ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Phlebia radiata strain 79 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020148	GGGC	3	3121	3131	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	44276978
2	NC_020148	ATTT	3	5320	5330	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	44276978
3	NC_020148	ATCT	3	6090	6100	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	44276978
4	NC_020148	ATTA	3	7366	7377	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	44276978
5	NC_020148	ATTT	3	7543	7553	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	44276978
6	NC_020148	TATT	3	8216	8227	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	44276978
7	NC_020148	ATTT	3	9236	9246	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	44276978
8	NC_020148	AATT	3	14426	14437	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	44276978
9	NC_020148	TAAA	3	14595	14605	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	44276978
10	NC_020148	AAAT	3	15239	15250	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	44276978
11	NC_020148	ATCC	3	15331	15342	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	44276978
12	NC_020148	AATT	3	16056	16067	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	44276978
13	NC_020148	TTAA	3	17644	17655	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	44276978
14	NC_020148	AATA	3	24193	24204	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_020148	AAAT	3	26111	26123	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	44276981
16	NC_020148	AAGC	3	26605	26617	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
17	NC_020148	TGGC	3	29078	29089	12	0 %	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020148	CTAT	3	29148	29159	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
19	NC_020148	TAAA	3	31336	31347	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020148	TAAA	3	32905	32915	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	44276982
21	NC_020148	TGTT	3	34393	34403	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_020148	TAAA	3	35612	35623	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_020148	TTTG	3	35677	35687	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_020148	CAAA	3	36182	36192	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
25	NC_020148	TAAA	3	38530	38541	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_020148	AATT	3	39224	39236	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	44276982
27	NC_020148	TTTA	3	42066	42077	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_020148	AAAC	3	43399	43409	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	44276983
29	NC_020148	ACAA	5	43462	43483	22	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	44276983
30	NC_020148	TATT	3	44773	44784	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020148	TTTA	3	45237	45248	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_020148	TTAA	3	45268	45280	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_020148	AAAT	3	46258	46268	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	44276983
34	NC_020148	AAAT	3	46613	46624	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	44276983
35	NC_020148	ATTT	5	47538	47557	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	44276983
36	NC_020148	ATTT	3	48147	48162	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	44276983
37	NC_020148	ATCA	3	49351	49361	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	44276983
38	NC_020148	TGGG	3	50845	50855	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	44276983
39	NC_020148	ATTT	3	51561	51573	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	44276983
40	NC_020148	ATTA	3	52981	52992	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_020148	ATTA	3	53604	53619	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_020148	CTAA	3	54652	54662	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
43	NC_020148	ATTT	3	55421	55431	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_020148	ATCT	3	55985	55996	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020148	TGTT	3	56099	56110	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020148	TTTG	3	56215	56226	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_020148	TGTT	3	57291	57301	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_020148	ATTT	3	57621	57631	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_020148	CATT	3	58932	58943	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	44276984
50	NC_020148	TAAA	3	59643	59653	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	44276984
51	NC_020148	CAGG	3	60357	60368	12	25 %	0 %	50 %	25 %	0 %	44276984
52	NC_020148	CTTT	3	62347	62359	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	44276984
53	NC_020148	ATTT	4	63011	63026	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_020148	TAGT	3	63530	63541	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_020148	TTTA	3	65429	65440	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	44276984
56	NC_020148	TTCA	3	66431	66442	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	44276985
57	NC_020148	AAAT	3	67033	67045	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	44276985
58	NC_020148	TTTA	3	68631	68642	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	44276985
59	NC_020148	ATGG	3	69560	69570	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	44276985
60	NC_020148	TAAA	3	69648	69658	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	44276985
61	NC_020148	GAAA	3	70223	70234	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	44276985
62	NC_020148	TTTA	3	71147	71158	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	44276985
63	NC_020148	TCAA	3	71702	71713	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	44276985
64	NC_020148	TTTA	3	72004	72014	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	44276985
65	NC_020148	GCAA	3	74930	74941	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	44276985
66	NC_020148	GCTT	3	76786	76797	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
67	NC_020148	AATT	3	77108	77119	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_020148	TTAA	3	80101	80112	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_020148	GAAA	3	80187	80198	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_020148	TTTC	3	81533	81543	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_020148	TTAA	3	81624	81635	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	44276986
72	NC_020148	TTAA	3	82422	82432	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	44276986
