ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phlebia radiata strain 79 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020148	TAA	4	1772	1783	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44276978
2	NC_020148	ATT	5	1784	1797	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	44276978
3	NC_020148	CTT	4	1795	1806	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	44276978
4	NC_020148	TTA	4	2654	2664	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44276978
5	NC_020148	TAT	5	5015	5029	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	44276978
6	NC_020148	TAT	4	5198	5208	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44276978
7	NC_020148	TAT	5	7065	7079	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	44276978
8	NC_020148	ATA	5	9196	9210	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	44276978
9	NC_020148	TTA	4	10042	10056	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	44276978
10	NC_020148	TGG	4	10131	10142	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	44276978
11	NC_020148	AAC	4	11825	11836	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	44276978
12	NC_020148	TCT	4	14726	14737	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	44276978
13	NC_020148	ATA	4	15639	15650	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44276978
14	NC_020148	ATT	4	19797	19807	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44276978
15	NC_020148	ATA	5	21760	21773	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_020148	GAT	4	25326	25338	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	44276981
17	NC_020148	ATA	4	29846	29857	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_020148	TAA	4	35342	35353	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_020148	TAA	5	37100	37114	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	44276982
20	NC_020148	GTG	5	39013	39027	15	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_020148	TTA	4	40162	40173	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_020148	TTA	6	44164	44182	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	44276983
23	NC_020148	AAT	4	44629	44641	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_020148	TAT	4	44989	45000	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_020148	ATT	4	45779	45789	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44276983
26	NC_020148	ATT	4	46102	46112	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44276983
27	NC_020148	TAT	4	49180	49190	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44276983
28	NC_020148	TAT	4	49431	49441	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44276983
29	NC_020148	ATA	5	49667	49681	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	44276983
30	NC_020148	AAT	4	50313	50325	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	44276983
31	NC_020148	TAA	4	52470	52482	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	44276983
32	NC_020148	TAT	4	57258	57269	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_020148	ATA	4	58058	58069	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_020148	ATA	4	58211	58222	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_020148	TTA	4	60235	60245	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44276984
36	NC_020148	ATA	4	60829	60839	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	44276984
37	NC_020148	TTG	4	61381	61392	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	44276984
38	NC_020148	AAG	4	61656	61667	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	44276984
39	NC_020148	TAA	4	62190	62202	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	44276984
40	NC_020148	TAT	5	62548	62562	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_020148	TTA	4	62679	62691	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_020148	TAT	4	63182	63194	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	44276984
43	NC_020148	TTA	4	63883	63894	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_020148	ATT	4	64315	64329	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	44276984
45	NC_020148	TTA	4	64415	64426	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44276984
46	NC_020148	ATT	4	64472	64483	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44276984
47	NC_020148	TAT	4	65364	65375	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44276984
48	NC_020148	TGA	4	70499	70511	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	44276985
49	NC_020148	ATT	4	70980	70990	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44276985
50	NC_020148	TAT	4	71889	71900	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44276985
51	NC_020148	ATT	4	71984	71997	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	44276985
52	NC_020148	TAT	4	72055	72065	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44276985
53	NC_020148	TTA	4	75183	75194	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44276985
54	NC_020148	AAT	4	75648	75659	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44276985
55	NC_020148	ATT	4	76107	76119	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	44276985
56	NC_020148	ATA	4	76150	76161	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44276985
57	NC_020148	AAT	5	76227	76241	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_020148	TTA	4	76399	76409	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_020148	ATT	4	77633	77643	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_020148	ATT	4	78240	78251	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_020148	TGT	4	79167	79177	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_020148	TTA	4	83910	83921	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44276986
63	NC_020148	TAT	4	86899	86910	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44276986
64	NC_020148	ATT	4	90214	90224	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_020148	ATT	4	92073	92084	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_020148	TTA	5	92312	92326	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_020148	ATT	5	93607	93621	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_020148	TAT	4	97942	97952	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_020148	ATA	4	98223	98234	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_020148	CAT	4	99735	99745	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
71	NC_020148	ATA	4	100174	100184	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_020148	ATA	4	103790	103801	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44276987
73	NC_020148	TAA	4	104011	104022	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_020148	TAA	4	104144	104154	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_020148	TAC	5	104234	104248	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
76	NC_020148	AAT	4	106500	106510	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_020148	TAT	4	109423	109433	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_020148	TAA	4	114172	114182	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_020148	ATT	4	118474	118485	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_020148	ATT	8	119344	119366	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44276987
81	NC_020148	ATA	4	121250	121260	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	44276987
82	NC_020148	TAA	4	121277	121288	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44276987
83	NC_020148	AGT	4	121905	121915	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	44276987
84	NC_020148	GAA	4	126037	126049	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	44276987
85	NC_020148	ATT	5	128695	128709	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	44276989
86	NC_020148	TAA	4	128879	128890	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44276989
87	NC_020148	ATA	5	130403	130418	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	44276989
88	NC_020148	TAA	4	130495	130506	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44276989
89	NC_020148	TAT	4	130542	130553	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44276989
90	NC_020148	ATA	4	130899	130909	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_020148	TTA	4	131025	131035	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_020148	TTA	4	131593	131603	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_020148	ATT	4	132009	132019	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_020148	TAT	4	132291	132302	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_020148	AAT	6	132498	132516	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
96	NC_020148	TAT	4	132576	132587	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_020148	TAA	5	132645	132659	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_020148	ATT	5	132687	132702	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_020148	TTA	4	133329	133339	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_020148	ATT	4	133462	133473	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44276989
101	NC_020148	ATT	4	133639	133651	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	44276989
102	NC_020148	TAT	5	133752	133766	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	44276989
103	NC_020148	ATA	5	133806	133819	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	44276989
104	NC_020148	CCA	5	137681	137694	14	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
105	NC_020148	TAT	4	142405	142417	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	44276990
106	NC_020148	TAT	4	146710	146720	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_020148	GAG	4	149321	149331	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_020148	TAA	4	149940	149950	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phlebia radiata strain 79 mitochondrion