ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Monomorphina aenigmatica strain UTEX1284 chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020018	TAT	4	776	787	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_020018	TTC	4	1639	1650	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	44080191
3	NC_020018	ATT	4	3077	3088	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44080191
4	NC_020018	TTA	4	4718	4730	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	44080192
5	NC_020018	TAA	4	5547	5558	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44080192
6	NC_020018	TGG	4	9729	9740	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	44080192
7	NC_020018	GCT	4	10423	10434	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	44080192
8	NC_020018	AAG	4	11452	11463	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	44080192
9	NC_020018	TTA	4	12311	12323	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_020018	TAT	4	13763	13774	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_020018	TAT	4	16021	16031	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44080193
12	NC_020018	ATT	4	18561	18572	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44080193
13	NC_020018	TAT	5	28959	28972	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_020018	TAA	4	32817	32828	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	44080194
15	NC_020018	AAT	4	34666	34676	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	44080194
16	NC_020018	TAA	4	36203	36214	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020018	ATA	4	37615	37625	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	44080194
18	NC_020018	TAA	4	37955	37965	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	44080194
19	NC_020018	AGT	4	39052	39064	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	44080194
20	NC_020018	ATA	4	44595	44608	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	44080195
21	NC_020018	TAA	5	48610	48623	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_020018	TAA	4	48962	48973	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44080195
23	NC_020018	ATT	4	49087	49098	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44080195
24	NC_020018	TAA	5	50736	50750	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	44080195
25	NC_020018	TTA	4	51345	51355	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	44080195
26	NC_020018	ATA	4	51357	51367	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	44080195
27	NC_020018	TAA	4	51449	51460	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44080195
28	NC_020018	ATA	4	51764	51775	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_020018	CAA	4	53694	53704	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	44080196
30	NC_020018	ATA	4	54696	54707	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44080196
31	NC_020018	AAT	4	55857	55869	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_020018	TTA	4	58299	58310	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	44080196
33	NC_020018	ATA	4	59024	59035	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44080196
34	NC_020018	ACC	4	60116	60127	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	44080197
35	NC_020018	ACC	4	62395	62406	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	44080197
36	NC_020018	ATT	5	62866	62880	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	44080197
37	NC_020018	AGC	4	62920	62931	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	44080197
38	NC_020018	ATG	4	63247	63257	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	44080197
39	NC_020018	AGA	4	64889	64900	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	44080197
40	NC_020018	ATA	4	66446	66457	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	44080197
41	NC_020018	ATA	4	66481	66491	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	44080197

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Monomorphina aenigmatica strain UTEX1284 chloroplast