ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Quercus rubra plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020152	AT	7	6770	6782	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_020152	AT	8	6795	6809	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_020152	TA	7	6823	6835	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_020152	AT	6	7420	7431	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_020152	AT	6	8122	8134	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_020152	TA	6	11291	11301	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_020152	TA	6	14825	14836	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_020152	AG	6	18370	18380	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_020152	AT	7	22015	22027	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	44326729
10	NC_020152	GA	6	29596	29606	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_020152	AT	9	39942	39958	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_020152	AG	6	39972	39982	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_020152	TA	7	40197	40210	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_020152	TC	6	40629	40639	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	44326730
15	NC_020152	TA	6	41069	41079	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_020152	TG	6	45541	45551	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	44326730
17	NC_020152	AT	7	50204	50217	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_020152	AT	6	52407	52417	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_020152	AT	6	53369	53379	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_020152	AT	6	56444	56454	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_020152	AT	7	62159	62172	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_020152	AT	12	64668	64689	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_020152	AT	6	64747	64758	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_020152	AT	6	67630	67640	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	44326732
25	NC_020152	AT	8	69198	69212	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_020152	TA	7	73830	73842	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_020152	TA	6	77359	77370	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	44326728
28	NC_020152	AT	6	77373	77386	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	44326728
29	NC_020152	TA	7	83007	83021	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	44326728
30	NC_020152	TC	6	88568	88579	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	44326728
31	NC_020152	AT	6	88698	88708	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	44326728
32	NC_020152	TA	6	89678	89688	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	44326728
33	NC_020152	AT	6	90138	90148	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	44326728
34	NC_020152	AG	6	114169	114179	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	44326733
35	NC_020152	AT	7	122160	122172	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	44326733
36	NC_020152	AT	7	124006	124019	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	44326733
37	NC_020152	CT	6	137668	137679	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	44326733

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Quercus rubra plastid