ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pseudotmethis rubimarginis voucher Z0732 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020330	TAC	4	1064	1076	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	45284930
2	NC_020330	AAT	4	1126	1138	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284930
3	NC_020330	AGG	4	2093	2104	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	45284930
4	NC_020330	TAT	5	2828	2841	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284930
5	NC_020330	TTAAT	3	3939	3953	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	45284930
6	NC_020330	CTT	4	3962	3972	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284930
7	NC_020330	ATTT	3	4375	4387	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	45284930
8	NC_020330	TTAC	3	4547	4557	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	45284930
9	NC_020330	TAA	4	6098	6108	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_020330	TTTA	3	6249	6260	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_020330	ATAAAT	3	6334	6351	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	45284931
12	NC_020330	TAAA	4	6433	6448	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	45284931
13	NC_020330	AAT	4	6864	6874	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284931
14	NC_020330	AGAAAA	3	6907	6925	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	45284931
15	NC_020330	ATT	4	7205	7216	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284931
16	NC_020330	AAG	4	7455	7466	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284931
17	NC_020330	ATA	4	7549	7561	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284931
18	NC_020330	AAT	4	7789	7800	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284931
19	NC_020330	AATT	3	7938	7949	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45284931
20	NC_020330	TAAA	3	7981	7991	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45284931
21	NC_020330	AATA	4	8908	8924	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	45284931
22	NC_020330	AAAT	3	9036	9048	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	45284931
23	NC_020330	AAT	4	9587	9598	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284931
24	NC_020330	AAT	4	9970	9981	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284931
25	NC_020330	TAT	4	9978	9990	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284931
26	NC_020330	TTTA	3	10087	10098	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45284931
27	NC_020330	TAA	4	10255	10265	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284931
28	NC_020330	ATA	4	10328	10339	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284931
29	NC_020330	ATTT	3	10340	10351	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45284931
30	NC_020330	TAAAA	3	12267	12280	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	45284931
31	NC_020330	ATA	4	12695	12706	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_020330	AAAT	3	12967	12979	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_020330	A	12	13369	13380	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_020330	TAA	4	14130	14140	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_020330	AGAA	3	14931	14941	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_020330	T	18	15102	15119	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_020330	ATATT	4	15285	15305	21	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_020330	ATA	4	15369	15380	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_020330	TAT	4	15528	15538	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_020330	AAT	4	15560	15571	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pseudotmethis rubimarginis voucher Z0732 mitochondrion