ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Philodina citrina mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019806	T	14	194	207	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	42922204
2	NC_019806	TAT	4	623	634	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42922204
3	NC_019806	AGG	4	667	677	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	42922204
4	NC_019806	TTTA	4	1030	1045	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	42922204
5	NC_019806	ATT	4	1224	1235	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42922204
6	NC_019806	AAATTT	3	1789	1806	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
7	NC_019806	AATAA	4	1874	1892	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
8	NC_019806	GGAA	3	2027	2038	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_019806	TTTA	3	2057	2068	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_019806	AATT	3	2282	2293	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019806	ATT	4	2397	2407	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_019806	TA	6	2487	2497	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42922204
13	NC_019806	ATA	4	2542	2553	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42922204
14	NC_019806	TCT	4	2662	2673	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	42922204
15	NC_019806	T	15	2689	2703	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	42922204
16	NC_019806	TTTA	3	2769	2779	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	42922204
17	NC_019806	TAA	4	3400	3411	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42922204
18	NC_019806	GAA	4	4302	4314	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	42922204
19	NC_019806	TAT	4	5518	5529	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42922204
20	NC_019806	ATTT	3	5554	5564	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	42922204
21	NC_019806	TGT	4	5753	5764	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	42922204
22	NC_019806	TATTT	4	5851	5875	25	20 %	80 %	0 %	0 %	8 %	42922204
23	NC_019806	T	14	6073	6086	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	42922204
24	NC_019806	TTA	4	6325	6336	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42922204
25	NC_019806	TTTA	3	6443	6453	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	42922204
26	NC_019806	ATT	4	6862	6872	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42922204
27	NC_019806	T	13	7091	7103	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	42922204
28	NC_019806	TAA	4	7169	7179	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42922204
29	NC_019806	TA	6	7200	7210	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42922204
30	NC_019806	ATTAAT	3	7430	7447	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	42922205
31	NC_019806	T	13	7846	7858	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	42922205
32	NC_019806	TAA	4	8608	8619	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42922205
33	NC_019806	TGAAAT	3	8799	8816	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	42922205
34	NC_019806	T	12	9285	9296	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_019806	TAA	4	9377	9388	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_019806	AATT	3	9434	9445	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_019806	TAAA	3	9563	9574	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_019806	ATTT	4	9907	9923	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	42922205
39	NC_019806	ATTT	3	10862	10872	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	42922205
40	NC_019806	TTG	4	11078	11089	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	42922205
41	NC_019806	AAT	4	11138	11149	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	42922205
42	NC_019806	TTAT	4	11150	11165	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	42922205
43	NC_019806	GTTT	3	11287	11298	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	42922205
44	NC_019806	TTA	5	11682	11696	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_019806	TAA	4	11707	11718	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_019806	ATT	4	11850	11861	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_019806	ATTTT	3	11884	11898	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_019806	A	12	12294	12305	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019806	AATT	3	12835	12845	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_019806	TTTTA	3	13254	13267	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	42922205
51	NC_019806	ATT	4	13339	13350	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42922205
52	NC_019806	ATTTT	3	13862	13875	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	42922205
53	NC_019806	TTTTA	3	13888	13902	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	42922205

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Philodina citrina mitochondrion