ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Haemaphysalis formosensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020334	AAT	4	91	102	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284936
2	NC_020334	ATA	4	165	175	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284936
3	NC_020334	AAAT	3	191	203	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	45284936
4	NC_020334	AAT	4	280	291	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	45284936
5	NC_020334	AAAAAT	3	457	474	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	45284936
6	NC_020334	AAT	4	583	594	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284936
7	NC_020334	AATT	3	1379	1390	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45284936
8	NC_020334	CTATTA	3	1755	1771	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	45284936
9	NC_020334	AGG	4	1810	1820	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	45284936
10	NC_020334	GAAA	3	2573	2584	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	45284936
11	NC_020334	TAA	4	3441	3451	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_020334	TAA	7	3532	3552	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	45284936
13	NC_020334	TTA	4	3556	3567	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284936
14	NC_020334	AAATT	3	3597	3612	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	45284936
15	NC_020334	CTTT	3	4166	4176	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	45284936
16	NC_020334	TATT	4	4945	4960	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	45284936
17	NC_020334	ATT	4	5056	5067	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284936
18	NC_020334	ATT	4	5356	5367	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284937
19	NC_020334	ATT	4	5396	5408	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284937
20	NC_020334	TTAA	3	5647	5658	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_020334	TAA	4	5961	5971	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284937
22	NC_020334	ATT	4	6274	6285	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284937
23	NC_020334	ATT	7	6472	6492	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	45284937
24	NC_020334	TAA	4	6696	6707	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284937
25	NC_020334	AATA	3	7161	7172	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_020334	TTA	4	7688	7699	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_020334	TA	7	7800	7812	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_020334	AAAT	3	7828	7839	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020334	ATTC	3	8211	8223	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
30	NC_020334	ATT	4	8527	8539	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_020334	CTTT	3	8920	8931	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
32	NC_020334	ATTT	4	9343	9359	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	45284937
33	NC_020334	TAT	4	10169	10180	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284937
34	NC_020334	TAAA	4	10225	10240	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	45284937
35	NC_020334	TA	6	10699	10709	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284937
36	NC_020334	AAAT	3	10738	10749	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	45284937
37	NC_020334	AAAATT	3	10856	10874	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	45284937
38	NC_020334	ATTT	3	10944	10954	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_020334	AAT	5	11035	11050	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45284937
40	NC_020334	ATT	4	11557	11568	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284937
41	NC_020334	TAT	4	11745	11756	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284937
42	NC_020334	TAA	4	11754	11766	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284937
43	NC_020334	AATA	3	11793	11804	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	45284937
44	NC_020334	TAT	4	11829	11840	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284937
45	NC_020334	TAA	4	11968	11978	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284937
46	NC_020334	AAT	4	12013	12024	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284937
47	NC_020334	ATT	4	12042	12053	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284937
48	NC_020334	AT	7	12232	12245	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45284937
49	NC_020334	TTAATT	3	12272	12290	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	45284937
50	NC_020334	TTA	4	12749	12759	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284937
51	NC_020334	TAA	4	13028	13039	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284937
52	NC_020334	CTTT	3	13612	13623	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	45284937
53	NC_020334	TATCAT	4	13975	13997	23	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	45284937
54	NC_020334	TA	6	14120	14131	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45284937
55	NC_020334	TTTA	3	14158	14168	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284937
56	NC_020334	CTTT	3	14484	14495	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
57	NC_020334	TTAA	3	14625	14636	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Haemaphysalis formosensis mitochondrion