ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Magnolia officinalis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020316	CAG	4	1069	1080	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45284866
2	NC_020316	AGA	4	2204	2215	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284866
3	NC_020316	AAG	5	4872	4885	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_020316	TAT	5	14273	14286	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_020316	ATT	5	14877	14892	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_020316	TGT	4	17942	17952	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45284867
7	NC_020316	GTT	4	24852	24863	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	45284867
8	NC_020316	CAG	4	29472	29483	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_020316	TTA	4	32056	32066	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_020316	GTA	4	35106	35116	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_020316	TTG	4	37405	37415	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45284868
12	NC_020316	ATG	4	41406	41416	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45284868
13	NC_020316	GCA	4	43304	43315	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45284868
14	NC_020316	TAA	4	44909	44921	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_020316	ATT	4	47362	47373	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_020316	TAT	4	49207	49218	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_020316	ATT	4	49226	49236	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_020316	ATA	5	57961	57974	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45284869
19	NC_020316	TTA	4	63294	63304	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_020316	CTT	4	67647	67659	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
21	NC_020316	AGT	4	69236	69248	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_020316	TTA	4	69678	69689	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_020316	TCT	4	71608	71619	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_020316	AGA	4	72427	72437	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_020316	CTG	4	74041	74052	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45284866
26	NC_020316	AGA	4	74302	74313	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45284866
27	NC_020316	TAT	5	74777	74792	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45284866
28	NC_020316	TCT	4	74819	74830	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284866
29	NC_020316	ATA	4	82904	82915	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284866
30	NC_020316	GGA	4	84004	84016	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	45284866
31	NC_020316	TCC	4	87443	87454	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	45284866
32	NC_020316	CTT	4	88321	88332	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284866
33	NC_020316	GAT	4	90152	90162	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45284866
34	NC_020316	GAT	4	93180	93191	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45284866
35	NC_020316	TGA	4	94913	94924	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45284866
36	NC_020316	CTT	4	107491	107502	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45284871
37	NC_020316	TAT	4	115572	115583	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284871
38	NC_020316	ATT	4	117749	117759	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284871
39	NC_020316	ATT	4	117771	117781	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284871
40	NC_020316	TTC	4	117975	117987	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	45284871
41	NC_020316	TAT	4	119589	119599	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45284871
42	NC_020316	ATA	4	123617	123628	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284871
43	NC_020316	AAT	4	128989	129000	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284871
44	NC_020316	TAA	6	136195	136213	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	45284871
45	NC_020316	TTA	4	145312	145323	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284871
46	NC_020316	ATC	4	155203	155214	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45284874
47	NC_020316	ATC	4	158232	158242	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Magnolia officinalis chloroplast