ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Quercus rubra plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020152	TAAA	4	237	252	16	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020152	A	13	5097	5109	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020152	AT	6	6795	6806	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020152	A	12	8457	8468	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020152	T	12	10168	10179	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020152	T	12	14149	14160	12	0 %	100 %	0 %	0 %	44326729
7	NC_020152	A	12	14272	14283	12	100 %	0 %	0 %	0 %	44326729
8	NC_020152	T	12	21174	21185	12	0 %	100 %	0 %	0 %	44326729
9	NC_020152	C	13	24714	24726	13	0 %	0 %	0 %	100 %	44326729
10	NC_020152	A	12	24727	24738	12	100 %	0 %	0 %	0 %	44326729
11	NC_020152	T	13	31616	31628	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020152	ATAA	3	33698	33709	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020152	A	12	34915	34926	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020152	A	15	35094	35108	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020152	TAA	4	35942	35953	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020152	TTAAA	3	36374	36388	15	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020152	AT	8	39942	39957	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020152	A	12	40240	40251	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020152	A	12	40756	40767	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020152	A	13	41497	41509	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020152	TTTA	3	52998	53009	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020152	TATT	3	54292	54303	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020152	T	13	54317	54329	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020152	A	12	55117	55128	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020152	AT	6	62159	62170	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020152	AT	8	64671	64686	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020152	T	12	65046	65057	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020152	T	14	66265	66278	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020152	A	15	69128	69142	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020152	AT	6	69198	69209	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020152	C	12	70817	70828	12	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_020152	T	14	71496	71509	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020152	ATTA	3	72670	72681	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020152	TA	6	83007	83018	12	50 %	50 %	0 %	0 %	44326728
35	NC_020152	ATA	4	88034	88045	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	44326728
36	NC_020152	GCAAT	3	105709	105723	15	40 %	20 %	20 %	20 %	44326733
37	NC_020152	T	12	118737	118748	12	0 %	100 %	0 %	0 %	44326733
38	NC_020152	A	12	118997	119008	12	100 %	0 %	0 %	0 %	44326733
39	NC_020152	AAAT	4	119780	119795	16	75 %	25 %	0 %	0 %	44326733
40	NC_020152	A	12	120800	120811	12	100 %	0 %	0 %	0 %	44326733
41	NC_020152	AT	6	124006	124017	12	50 %	50 %	0 %	0 %	44326733
42	NC_020152	ATATTA	3	125128	125145	18	50 %	50 %	0 %	0 %	44326733
43	NC_020152	TTTTA	3	126104	126118	15	20 %	80 %	0 %	0 %	44326733
44	NC_020152	TCT	4	128007	128018	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	44326733
45	NC_020152	A	13	130629	130641	13	100 %	0 %	0 %	0 %	44326733
46	NC_020152	ATA	4	133440	133451	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	44326733
47	NC_020152	T	13	134181	134193	13	0 %	100 %	0 %	0 %	44326733
48	NC_020152	ATT	4	135019	135030	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	44326733
49	NC_020152	CATTG	3	146122	146136	15	20 %	40 %	20 %	20 %	44326733

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Quercus rubra plastid