC_020341	TAT	4	46746	46756	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_020341	CTT	4	50337	50348	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_020341	TTC	4	62894	62905	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284949
26	NC_020341	TCT	4	63321	63331	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
27	NC_020341	TTA	4	65145	65156	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_020341	TTC	4	67045	67056	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_020341	ATA	4	67473	67483	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_020341	AGA	4	76294	76305	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284946
31	NC_020341	TAT	4	77352	77362	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284946
32	NC_020341	TTC	4	80904	80916	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	45284946
33	NC_020341	TCT	4	82558	82571	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	45284946
34	NC_020341	TTC	4	83661	83671	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284946
35	NC_020341	ATA	4	90317	90327	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284946
36	NC_020341	TAC	4	92133	92144	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45284946
37	NC_020341	AAG	4	105877	105888	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284950
38	NC_020341	ATA	4	107955	107965	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284950
39	NC_020341	CAA	4	111222	111232	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	45284950
40	NC_020341	TAT	5	112057	112070	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284950
41	NC_020341	TAA	4	117429	117439	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284950
42	NC_020341	GTA	4	129424	129435	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45284950

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Arundinaria gigantea chloroplast