ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Magnolia grandiflora voucher NJ016 chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020318	CAG	4	1076	1087	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45284883
2	NC_020318	AGA	4	2183	2194	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284883
3	NC_020318	CAT	4	6609	6620	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_020318	ATT	4	10858	10869	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_020318	TAT	5	14206	14219	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_020318	ATT	5	14810	14825	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_020318	TGT	4	17885	17895	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45284884
8	NC_020318	GTT	4	24789	24800	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	45284884
9	NC_020318	CAG	4	29408	29419	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_020318	GTA	4	34725	34735	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_020318	TTG	4	37024	37034	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45284885
12	NC_020318	ATG	4	41021	41031	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45284885
13	NC_020318	GCA	4	42919	42930	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45284885
14	NC_020318	TAA	4	44524	44536	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_020318	ATT	4	46998	47009	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_020318	AGT	4	47881	47892	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45284885
17	NC_020318	ATT	4	48808	48818	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_020318	ATA	5	57546	57559	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284886
19	NC_020318	TTA	4	62876	62886	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_020318	CTT	4	67225	67237	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
21	NC_020318	AGT	4	68822	68834	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_020318	TTA	4	69260	69274	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_020318	TCT	4	71190	71201	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_020318	AGA	4	72008	72018	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_020318	CTG	4	73613	73624	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45284883
26	NC_020318	AGA	4	73874	73885	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284883
27	NC_020318	TAT	5	74352	74367	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45284883
28	NC_020318	ATA	4	82469	82480	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284883
29	NC_020318	GGA	4	83569	83581	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	45284883
30	NC_020318	CTT	4	87857	87868	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284883
31	NC_020318	GAT	4	89688	89698	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45284883
32	NC_020318	GAT	4	92716	92727	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45284883
33	NC_020318	TGA	4	94449	94460	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45284883
34	NC_020318	CTT	4	107031	107042	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284888
35	NC_020318	TAT	4	115109	115121	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284888
36	NC_020318	ATT	4	117283	117293	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284888
37	NC_020318	TTC	4	117487	117499	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	45284888
38	NC_020318	ACA	4	118105	118116	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45284888
39	NC_020318	TAT	4	119109	119119	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284888
40	NC_020318	ATA	4	123132	123143	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284888
41	NC_020318	AAT	4	128495	128506	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	45284888
42	NC_020318	TTA	4	144763	144774	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284888
43	NC_020318	ATC	4	154654	154665	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45284891
44	NC_020318	ATC	4	157683	157693	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Magnolia grandiflora voucher NJ016 chloroplast