ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Amblyomma cajennense mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020333	A	14	198	211	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	45284935
2	NC_020333	CTTA	3	375	386	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	45284935
3	NC_020333	ATT	5	477	490	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284935
4	NC_020333	ACTT	3	627	638	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	45284935
5	NC_020333	TTTA	3	707	717	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284935
6	NC_020333	ATT	5	816	830	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45284935
7	NC_020333	TAT	7	839	859	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284935
8	NC_020333	TAT	4	1078	1088	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_020333	ATT	4	2555	2566	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284935
10	NC_020333	TCA	5	2609	2623	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	45284935
11	NC_020333	AAT	4	2782	2793	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284935
12	NC_020333	AT	6	2816	2826	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284935
13	NC_020333	AATT	3	2911	2923	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45284935
14	NC_020333	CATT	3	3559	3569	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	45284935
15	NC_020333	TAA	4	3620	3631	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284935
16	NC_020333	CTT	4	3768	3779	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45284935
17	NC_020333	ATTT	3	3948	3958	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284935
18	NC_020333	AAT	4	4186	4197	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284935
19	NC_020333	TAA	5	4435	4449	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45284935
20	NC_020333	TTA	4	4967	4978	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284935
21	NC_020333	GTTT	3	5108	5118	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	45284935
22	NC_020333	ATT	4	5371	5382	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284935
23	NC_020333	A	13	5890	5902	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	45284935
24	NC_020333	TAT	4	5931	5942	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284935
25	NC_020333	AAT	4	6037	6049	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284935
26	NC_020333	CTT	4	6427	6438	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284935
27	NC_020333	TTAA	3	7289	7299	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_020333	AATTTA	3	7390	7407	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_020333	ATTT	3	7423	7434	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020333	TA	6	7621	7634	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_020333	A	13	8615	8627	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_020333	ATTT	3	9002	9012	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_020333	TAT	4	9423	9435	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284935
34	NC_020333	TAAAA	3	9856	9869	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	45284935
35	NC_020333	A	12	9895	9906	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	45284935
36	NC_020333	ATT	5	10151	10165	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45284935
37	NC_020333	TGAA	3	10345	10355	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	45284935
38	NC_020333	ATAA	3	10833	10843	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45284935
39	NC_020333	ATT	4	11666	11676	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284935
40	NC_020333	AAAT	3	11897	11907	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45284935
41	NC_020333	A	16	12034	12049	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	45284935
42	NC_020333	ATTTA	3	12368	12382	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	45284935
43	NC_020333	TAA	5	12417	12431	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45284936
44	NC_020333	AAT	5	12821	12835	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45284936
45	NC_020333	TACT	3	13132	13142	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	45284936
46	NC_020333	ATT	4	13527	13538	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284936
47	NC_020333	AATT	3	13865	13877	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45284936
48	NC_020333	ATT	4	14064	14075	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284936
49	NC_020333	ATTT	3	14590	14600	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Amblyomma cajennense mitochondrion