ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Filchnerella helanshanensis voucher Z0731 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020329	ATT	4	934	945	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284929
2	NC_020329	TAC	4	1064	1076	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	45284929
3	NC_020329	AAT	4	1126	1138	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284929
4	NC_020329	AGG	4	2093	2104	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	45284929
5	NC_020329	TAT	5	2828	2841	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284929
6	NC_020329	TTAAT	3	3939	3953	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	45284929
7	NC_020329	CTT	4	3962	3972	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284929
8	NC_020329	AACTT	3	4182	4196	15	40 %	40 %	0 %	20 %	0 %	45284929
9	NC_020329	ATTT	3	4375	4387	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	45284929
10	NC_020329	TAA	4	6098	6108	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_020329	TTTA	3	6249	6260	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_020329	ATAAAT	3	6332	6349	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	45284929
13	NC_020329	TAAA	4	6431	6446	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	45284929
14	NC_020329	AAT	4	6862	6872	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284929
15	NC_020329	AGAAAA	3	6905	6923	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	45284929
16	NC_020329	TTA	4	7204	7215	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284929
17	NC_020329	AAG	4	7453	7464	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284929
18	NC_020329	ATA	4	7547	7559	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284929
19	NC_020329	AAACC	3	7696	7710	15	60 %	0 %	0 %	40 %	0 %	45284929
20	NC_020329	TAAA	3	7979	7989	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45284929
21	NC_020329	AATA	4	8906	8922	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	45284929
22	NC_020329	AAAT	3	9034	9046	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	45284929
23	NC_020329	AAT	4	9585	9596	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284930
24	NC_020329	AAT	4	9966	9977	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284930
25	NC_020329	TAT	4	9974	9986	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284930
26	NC_020329	TTTA	3	10083	10094	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45284930
27	NC_020329	TAA	4	10251	10261	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284930
28	NC_020329	ATA	5	10324	10338	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45284930
29	NC_020329	AACC	3	11923	11933	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	45284930
30	NC_020329	TAAAA	3	12263	12276	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	45284930
31	NC_020329	ATA	4	12691	12702	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_020329	AAAT	3	12963	12975	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_020329	A	12	13365	13376	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_020329	AAT	4	14152	14164	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_020329	AGAA	3	14927	14937	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_020329	T	18	15098	15115	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_020329	ATATT	4	15281	15301	21	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_020329	ATA	4	15365	15376	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_020329	AAT	4	15556	15567	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Filchnerella helanshanensis voucher Z0731 mitochondrion