ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Nuttalliella namaqua mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019663	ATT	4	547	558	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640683
2	NC_019663	TAA	5	714	727	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640683
3	NC_019663	TTTAA	3	972	985	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	42640683
4	NC_019663	AATT	3	1059	1071	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_019663	TTTAAA	3	1100	1118	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
6	NC_019663	TA	6	1353	1363	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640683
7	NC_019663	TATAA	3	1483	1496	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	42640683
8	NC_019663	TAT	5	1524	1538	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	42640683
9	NC_019663	ATTT	4	2224	2239	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	42640683
10	NC_019663	TTA	4	2830	2840	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640683
11	NC_019663	ATA	4	3124	3134	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42640683
12	NC_019663	TTAA	3	3593	3605	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	42640683
13	NC_019663	AAT	4	3810	3821	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640683
14	NC_019663	AAT	4	3831	3842	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640683
15	NC_019663	TAA	4	3890	3901	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640683
16	NC_019663	ATT	4	3903	3914	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640683
17	NC_019663	AAT	5	4041	4055	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	42640683
18	NC_019663	CTT	4	4186	4198	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	42640683
19	NC_019663	AAT	7	4418	4438	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42640683
20	NC_019663	TAA	7	4459	4479	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42640683
21	NC_019663	ATTT	3	5088	5099	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42640683
22	NC_019663	ATT	5	5387	5401	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	42640683
23	NC_019663	TAAAA	3	5537	5550	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_019663	AAATTG	3	5554	5572	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
25	NC_019663	TTTA	3	5864	5875	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019663	ATA	4	6058	6069	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640683
27	NC_019663	AAT	4	6222	6233	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640683
28	NC_019663	TTC	4	6356	6367	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	42640683
29	NC_019663	AAT	5	6374	6387	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640683
30	NC_019663	TAA	4	6410	6422	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640683
31	NC_019663	ATT	4	7038	7049	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640683
32	NC_019663	ATA	4	7285	7295	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42640683
33	NC_019663	AAATT	3	7403	7417	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	42640683
34	NC_019663	ATAA	3	7471	7482	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	42640683
35	NC_019663	AAAAAT	3	7528	7544	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	42640683
36	NC_019663	AATT	3	7729	7741	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	42640684
37	NC_019663	ATAA	3	7806	7817	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42640684
38	NC_019663	TAT	5	8407	8421	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	42640684
39	NC_019663	ATA	5	8658	8672	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	42640684
40	NC_019663	AAAAT	4	8804	8823	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	42640684
41	NC_019663	TAT	4	8842	8853	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640684
42	NC_019663	TAA	4	9053	9064	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640684
43	NC_019663	A	13	9097	9109	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	42640684
44	NC_019663	AAAT	3	9129	9140	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42640684
45	NC_019663	TAA	7	9202	9222	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42640684
46	NC_019663	TAA	4	9415	9426	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640684
47	NC_019663	TAT	4	9442	9454	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42640684
48	NC_019663	CAA	4	9745	9756	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	42640684
49	NC_019663	AAT	4	9803	9814	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640684
50	NC_019663	TATTTA	3	10035	10052	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	42640684
51	NC_019663	AT	6	10090	10101	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42640684
52	NC_019663	ATA	4	10133	10144	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640684
53	NC_019663	TAATTT	3	10485	10502	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	42640684
54	NC_019663	TAA	4	10687	10698	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640684
55	NC_019663	AAT	4	11009	11020	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640684
56	NC_019663	TAT	4	11564	11575	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640684
57	NC_019663	CATT	3	11599	11610	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	42640684
58	NC_019663	AATAAA	3	11844	11861	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	42640684
59	NC_019663	TAAA	3	12442	12454	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_019663	AAT	4	12733	12744	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_019663	TAACTT	3	12777	12795	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
62	NC_019663	TTAC	3	13143	13153	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
63	NC_019663	TCT	4	13886	13896	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
64	NC_019663	ATTT	3	14021	14031	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Nuttalliella namaqua mitochondrion