ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pneumocystis murina mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020332	ATA	7	2	23	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_020332	TAAT	3	36	48	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_020332	ATTTTT	3	51	68	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
4	NC_020332	TTA	12	122	156	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_020332	TAAATA	4	202	224	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_020332	TAT	4	310	322	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_020332	TTA	5	407	422	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_020332	TAAA	6	433	456	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_020332	ATA	4	469	479	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_020332	AT	6	589	600	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_020332	AATT	3	622	633	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_020332	TGAGTT	4	756	778	23	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_020332	GAGT	9	790	826	37	25 %	25 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_020332	GATT	5	869	889	21	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_020332	GATT	5	896	916	21	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_020332	GATT	6	923	947	25	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_020332	TAG	4	992	1006	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_020332	TAT	4	1008	1021	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_020332	ATT	4	1035	1047	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_020332	TAT	4	1072	1083	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_020332	ATT	4	1084	1096	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_020332	ATT	4	1124	1136	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_020332	AAGT	5	1283	1303	21	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_020332	TATAT	5	1392	1416	25	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_020332	TATTA	4	1433	1452	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
26	NC_020332	TTATA	3	1450	1464	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020332	TAT	8	1453	1476	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_020332	TAT	5	1480	1495	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_020332	TAT	6	1499	1517	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
30	NC_020332	TAT	9	1521	1546	26	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_020332	ATATT	4	1549	1568	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
32	NC_020332	TAT	7	1568	1587	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_020332	AGATA	4	1588	1606	19	60 %	20 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_020332	ATGA	6	1642	1666	25	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_020332	AATGA	4	1699	1718	20	60 %	20 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
36	NC_020332	ATTA	4	1742	1757	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_020332	ATTT	7	1906	1933	28	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_020332	TAAT	5	1946	1965	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_020332	ATTT	13	2042	2094	53	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_020332	ATTA	4	2110	2125	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_020332	AATCA	4	2121	2140	20	60 %	20 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
42	NC_020332	ATCAA	4	2191	2210	20	60 %	20 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
43	NC_020332	AAT	4	2238	2249	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_020332	ATTA	3	2265	2275	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_020332	TAT	4	3016	3028	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_020332	ATA	4	3029	3040	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_020332	ATTT	3	3619	3629	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_020332	GAAT	3	3791	3801	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_020332	AGT	4	6255	6265	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45284933
50	NC_020332	CTAT	3	6850	6860	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
51	NC_020332	ATT	4	8458	8469	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284933
52	NC_020332	CTT	5	8694	8708	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	45284933
53	NC_020332	CTT	4	8807	8817	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284933
54	NC_020332	ATTT	3	9072	9082	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284933
55	NC_020332	TTTA	3	9185	9196	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45284933
56	NC_020332	TCTCT	3	9448	9462	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	45284933
57	NC_020332	TTA	4	9582	9592	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284933
58	NC_020332	TAT	5	9729	9742	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284933
59	NC_020332	TTTA	4	9822	9837	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	45284933
60	NC_020332	T	12	10910	10921	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020332	CTT	4	11192	11203	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284933
62	NC_020332	ATTT	3	11204	11215	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45284933
63	NC_020332	ACTT	3	11648	11659	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	45284933
64	NC_020332	AGAT	3	12140	12150	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_020332	TTA	4	12366	12377	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284934
66	NC_020332	CTT	5	13075	13089	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	45284934
67	NC_020332	TC	6	13218	13229	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	45284934
68	NC_020332	TTAT	3	13511	13522	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	45284934
69	NC_020332	TCT	4	13700	13711	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284934
70	NC_020332	TAT	4	13908	13918	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284934
71	NC_020332	TTTTA	3	14017	14030	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	45284934
72	NC_020332	ATT	4	14367	14377	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284934
73	NC_020332	GA	6	15386	15396	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_020332	TGAC	3	15449	15459	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
75	NC_020332	TA	6	16519	16529	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284934
76	NC_020332	TTA	4	16806	16817	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284934
77	NC_020332	TAT	5	19340	19354	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	45284934
78	NC_020332	GGA	4	19432	19442	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	45284934
79	NC_020332	TATT	3	20159	20170	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45284934
80	NC_020332	AT	7	20542	20554	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45284934
81	NC_020332	AG	7	21955	21968	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_020332	ATTTG	4	22397	22416	20	20 %	60 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_020332	AATT	3	22442	22453	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_020332	ATTTG	4	22466	22485	20	20 %	60 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
85	NC_020332	ATTA	3	22486	22497	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020332	ATAA	12	22517	22563	47	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_020332	TAAT	6	22643	22665	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_020332	TAAA	6	22679	22702	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_020332	TAAT	5	22852	22874	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_020332	AATTT	4	22882	22901	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
91	NC_020332	ATTC	4	22945	22964	20	25 %	50 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
92	NC_020332	ATCT	6	23000	23021	22	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
93	NC_020332	ATA	7	23022	23041	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
94	NC_020332	TATAA	3	23043	23057	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020332	ATA	9	23063	23088	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_020332	ATA	6	23092	23110	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
97	NC_020332	ATA	5	23114	23129	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_020332	ATA	8	23133	23156	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_020332	ATA	4	23185	23198	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_020332	TATAA	4	23199	23218	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
101	NC_020332	GAAT	3	23248	23260	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_020332	ACTT	5	23311	23331	21	25 %	50 %	0 %	25 %	4 %	Non-Coding
103	NC_020332	TAA	4	23384	23395	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_020332	AAT	4	23477	23487	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_020332	AAT	4	23566	23576	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_020332	ATA	4	23593	23605	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_020332	CTA	5	23606	23620	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
108	NC_020332	ATCA	3	23667	23682	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
109	NC_020332	ATCA	3	23694	23709	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
110	NC_020332	ATCA	3	23721	23736	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
111	NC_020332	AATC	3	23737	23748	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
112	NC_020332	ACTC	9	23783	23819	37	25 %	25 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
113	NC_020332	AACTCA	4	23831	23853	23	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
114	NC_020332	AATT	3	23976	23987	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_020332	TAT	5	24132	24145	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_020332	TATT	6	24152	24174	23	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_020332	TAA	5	24187	24202	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
118	NC_020332	A	13	24229	24241	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_020332	TA	6	24284	24296	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_020332	TATTTA	4	24385	24407	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_020332	TAA	12	24453	24487	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_020332	TAT	5	24592	24607	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

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