ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Magnolia officinalis subsp. biloba voucher SC001 chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020317	CAG	4	1070	1081	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45284875
2	NC_020317	AGA	4	2200	2211	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284875
3	NC_020317	AAG	5	4873	4886	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_020317	CAT	4	6656	6667	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_020317	TAT	5	14308	14321	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_020317	ATT	5	14912	14927	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_020317	TGT	4	17973	17983	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45284876
8	NC_020317	GTT	4	24877	24888	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	45284876
9	NC_020317	CAG	4	29491	29502	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_020317	TTA	4	32047	32057	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_020317	GTA	4	35100	35110	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_020317	TTG	4	37399	37409	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45284876
13	NC_020317	ATG	4	41403	41413	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45284877
14	NC_020317	GCA	4	43301	43312	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45284877
15	NC_020317	TAA	4	44906	44918	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_020317	ATT	4	47357	47368	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_020317	ATT	4	49216	49226	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_020317	ATA	5	57969	57982	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284877
19	NC_020317	TTA	4	63299	63309	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_020317	CTT	4	67646	67658	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
21	NC_020317	AGT	4	69241	69253	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_020317	TTA	4	69683	69694	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_020317	TCT	4	71616	71627	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_020317	AGA	4	72436	72446	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_020317	CTG	4	74043	74054	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45284875
26	NC_020317	AGA	4	74304	74315	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284875
27	NC_020317	TAT	5	74778	74793	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45284875
28	NC_020317	TCT	4	74820	74831	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284875
29	NC_020317	ATA	4	82901	82912	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284875
30	NC_020317	GGA	4	83996	84008	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	45284875
31	NC_020317	CCT	4	87420	87431	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	45284875
32	NC_020317	CTT	4	88297	88308	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284875
33	NC_020317	GAT	4	90128	90138	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45284875
34	NC_020317	GAT	4	93156	93167	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45284875
35	NC_020317	TGA	4	94889	94900	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45284875
36	NC_020317	CTT	4	107476	107487	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284879
37	NC_020317	TAT	4	115521	115532	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284879
38	NC_020317	ATT	4	117698	117708	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284879
39	NC_020317	TTC	4	117902	117914	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	45284879
40	NC_020317	ACA	4	118518	118529	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45284879
41	NC_020317	TAT	4	119520	119530	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284879
42	NC_020317	ATA	4	123545	123556	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284879
43	NC_020317	AAT	4	128949	128960	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284879
44	NC_020317	TTA	4	145234	145245	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284879
45	NC_020317	ATC	4	155125	155136	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45284883
46	NC_020317	ATC	4	158154	158164	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Magnolia officinalis subsp. biloba voucher SC001 chloroplast