ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Microcaecilia sp. PZ-2009 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020141	TAT	4	153	163	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_020141	CAA	4	1103	1114	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_020141	GTCTA	3	1285	1298	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
4	NC_020141	AAT	4	1500	1511	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_020141	ACCA	3	2352	2363	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
6	NC_020141	AT	6	3308	3318	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	44276971
7	NC_020141	AAT	4	4490	4501	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44276971
8	NC_020141	ACA	4	4734	4744	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	44276971
9	NC_020141	ATA	4	6747	6758	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44276971
10	NC_020141	CAAC	3	8306	8317	12	50 %	0 %	0 %	50 %	0 %	44276972
11	NC_020141	TAC	4	8539	8550	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	44276972
12	NC_020141	TAT	4	8596	8607	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44276972
13	NC_020141	TTC	4	8906	8917	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	44276972
14	NC_020141	TAT	4	10058	10070	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	44276972
15	NC_020141	CAAC	3	10449	10461	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	44276972
16	NC_020141	ACA	4	10743	10755	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	44276972
17	NC_020141	AAC	4	11420	11430	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	44276972
18	NC_020141	CCAA	3	11436	11446	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	44276972
19	NC_020141	CTAAT	3	12564	12578	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	44276972
20	NC_020141	CAC	4	13078	13089	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	44276972
21	NC_020141	CAA	4	13720	13732	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	44276972
22	NC_020141	CTA	4	14493	14504	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	44276972
23	NC_020141	ATT	4	14835	14845	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44276972
24	NC_020141	CAC	4	14929	14939	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	44276972
25	NC_020141	CAA	4	15064	15074	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	44276972
26	NC_020141	T	12	15639	15650	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_020141	TA	11	15992	16012	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_020141	ATTA	3	16013	16024	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020141	TA	6	16078	16090	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_020141	AAATAA	4	16149	16171	23	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Microcaecilia sp. PZ-2009 mitochondrion