ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cydia pomonella mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020003	TTA	4	665	676	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	44332959
2	NC_020003	ATT	5	690	703	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	44332959
3	NC_020003	ATT	4	914	926	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	44332959
4	NC_020003	TAT	5	1090	1103	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	44332959
5	NC_020003	T	13	1181	1193	13	0 %	100 %	0 %	7 %	44332959
6	NC_020003	TTTAA	3	1259	1273	15	40 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_020003	AATTTT	3	1346	1364	19	33.33 %	66.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
8	NC_020003	ATT	4	2845	2857	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	44332959
9	NC_020003	ATT	4	2882	2892	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	44332959
10	NC_020003	ATA	4	3431	3443	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	44332959
11	NC_020003	AATT	3	3715	3725	11	50 %	50 %	0 %	9 %	44332959
12	NC_020003	TAATT	3	4061	4074	14	40 %	60 %	0 %	7 %	44332959
13	NC_020003	AATT	3	4379	4389	11	50 %	50 %	0 %	9 %	44332959
14	NC_020003	ATTT	3	4834	4845	12	25 %	75 %	0 %	8 %	44332959
15	NC_020003	TATTTA	3	5500	5518	19	33.33 %	66.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
16	NC_020003	ATA	4	5573	5584	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	44332960
17	NC_020003	TTA	4	5598	5608	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	44332960
18	NC_020003	ATTT	3	5820	5831	12	25 %	75 %	0 %	8 %	44332960
19	NC_020003	TAAA	5	6336	6356	21	75 %	25 %	0 %	9 %	44332960
20	NC_020003	TAAA	3	6386	6397	12	75 %	25 %	0 %	0 %	44332960
21	NC_020003	TTAA	3	6842	6853	12	50 %	50 %	0 %	8 %	44332960
22	NC_020003	A	14	6925	6938	14	100 %	0 %	0 %	7 %	44332960
23	NC_020003	TAAA	3	7136	7146	11	75 %	25 %	0 %	9 %	44332960
24	NC_020003	TTA	4	7211	7222	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	44332960
25	NC_020003	ATA	5	7316	7330	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	44332960
26	NC_020003	TAA	4	7754	7766	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	44332960
27	NC_020003	TAT	4	7974	7984	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	44332960
28	NC_020003	A	12	8032	8043	12	100 %	0 %	0 %	0 %	44332960
29	NC_020003	ATC	4	8342	8353	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	44332960
30	NC_020003	TAAA	3	8958	8968	11	75 %	25 %	0 %	9 %	44332960
31	NC_020003	AAAAT	3	8992	9005	14	80 %	20 %	0 %	7 %	44332960
32	NC_020003	AAAAT	3	9131	9144	14	80 %	20 %	0 %	7 %	44332960
33	NC_020003	TA	7	9171	9183	13	50 %	50 %	0 %	7 %	44332960
34	NC_020003	AT	7	9593	9607	15	50 %	50 %	0 %	6 %	44332960
35	NC_020003	TAA	4	9744	9754	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	44332960
36	NC_020003	ATT	5	9882	9895	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	44332960
37	NC_020003	TTTA	3	10094	10105	12	25 %	75 %	0 %	0 %	44332960
38	NC_020003	TTA	4	10162	10173	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	44332960
39	NC_020003	TAT	4	10201	10212	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	44332960
40	NC_020003	TAA	7	10342	10362	21	66.67 %	33.33 %	0 %	4 %	44332960
41	NC_020003	ATTT	3	11048	11058	11	25 %	75 %	0 %	9 %	44332960
42	NC_020003	TTAA	3	11176	11188	13	50 %	50 %	0 %	7 %	44332960
43	NC_020003	TTA	4	11499	11509	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	44332960
44	NC_020003	ATTTT	4	11534	11552	19	20 %	80 %	0 %	10 %	44332960
45	NC_020003	TAAT	3	11592	11603	12	50 %	50 %	0 %	0 %	44332960
46	NC_020003	AATAT	3	12065	12078	14	60 %	40 %	0 %	7 %	44332960
47	NC_020003	TTAA	3	12111	12122	12	50 %	50 %	0 %	8 %	44332960
48	NC_020003	A	16	12282	12297	16	100 %	0 %	0 %	6 %	44332960
49	NC_020003	TAA	4	12321	12331	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	44332960
50	NC_020003	TA	7	12626	12639	14	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_020003	TA	8	13008	13022	15	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_020003	TAAA	3	13087	13098	12	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_020003	ATA	4	13194	13205	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_020003	TTAA	3	13648	13659	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_020003	T	13	13825	13837	13	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_020003	TAAA	3	13846	13857	12	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_020003	T	12	13962	13973	12	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_020003	ATT	4	14010	14021	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_020003	AAATT	3	14227	14241	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_020003	AATTT	3	14694	14708	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020003	T	25	14923	14947	25	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_020003	A	17	14956	14972	17	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_020003	T	14	14985	14998	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020003	ATA	4	15106	15116	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_020003	TAT	7	15145	15167	23	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_020003	AAT	4	15182	15193	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_020003	TAA	4	15201	15212	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cydia pomonella mitochondrion