ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Chondracris rosea mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019993	ATA	4	355	365	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	43585554
2	NC_019993	AATC	3	368	378	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	43585554
3	NC_019993	TAT	4	413	424	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	43585554
4	NC_019993	ATT	4	661	672	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	43585554
5	NC_019993	AAT	4	1510	1521	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	43585554
6	NC_019993	AT	6	3152	3162	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	43585554
7	NC_019993	TTTAA	3	3920	3934	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	43585554
8	NC_019993	AGAA	3	3980	3990	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	43585554
9	NC_019993	ATT	4	4102	4114	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	43585554
10	NC_019993	TCAA	3	5374	5385	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	43585554
11	NC_019993	TAA	4	6091	6101	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_019993	AAT	5	6854	6867	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	43585555
13	NC_019993	AGAAAA	3	6897	6915	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	43585555
14	NC_019993	TTA	4	7196	7207	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	43585555
15	NC_019993	AAG	4	7445	7456	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	43585555
16	NC_019993	ATA	4	7539	7551	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	43585555
17	NC_019993	AAT	4	7779	7791	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	43585555
18	NC_019993	AT	6	8267	8278	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	43585555
19	NC_019993	AAAT	3	8721	8732	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	43585555
20	NC_019993	AAAT	3	9031	9043	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	43585555
21	NC_019993	AAT	4	9310	9322	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	43585555
22	NC_019993	AAT	4	9582	9593	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	43585555
23	NC_019993	TAA	4	9894	9904	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	43585555
24	NC_019993	TTAT	3	10081	10092	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	43585555
25	NC_019993	TTAA	3	10168	10180	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	43585555
26	NC_019993	ATA	4	10196	10206	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	43585555
27	NC_019993	AAT	5	10320	10334	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	43585555
28	NC_019993	TAG	4	10610	10620	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	43585555
29	NC_019993	AAAT	3	11691	11702	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	43585555
30	NC_019993	TAAAA	3	12256	12269	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	43585555
31	NC_019993	ATA	4	12976	12986	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_019993	ATTA	3	13415	13426	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_019993	TAAAAA	3	13460	13478	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
34	NC_019993	ACAA	3	13918	13928	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
35	NC_019993	ACAA	3	13959	13970	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_019993	AAT	4	14149	14161	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_019993	AAAATA	4	14926	14949	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_019993	A	15	14957	14971	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_019993	TA	6	15004	15014	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_019993	TAA	4	15220	15232	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_019993	TAA	4	15273	15283	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_019993	ATA	5	15325	15338	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_019993	A	13	15387	15399	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_019993	TAA	6	15446	15462	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_019993	TA	7	15517	15532	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Chondracris rosea mitochondrion