ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Paracymoriza prodigalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020094	TTTAT	3	128	142	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_020094	TTTTA	3	279	292	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	44140337
3	NC_020094	TAA	4	388	399	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44140337
4	NC_020094	ATTA	3	455	466	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	44140337
5	NC_020094	ATT	6	695	711	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	44140337
6	NC_020094	ATT	4	1022	1034	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	44140337
7	NC_020094	ATTT	3	1051	1061	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	44140337
8	NC_020094	ATTAAA	4	1160	1183	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44140337
9	NC_020094	TTA	4	1775	1785	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44140337
10	NC_020094	AGG	4	2118	2129	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	44140337
11	NC_020094	GAAA	3	2237	2248	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	44140337
12	NC_020094	ATA	7	2842	2862	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	44140337
13	NC_020094	ATT	4	2890	2900	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44140337
14	NC_020094	AATT	3	3725	3735	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	44140337
15	NC_020094	ATA	4	3861	3871	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_020094	TTTA	3	3917	3927	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	44140337
17	NC_020094	ATT	4	3958	3968	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44140337
18	NC_020094	ATA	8	3974	3996	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44140337
19	NC_020094	ATT	4	4597	4609	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	44140337
20	NC_020094	TAAA	3	4698	4709	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	44140337
21	NC_020094	AATT	3	4840	4851	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	44140337
22	NC_020094	ATT	5	4861	4874	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	44140337
23	NC_020094	T	15	4991	5005	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	44140337
24	NC_020094	TTTA	3	5365	5376	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	44140337
25	NC_020094	TTTAA	3	5551	5565	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_020094	ATT	4	5598	5609	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44140337
27	NC_020094	TAT	4	5639	5649	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44140337
28	NC_020094	TAT	4	5861	5872	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44140337
29	NC_020094	CAAA	3	6371	6382	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	44140337
30	NC_020094	TAAA	3	6410	6421	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	44140337
31	NC_020094	ATAAC	3	6703	6716	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	44140337
32	NC_020094	TTA	4	6800	6811	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	44140337
33	NC_020094	AAAATA	3	6949	6966	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	44140337
34	NC_020094	TTA	4	7235	7246	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44140337
35	NC_020094	ATA	5	7340	7354	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	44140337
36	NC_020094	TAA	4	7374	7385	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44140337
37	NC_020094	AT	6	7543	7553	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	44140337
38	NC_020094	AATA	3	8053	8063	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	44140337
39	NC_020094	TAA	4	8222	8236	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	44140338
40	NC_020094	TAAA	3	8984	8994	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	44140338
41	NC_020094	AAAT	3	9068	9078	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	44140338
42	NC_020094	AAAAT	3	9157	9170	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	44140338
43	NC_020094	TAA	4	9212	9222	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	44140338
44	NC_020094	AAATAC	3	9292	9309	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	44140338
45	NC_020094	AT	6	9347	9358	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	44140338
46	NC_020094	TTA	4	9379	9390	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44140338
47	NC_020094	TATAAA	3	9395	9412	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	44140338
48	NC_020094	TAA	5	9410	9424	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	44140338
49	NC_020094	A	13	9697	9709	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	44140338
50	NC_020094	AT	6	9788	9798	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	44140338
51	NC_020094	AAAG	3	9904	9914	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_020094	ATT	4	9941	9951	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_020094	TTTA	3	9982	9993	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	44140338
54	NC_020094	TAT	4	9996	10006	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44140338
55	NC_020094	TAT	4	10011	10021	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44140338
56	NC_020094	ATTTT	4	10116	10135	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	44140338
57	NC_020094	TTTA	3	10161	10172	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	44140338
58	NC_020094	ATA	4	10255	10265	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	44140338
59	NC_020094	ATA	5	10307	10321	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	44140338
60	NC_020094	ATA	5	10411	10425	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	44140338
61	NC_020094	ATTT	4	10426	10441	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	44140338
62	NC_020094	TA	6	10684	10694	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	44140338
63	NC_020094	T	14	10792	10805	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	44140338
64	NC_020094	TTA	4	11088	11099	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44140338
65	NC_020094	ATTT	3	11115	11125	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	44140338
66	NC_020094	ATTT	3	11594	11604	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	44140338
67	NC_020094	TAATA	3	11766	11780	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	44140338
68	NC_020094	AAAT	3	11909	11921	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	44140338
69	NC_020094	ATA	4	12131	12141	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	44140338
70	NC_020094	TAAAA	3	12343	12356	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	44140338
71	NC_020094	TAATA	4	12649	12667	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	44140338
72	NC_020094	ATT	4	12671	12682	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44140338
73	NC_020094	TA	17	12745	12777	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_020094	T	12	13007	13018	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_020094	ATCA	3	13086	13097	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
76	NC_020094	TAA	4	13202	13213	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_020094	TTTA	3	13481	13493	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_020094	ATTA	3	13558	13569	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020094	TAAA	3	13776	13788	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_020094	ATTT	3	13934	13945	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_020094	TTAA	3	14307	14318	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_020094	TAT	5	14457	14470	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_020094	TTAA	3	14754	14764	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_020094	AATTT	3	14776	14790	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_020094	ATA	4	14907	14918	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_020094	TAT	4	14978	14988	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_020094	T	23	15011	15033	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_020094	AATTT	3	15040	15055	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_020094	T	17	15071	15087	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
90	NC_020094	TAATAT	4	15091	15115	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_020094	TCAT	3	15129	15139	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
92	NC_020094	AATT	3	15153	15165	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_020094	TAT	5	15185	15198	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_020094	AT	12	15261	15282	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_020094	TAAA	3	15283	15294	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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