Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Camellia sinensis chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_020019CAG4105310641233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %43585635
2NC_020019GAA4476147721266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
3NC_020019CTT493329342110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
4NC_020019ATT410257102671133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
5NC_020019GTT42457324584120 %66.67 %33.33 %0 %8 %43585636
6NC_020019TCA426921269311133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %43585636
7NC_020019CAG429209292201233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
8NC_020019ATG440564405741133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %43585637
9NC_020019GCA442462424731233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %43585637
10NC_020019ATA456388564001366.67 %33.33 %0 %0 %7 %43585638
11NC_020019TAA456986569961166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
12NC_020019TTG45709357103110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
13NC_020019TTA458914589261333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
14NC_020019ATT460648606581133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
15NC_020019AGA561076610891466.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
16NC_020019TTA461267612771133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
17NC_020019ATA461332613431266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
18NC_020019TCT46251462525120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
19NC_020019TTA568051680641433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
20NC_020019ATA469308693191266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_020019TAA469796698071266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
22NC_020019TAT469934699461333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
23NC_020019TAT470000700121333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
24NC_020019TCT47008770098120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
25NC_020019ATA474603746131166.67 %33.33 %0 %0 %9 %43585635
26NC_020019TCT47630876319120 %66.67 %0 %33.33 %8 %43585635
27NC_020019GAT477706777161133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %43585635
28NC_020019AAT477838778491266.67 %33.33 %0 %0 %8 %43585635
29NC_020019TCT48073680747120 %66.67 %0 %33.33 %8 %43585635
30NC_020019CTT48680386814120 %66.67 %0 %33.33 %8 %43585635
31NC_020019GAT487270872801133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %43585635
32NC_020019GAT491695917061233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %43585635
33NC_020019TGA493419934301233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %43585635
34NC_020019GAA51118171118311566.67 %0 %33.33 %0 %6 %43585639
35NC_020019TAA41134511134621266.67 %33.33 %0 %0 %8 %43585639
36NC_020019AAG41141901142011266.67 %0 %33.33 %0 %8 %43585639
37NC_020019GAA41149511149621266.67 %0 %33.33 %0 %8 %43585639
38NC_020019TTC5122734122748150 %66.67 %0 %33.33 %6 %43585639
39NC_020019ATA41231031231151366.67 %33.33 %0 %0 %7 %43585639
40NC_020019AAT41286761286871266.67 %33.33 %0 %0 %8 %43585639
41NC_020019TCT4129773129783110 %66.67 %0 %33.33 %9 %43585639
42NC_020019TTC6131912131930190 %66.67 %0 %33.33 %10 %43585639
43NC_020019GAA41422031422141266.67 %0 %33.33 %0 %8 %43585639
44NC_020019ATC41520411520521233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %43585643
45NC_020019ATC41550901551001133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
46NC_020019ATC41564671564771133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %43585643
47NC_020019GAA51569321569461566.67 %0 %33.33 %0 %6 %43585643