ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ceracris kiangsu isolate H6012 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019994	AAAT	3	445	455	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	43585558
2	NC_019994	ATTAT	3	803	817	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	43585558
3	NC_019994	ATT	4	2818	2828	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	43585558
4	NC_019994	AT	6	3167	3177	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	43585559
5	NC_019994	AATT	3	3248	3260	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	43585559
6	NC_019994	TA	6	3289	3299	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	43585559
7	NC_019994	ATT	4	4120	4132	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	43585559
8	NC_019994	ATA	4	4271	4282	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	43585559
9	NC_019994	AAT	4	5575	5586	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	43585559
10	NC_019994	TAA	4	6099	6109	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_019994	ATA	4	6278	6289	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_019994	TAAA	4	6434	6449	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	43585559
13	NC_019994	AAAATA	3	6920	6936	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	43585559
14	NC_019994	TA	7	7343	7355	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	43585559
15	NC_019994	AAG	4	7460	7471	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	43585559
16	NC_019994	ATA	4	7554	7566	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	43585559
17	NC_019994	AAT	4	7794	7805	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	43585559
18	NC_019994	ACCAAA	3	7998	8016	19	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10 %	43585559
19	NC_019994	TAA	4	8195	8205	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	43585559
20	NC_019994	AT	6	8279	8290	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	43585559
21	NC_019994	AAAT	3	9043	9055	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	43585559
22	NC_019994	AATCAA	3	9597	9614	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	43585559
23	NC_019994	TAA	4	9631	9642	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	43585559
24	NC_019994	ATA	7	9903	9923	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	43585559
25	NC_019994	AAAT	3	9926	9938	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	43585559
26	NC_019994	TTTA	3	10088	10099	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	43585559
27	NC_019994	ATTAT	3	10258	10271	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	43585559
28	NC_019994	AAT	5	10328	10342	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	43585559
29	NC_019994	TAG	4	10360	10371	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	43585559
30	NC_019994	AT	6	10743	10753	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	43585559
31	NC_019994	ACAT	4	10750	10765	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	43585559
32	NC_019994	AAAT	3	11701	11711	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	43585559
33	NC_019994	TAAAA	3	12268	12281	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	43585559
34	NC_019994	TTAA	3	12682	12693	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_019994	TAAA	3	13036	13047	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_019994	AAAT	3	13469	13479	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_019994	TAA	5	13706	13720	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_019994	TTTA	3	13730	13742	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_019994	ATT	4	13933	13944	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_019994	AAT	4	13964	13975	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_019994	TA	6	13975	13985	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_019994	AATTA	5	14191	14214	24	60 %	40 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
43	NC_019994	TTAA	3	14785	14795	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_019994	ACA	4	15017	15028	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_019994	CTTT	3	15090	15101	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019994	AT	7	15349	15361	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_019994	TAAAA	3	15554	15568	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_019994	ACTTT	3	15588	15601	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ceracris kiangsu isolate H6012 mitochondrion