ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ophioglossum californicum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020147	GTA	4	1477	1487	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	44326720
2	NC_020147	GAT	4	9683	9693	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	44326720
3	NC_020147	ATT	4	12828	12838	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44326720
4	NC_020147	TGA	4	24509	24520	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	44326720
5	NC_020147	GCA	4	26757	26768	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	44326720
6	NC_020147	TCC	4	29170	29180	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	44326720
7	NC_020147	TCT	4	30017	30027	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	44326720
8	NC_020147	TAA	4	41879	41890	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44326720
9	NC_020147	GTA	4	42832	42843	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	44326720
10	NC_020147	GAA	4	44621	44632	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	44326720
11	NC_020147	TAT	4	47504	47516	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	44326720
12	NC_020147	TAT	5	59600	59614	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	44326720
13	NC_020147	CTA	4	60421	60432	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	44326720
14	NC_020147	ATT	4	63145	63155	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44326720
15	NC_020147	GAG	4	73525	73536	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	44326720
16	NC_020147	CTC	4	74666	74676	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	44326720
17	NC_020147	ATA	4	76518	76529	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44326720
18	NC_020147	AAT	4	77990	78002	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	44326720
19	NC_020147	AAT	4	79578	79590	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	44326720
20	NC_020147	TTA	4	84860	84870	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_020147	TTA	4	84880	84891	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_020147	CTT	5	86544	86557	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	44326725
23	NC_020147	CTC	4	88107	88118	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	44326725
24	NC_020147	GAA	5	89927	89941	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	44326725
25	NC_020147	CTC	4	94735	94746	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	44326726
26	NC_020147	TCG	4	95510	95520	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	44326726
27	NC_020147	TAA	4	97934	97945	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44326726
28	NC_020147	GAG	4	98749	98759	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_020147	AAG	4	111391	111402	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	44326727
30	NC_020147	GAA	4	111545	111555	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	44326727
31	NC_020147	TCC	4	111981	111992	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
32	NC_020147	AAT	4	113819	113830	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44326727
33	NC_020147	AAG	4	114634	114644	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	44326727
34	NC_020147	TCT	4	121724	121735	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	44326728

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ophioglossum californicum chloroplast