ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Tectona grandis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020098	TAT	4	133	144	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_020098	AAT	4	8128	8138	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_020098	TAT	6	9165	9181	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
4	NC_020098	CAA	4	9208	9219	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_020098	ATT	4	12194	12206	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_020098	TAT	4	14721	14731	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_020098	TCT	5	28736	28749	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
8	NC_020098	AAT	4	30123	30133	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_020098	TAT	4	32503	32513	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_020098	TCT	4	32767	32778	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_020098	TTC	4	36045	36056	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	44274295
12	NC_020098	ATG	4	39574	39584	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	44274296
13	NC_020098	GCA	4	41472	41483	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	44274296
14	NC_020098	ATA	4	45261	45272	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44274296
15	NC_020098	GTA	4	45617	45627	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_020098	TAT	5	47421	47436	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_020098	ATT	4	52011	52021	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_020098	TTA	4	52686	52697	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_020098	ATA	5	55671	55686	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	44274297
20	NC_020098	ATT	4	60101	60111	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_020098	TAA	4	60676	60688	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_020098	ATT	4	65691	65703	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_020098	ATA	4	68116	68127	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_020098	TCT	4	75131	75142	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	44332961
25	NC_020098	ATA	4	80227	80238	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44332961
26	NC_020098	ATT	5	81852	81866	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	44332961
27	NC_020098	CTT	4	85464	85475	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	44332961
28	NC_020098	GAT	4	85932	85942	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	44332961
29	NC_020098	GAT	4	87306	87316	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	44332961
30	NC_020098	GAT	4	90345	90356	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	44332961
31	NC_020098	TGA	4	92039	92050	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	44332961
32	NC_020098	TTC	4	99573	99584	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_020098	AGA	4	110819	110829	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	44274301
34	NC_020098	ATT	4	111501	111513	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	44274301
35	NC_020098	TAA	4	111924	111935	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44274301
36	NC_020098	AAG	4	112149	112160	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	44274301
37	NC_020098	GAA	4	112910	112921	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	44274301
38	NC_020098	ATT	4	114773	114785	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	44274301
39	NC_020098	TTC	5	120366	120380	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	44274301
40	NC_020098	GAA	4	139688	139699	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_020098	ATC	4	148916	148927	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	44274302
42	NC_020098	ATC	4	151956	151966	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_020098	ATC	4	153330	153340	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	44274302
44	NC_020098	GAA	5	153796	153810	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	44274302

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Tectona grandis chloroplast