ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Choristoneura longicellana mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019996	TAAA	3	65	75	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_019996	TTTAT	3	127	141	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_019996	T	13	249	261	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	43585562
4	NC_019996	TTTAAT	4	691	714	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	43585562
5	NC_019996	AATT	3	781	791	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	43585562
6	NC_019996	TTTTA	3	882	895	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	43585562
7	NC_019996	ATT	4	919	931	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	43585562
8	NC_019996	ATTA	5	958	976	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	43585562
9	NC_019996	AAT	4	1021	1033	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	43585562
10	NC_019996	TAAAAT	3	1162	1179	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	43585562
11	NC_019996	ATTTT	3	1361	1375	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_019996	TATAA	3	1737	1750	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	43585563
13	NC_019996	TAT	4	1950	1961	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	43585563
14	NC_019996	TCT	7	2025	2045	21	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	43585563
15	NC_019996	CTTA	3	2669	2680	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	43585563
16	NC_019996	AATATT	3	2844	2861	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	43585563
17	NC_019996	TTAA	3	3177	3187	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	43585563
18	NC_019996	TTTA	3	3188	3198	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	43585563
19	NC_019996	AATT	3	3816	3827	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_019996	TATTT	8	3907	3947	41	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	43585563
21	NC_019996	TAATT	3	4072	4085	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	43585563
22	NC_019996	AATT	3	4390	4400	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	43585563
23	NC_019996	ATT	5	4600	4615	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	43585563
24	NC_019996	ATTT	3	4848	4859	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	43585563
25	NC_019996	TAT	5	4867	4880	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	43585563
26	NC_019996	TATTT	3	4998	5012	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	43585563
27	NC_019996	TATTTA	3	5514	5532	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
28	NC_019996	ATT	4	5581	5594	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	43585563
29	NC_019996	TAT	4	5628	5638	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	43585563
30	NC_019996	ATTT	3	5834	5845	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	43585563
31	NC_019996	TAAA	5	6361	6381	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	43585563
32	NC_019996	TAAA	3	6411	6422	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	43585563
33	NC_019996	TAAA	4	6892	6907	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	43585563
34	NC_019996	TA	6	6915	6925	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	43585563
35	NC_019996	A	14	6950	6963	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	43585563
36	NC_019996	ATA	5	7341	7355	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	43585563
37	NC_019996	TA	6	7360	7370	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	43585563
38	NC_019996	TGAA	3	7429	7439	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	43585563
39	NC_019996	TAA	4	7779	7791	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	43585563
40	NC_019996	CAAA	3	7894	7905	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	43585563
41	NC_019996	A	21	8047	8067	21	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	43585563
42	NC_019996	ATC	4	8371	8382	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	43585563
43	NC_019996	CTAA	3	8740	8751	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	43585563
44	NC_019996	ATAAAT	3	8959	8976	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	43585563
45	NC_019996	ATA	4	8997	9007	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	43585563
46	NC_019996	AAAT	3	9071	9081	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	43585563
47	NC_019996	TAA	4	9124	9136	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	43585563
48	NC_019996	AAAAT	3	9160	9173	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	43585563
49	NC_019996	AAATAA	3	9649	9667	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	43585563
50	NC_019996	AAT	7	9948	9968	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	43585563
51	NC_019996	ATTTT	4	10077	10096	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	43585563
52	NC_019996	T	12	10173	10184	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	43585563
53	NC_019996	ATT	4	10189	10200	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	43585563
54	NC_019996	ATT	7	10203	10224	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	43585563
55	NC_019996	AT	6	10226	10237	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	43585563
56	NC_019996	ATA	4	10298	10308	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	43585563
57	NC_019996	ATA	8	10366	10389	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	43585563
58	NC_019996	TATT	5	10382	10401	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	43585563
59	NC_019996	TAT	4	10848	10859	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	43585564
60	NC_019996	CTTTT	3	11031	11046	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	43585564
61	NC_019996	ATTT	3	11079	11089	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	43585564
62	NC_019996	TTAA	3	11207	11219	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	43585564
63	NC_019996	AATTTT	3	11383	11400	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	43585564
64	NC_019996	TTA	4	11530	11540	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	43585564
65	NC_019996	TTAA	3	11622	11633	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	43585564
66	NC_019996	ATT	4	11673	11683	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_019996	TTAA	3	12139	12150	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	43585564
68	NC_019996	A	16	12310	12325	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	43585564
69	NC_019996	AT	40	12737	12810	74	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_019996	T	12	13011	13022	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_019996	TA	46	13104	13190	87	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_019996	ATT	4	13270	13280	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_019996	TTAA	3	13489	13499	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_019996	AAATT	4	13686	13706	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_019996	AAAT	3	13772	13784	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_019996	ATTA	4	13975	13990	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_019996	ATT	4	14191	14202	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_019996	T	12	14222	14233	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_019996	AAATT	3	14410	14424	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_019996	AAAT	3	14597	14608	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_019996	T	24	15109	15132	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_019996	AT	23	15158	15200	43	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_019996	TAA	4	15243	15254	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_019996	TA	24	15252	15296	45	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_019996	TAA	4	15341	15352	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_019996	AT	16	15352	15384	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_019996	TAA	4	15433	15444	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_019996	AT	16	15444	15476	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_019996	T	14	15537	15550	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_019996	TAATA	3	15671	15685	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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