ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Chrysanthemum x morifolium chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020092	TCT	4	795	805	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	44140327
2	NC_020092	ATT	4	1981	1992	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_020092	TTC	4	2190	2201	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	44140327
4	NC_020092	GAA	4	2967	2978	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	44140327
5	NC_020092	GAA	4	2995	3006	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	44140327
6	NC_020092	AGA	5	5090	5103	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_020092	ATA	4	5649	5663	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	44140327
8	NC_020092	AAG	4	12260	12272	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_020092	GAA	4	17332	17343	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	44140328
10	NC_020092	GAA	4	17378	17388	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	44140328
11	NC_020092	GTT	5	24772	24786	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	44140328
12	NC_020092	TGT	4	28195	28206	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	44140328
13	NC_020092	TAA	4	31004	31015	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_020092	TAA	4	31926	31937	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_020092	GAG	4	33712	33722	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	44140328
16	NC_020092	TTC	4	34442	34453	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	44140328
17	NC_020092	CTT	4	35529	35540	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_020092	ATG	4	37997	38007	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	44140329
19	NC_020092	GCA	4	39895	39906	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	44140329
20	NC_020092	ATG	4	40221	40231	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	44140329
21	NC_020092	TGA	4	41715	41726	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_020092	ATA	4	47573	47585	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_020092	TAT	4	50270	50280	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_020092	TTA	4	51091	51102	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_020092	ATA	4	54017	54027	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_020092	TTG	4	54698	54708	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_020092	TAA	4	58536	58548	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_020092	ATA	4	58640	58651	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_020092	ATT	4	60815	60826	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020092	TTC	4	61782	61793	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	44140330
31	NC_020092	AAT	4	62398	62410	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_020092	TTG	4	63627	63639	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_020092	TTA	6	64140	64156	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_020092	ATA	4	65605	65616	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_020092	ATA	4	69336	69346	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	44140331
36	NC_020092	TCT	4	72498	72509	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	44140331
37	NC_020092	CTG	4	77477	77489	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	44140331
38	NC_020092	ATA	4	77546	77557	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44140331
39	NC_020092	GAT	4	84786	84796	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	44140331
40	NC_020092	TTC	4	97127	97138	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	44140331
41	NC_020092	GAA	4	107933	107944	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	44140331
42	NC_020092	ATT	6	112527	112547	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44140331
43	NC_020092	AGA	5	115919	115933	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	44140331
44	NC_020092	TAA	4	117134	117146	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	44140331
45	NC_020092	ATA	4	122097	122107	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	44140331
46	NC_020092	CTT	4	122457	122468	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	44140331
47	NC_020092	GAA	4	136676	136687	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	44140331

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Chrysanthemum x morifolium chloroplast