ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pneumocystis jirovecii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020331	TTA	5	250	264	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020331	ATT	4	332	346	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_020331	TTA	4	481	492	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_020331	TATT	3	491	502	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020331	TAT	9	553	578	26	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_020331	AT	6	662	673	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_020331	TA	8	970	984	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_020331	GTATAT	3	1025	1043	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
9	NC_020331	TAAG	3	1067	1078	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020331	GTATTA	4	1164	1186	23	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_020331	TAT	5	1293	1306	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_020331	ATA	4	1344	1355	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_020331	ATT	4	1358	1368	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_020331	ATATT	3	1480	1494	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_020331	AGT	4	1496	1506	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_020331	TA	6	1707	1717	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_020331	AT	9	1796	1812	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
18	NC_020331	ATT	4	1990	2001	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_020331	TTATAA	3	2002	2018	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_020331	TTA	4	2144	2158	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_020331	GT	6	2208	2219	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_020331	AT	12	2373	2397	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_020331	TA	7	2505	2517	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_020331	TA	6	2617	2628	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_020331	TTA	5	2764	2778	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_020331	TA	8	2899	2915	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_020331	TAT	4	3008	3022	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_020331	TAATA	3	3184	3197	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_020331	TATGAA	3	3392	3410	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
30	NC_020331	TA	8	3453	3468	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_020331	ATTAT	3	3485	3499	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_020331	TAA	4	3669	3680	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_020331	TAA	9	3859	3885	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	3 %	Non-Coding
34	NC_020331	TAT	4	3963	3974	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_020331	TTTAT	3	3998	4012	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_020331	AGTA	4	4140	4154	15	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_020331	TATG	3	4361	4372	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_020331	TAT	4	4391	4403	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_020331	TAA	4	4417	4428	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_020331	AAAT	3	4774	4785	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_020331	TA	6	4923	4935	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_020331	AT	7	5000	5013	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_020331	TAA	4	5070	5080	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_020331	ATA	4	5255	5265	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_020331	TAT	4	5709	5720	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020331	TAA	4	5759	5769	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_020331	ATA	5	5927	5941	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020331	TA	6	5952	5962	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_020331	TTAA	3	6019	6029	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_020331	TAT	4	6187	6197	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_020331	ATT	5	6253	6266	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_020331	AT	6	6304	6315	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_020331	TA	6	6327	6337	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_020331	AT	6	6356	6367	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_020331	TAG	4	6397	6408	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_020331	TAATG	3	6504	6517	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_020331	TAT	4	6533	6545	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_020331	TTAA	4	7053	7068	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_020331	TTA	4	7086	7097	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_020331	TTATAA	3	7218	7235	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
61	NC_020331	ATT	7	7506	7527	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_020331	ATT	4	7594	7605	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_020331	TA	7	7657	7670	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_020331	ATT	4	7886	7896	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_020331	TAT	5	8140	8155	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_020331	AAT	4	8535	8546	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020331	ATT	4	8616	8626	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_020331	TAT	6	8661	8678	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_020331	TAT	5	8713	8728	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_020331	TTATAT	3	8915	8931	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_020331	AT	7	8968	8983	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_020331	TTAT	3	9037	9048	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_020331	TA	6	9145	9156	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_020331	TA	6	9428	9440	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_020331	AT	7	9499	9511	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_020331	AT	6	9604	9614	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_020331	TAT	5	9762	9775	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_020331	TTA	4	9812	9822	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_020331	TA	8	9971	9987	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
80	NC_020331	TAT	4	10262	10272	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_020331	AT	7	10347	10359	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_020331	GTA	4	10404	10414	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_020331	TGTTA	3	10627	10641	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_020331	TA	6	11158	11169	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_020331	TAT	4	11220	11230	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_020331	GTAT	3	11273	11284	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020331	ATGT	4	11289	11304	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_020331	TTAA	3	11697	11708	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_020331	TAA	4	11925	11936	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_020331	CT	6	15611	15621	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	45284931
91	NC_020331	TGT	4	15637	15647	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45284931
92	NC_020331	TTC	4	15744	15755	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284931
93	NC_020331	TATT	3	16047	16058	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020331	TGT	4	16240	16250	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_020331	CTT	4	16596	16606	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284932
96	NC_020331	TGT	4	16836	16847	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	45284932
97	NC_020331	AGG	4	16924	16934	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	45284932
98	NC_020331	CTT	4	17850	17860	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
99	NC_020331	T	13	18981	18993	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_020331	TTA	4	18999	19009	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_020331	TATTT	4	19038	19057	20	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
102	NC_020331	TATTA	3	19060	19074	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_020331	ATTAT	13	19096	19160	65	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_020331	TAT	4	19486	19496	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284932
105	NC_020331	TTC	4	19838	19848	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284932
106	NC_020331	CTTT	3	19938	19948	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	45284932
107	NC_020331	TGTT	3	20132	20143	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	45284932
108	NC_020331	TTTCTC	3	20514	20530	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
109	NC_020331	TGTA	3	20813	20823	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_020331	TTCT	3	20903	20914	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
111	NC_020331	TTCT	3	21628	21640	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	45284932
112	NC_020331	ATTC	3	21857	21868	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	45284932
113	NC_020331	TTCT	3	22359	22370	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	45284932
114	NC_020331	TGTTAT	3	24285	24303	19	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
115	NC_020331	TTTTAT	3	25651	25668	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
116	NC_020331	TTTG	3	25896	25907	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_020331	GTT	4	26168	26179	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	45284932
118	NC_020331	TATT	3	26365	26375	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284932
119	NC_020331	TTGTT	3	26391	26405	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	45284932
120	NC_020331	ATTT	3	27268	27279	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45284932
121	NC_020331	TATT	3	27913	27924	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45284933
122	NC_020331	TCT	4	27976	27987	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284933
123	NC_020331	ATT	4	28083	28093	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284933
124	NC_020331	TTGGA	3	28510	28523	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	45284933
125	NC_020331	T	12	28608	28619	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_020331	TAT	8	28648	28672	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_020331	AT	7	28734	28748	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
128	NC_020331	GATT	3	28826	28836	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_020331	TTTA	3	29212	29224	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	45284933
130	NC_020331	TGT	4	30132	30143	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	45284933
131	NC_020331	TTATT	4	30750	30768	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
132	NC_020331	TAT	5	30797	30810	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
133	NC_020331	ATT	8	31257	31282	26	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_020331	ATT	18	31264	31315	52	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_020331	TAT	4	31389	31400	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_020331	TAAA	3	31502	31514	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_020331	TGAA	3	31992	32003	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_020331	ATTT	3	32537	32548	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020331	TA	7	33619	33632	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
140	NC_020331	ATTT	4	33881	33897	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
141	NC_020331	TAT	4	33980	33990	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_020331	TTTA	4	34415	34430	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
143	NC_020331	TTTA	3	34490	34500	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
144	NC_020331	TATTG	3	34551	34565	15	20 %	60 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020331	GATA	6	35036	35060	25	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
146	NC_020331	TAT	4	35186	35196	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
147	NC_020331	AT	6	35259	35270	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
148	NC_020331	TTATA	3	35381	35394	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
149	NC_020331	AAT	5	35430	35444	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pneumocystis jirovecii mitochondrion