ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Taxus mairei voucher NN014 chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020321	TCT	4	928	938	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284911
2	NC_020321	CAG	4	1192	1203	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45284911
3	NC_020321	ATC	4	2376	2386	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	45284911
4	NC_020321	TTA	4	7801	7812	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_020321	GAT	4	9055	9065	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_020321	TAC	4	13330	13341	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45284911
7	NC_020321	GGA	4	13426	13436	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	45284911
8	NC_020321	AAT	4	17129	17139	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_020321	CTG	4	17936	17947	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45284912
10	NC_020321	TAA	4	23592	23603	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_020321	AGA	4	28142	28153	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284912
12	NC_020321	AAC	4	29168	29179	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45284912
13	NC_020321	ATA	4	30149	30160	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284912
14	NC_020321	GAG	4	30577	30587	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	45284912
15	NC_020321	GAA	4	30632	30642	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	45284912
16	NC_020321	TCA	4	34975	34985	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	45284912
17	NC_020321	TAT	4	35113	35123	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_020321	TAT	4	37050	37060	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_020321	CTG	4	37588	37599	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45284913
20	NC_020321	AAC	4	38650	38661	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45284913
21	NC_020321	ATT	4	41476	41487	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_020321	TAA	4	43257	43268	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_020321	AAT	4	43440	43451	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_020321	CAA	4	44143	44154	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020321	ATA	5	47787	47801	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_020321	TAT	4	48659	48669	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284914
27	NC_020321	AGC	4	51164	51175	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45284914
28	NC_020321	GAC	5	53905	53919	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
29	NC_020321	AGA	4	54147	54158	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020321	AAT	4	54364	54375	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_020321	TAA	4	55071	55081	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284914
32	NC_020321	GAA	92	55403	55678	276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_020321	AGA	8	55415	55437	23	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_020321	GAA	5	55445	55459	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_020321	GAA	5	55463	55477	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_020321	GAG	5	56078	56092	15	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_020321	GAT	4	56372	56383	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_020321	TAA	4	56510	56522	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_020321	AAT	4	57931	57941	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_020321	ATA	4	64944	64956	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_020321	TAT	4	66055	66065	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_020321	TTA	4	68233	68244	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284915
43	NC_020321	TAT	4	68612	68623	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_020321	ATT	4	68958	68968	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_020321	ATA	4	70464	70475	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_020321	AAT	5	76669	76683	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_020321	ATA	4	77505	77516	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284917
48	NC_020321	CTT	4	78822	78832	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45284917
49	NC_020321	CCT	4	80263	80273	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	45284917
50	NC_020321	TAT	4	80429	80441	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284917
51	NC_020321	TAT	4	80805	80815	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_020321	AAG	4	82676	82687	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_020321	AAG	4	88762	88773	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284917
54	NC_020321	ATA	4	90097	90107	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284917
55	NC_020321	TAC	4	93631	93642	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
56	NC_020321	AGT	4	94685	94695	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_020321	TAA	5	97510	97524	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_020321	CCT	4	97836	97848	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
59	NC_020321	ACC	4	102797	102808	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
60	NC_020321	AAT	4	103120	103130	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284917
61	NC_020321	TAT	4	106125	106137	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284918
62	NC_020321	TGT	4	107135	107146	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_020321	AAT	4	109245	109255	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45284918
64	NC_020321	ATA	4	110282	110293	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284918
65	NC_020321	TCA	4	111967	111978	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45284918
66	NC_020321	TAT	4	112232	112242	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_020321	AAT	4	112366	112377	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_020321	AAT	7	117104	117124	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_020321	TCT	4	118402	118414	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
70	NC_020321	CTT	4	118517	118528	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
71	NC_020321	AAT	4	121281	121291	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_020321	ATC	4	121748	121759	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
73	NC_020321	TCC	4	123344	123355	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
74	NC_020321	AAT	4	124114	124125	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_020321	ATT	4	124906	124917	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_020321	ATA	5	125150	125163	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284919
77	NC_020321	TTA	4	126623	126634	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284919

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