73	NC_020148	TAAA	3	82692	82702	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	44276986
74	NC_020148	TTTA	3	83574	83584	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	44276986
75	NC_020148	TAGT	3	83599	83610	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	44276986
76	NC_020148	TTTA	3	83875	83885	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	44276986
77	NC_020148	TATT	3	84239	84250	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	44276986
78	NC_020148	ATTC	3	84675	84685	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	44276986
79	NC_020148	AAAC	3	84917	84928	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	44276986
80	NC_020148	GACT	3	88549	88559	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
81	NC_020148	CTAG	3	88611	88623	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
82	NC_020148	CTTT	3	88687	88697	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
83	NC_020148	TTAA	3	89091	89102	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020148	CAAA	3	93072	93082	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
85	NC_020148	AGGG	3	94622	94633	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_020148	TAAA	3	98125	98136	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_020148	TTAA	3	98142	98152	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_020148	AATT	3	99723	99734	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_020148	ATTT	3	100136	100147	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_020148	ATTG	4	101681	101696	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_020148	TGCC	4	102615	102630	16	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020148	AAAT	3	102890	102901	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020148	ATTT	3	104487	104498	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_020148	AAAT	3	104615	104626	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_020148	GTAA	3	105237	105248	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	44276987
96	NC_020148	TAAC	3	105270	105281	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	44276987
97	NC_020148	ATTT	3	108179	108190	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_020148	ATTT	3	110485	110495	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_020148	AAAT	5	110558	110577	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
100	NC_020148	TAAA	4	111161	111176	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_020148	AGTT	3	111904	111915	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	44276987
102	NC_020148	TTTA	3	112122	112133	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_020148	GGCT	3	113846	113857	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
104	NC_020148	AGCG	3	114714	114725	12	25 %	0 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020148	CAAA	3	114925	114935	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
106	NC_020148	CAAA	3	114955	114965	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
107	NC_020148	CAAA	3	115103	115114	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
108	NC_020148	AAAT	3	115846	115856	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_020148	AAAC	3	116130	116141	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
110	NC_020148	AATT	3	118255	118267	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_020148	CCAT	3	120261	120271	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	44276987
112	NC_020148	AATT	3	120899	120910	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	44276987
113	NC_020148	TAAA	3	121066	121077	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	44276987
114	NC_020148	GTAA	3	123884	123894	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	44276987
115	NC_020148	TAAT	3	125183	125193	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	44276987
116	NC_020148	ACAA	13	127174	127227	54	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
117	NC_020148	AAAC	3	127336	127347	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
118	NC_020148	TAAA	3	129011	129021	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	44276989
119	NC_020148	AGGC	3	129199	129210	12	25 %	0 %	50 %	25 %	0 %	44276989
120	NC_020148	AAAC	3	129947	129957	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	44276989
121	NC_020148	AAGC	3	131168	131179	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	44276989
122	NC_020148	AAGC	3	131253	131264	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	44276989
123	NC_020148	AGGC	3	131520	131530	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
124	NC_020148	TTAA	3	131538	131549	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_020148	AAAC	3	131553	131563	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
126	NC_020148	TAAA	3	132519	132529	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_020148	ATAA	3	134068	134079	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	44276989
128	NC_020148	AATT	3	137470	137482	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	44276990
129	NC_020148	TTAT	3	140436	140446	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_020148	TAGT	3	141785	141796	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	44276990
131	NC_020148	AAGT	3	142298	142308	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	44276990
132	NC_020148	ACAA	3	144339	144350	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020148	TTAA	3	144615	144626	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_020148	TAAA	3	144748	144759	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_020148	TTTG	3	145514	145524	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_020148	ATTT	3	146448	146459	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020148	ACAA	3	146723	146733	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
138	NC_020148	GGTC	3	147550	147561	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
139	NC_020148	TAGC	3	150042	150053	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
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141	NC_020148	TTAA	3	152780	152791	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_020148	TATT	3	152989	152999	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_020148	GCCA	3	153068	153080	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
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149	NC_020148	TTTA	3	155153	155165	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
150	NC_020148	CAAA	3	155405	155416	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	44276991

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Phlebia radiata strain 79 mitochondrion