ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Metacrangonyx repens mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019653	AT	7	24	36	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	42869774
2	NC_019653	AAT	4	232	243	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42869774
3	NC_019653	AAAT	3	858	868	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42869774
4	NC_019653	AACA	3	1006	1017	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	42869774
5	NC_019653	TTTGT	4	1579	1598	20	0 %	80 %	20 %	0 %	5 %	42869775
6	NC_019653	TAT	4	1611	1622	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42869775
7	NC_019653	AT	6	1808	1818	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42869775
8	NC_019653	TTA	4	2004	2014	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42869775
9	NC_019653	T	13	2154	2166	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	42869775
10	NC_019653	ATTT	3	2246	2257	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42869775
11	NC_019653	TTAT	3	2404	2415	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42869775
12	NC_019653	TATAA	3	2967	2980	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	42869775
13	NC_019653	TAT	4	3008	3019	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42869775
14	NC_019653	TTAG	3	3641	3652	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	42869775
15	NC_019653	TTA	5	4085	4098	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42869775
16	NC_019653	ATTT	3	4401	4411	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	42869775
17	NC_019653	AATT	3	5025	5036	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_019653	TATT	3	5117	5128	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42869775
19	NC_019653	AAG	4	5204	5215	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42869775
20	NC_019653	AATT	3	5574	5584	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42869775
21	NC_019653	ATTT	3	5726	5737	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42869775
22	NC_019653	AT	6	5769	5779	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42869775
23	NC_019653	T	15	6172	6186	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	42869775
24	NC_019653	TATT	3	6661	6672	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	42869775
25	NC_019653	ATTT	3	6732	6742	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	42869775
26	NC_019653	TAT	6	6969	6986	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	42869775
27	NC_019653	TTA	4	7174	7185	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_019653	TAA	4	7184	7195	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_019653	ATAAA	3	7269	7283	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_019653	TTA	4	7389	7400	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42869775
31	NC_019653	TAA	4	7401	7412	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42869775
32	NC_019653	TA	6	7491	7502	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42869775
33	NC_019653	AATC	3	7530	7540	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	42869775
34	NC_019653	ATT	4	7663	7674	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42869775
35	NC_019653	AAAT	3	7785	7795	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42869775
36	NC_019653	ATT	4	8240	8251	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42869775
37	NC_019653	ATA	4	8796	8807	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42869775
38	NC_019653	TTA	5	8987	9002	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	42869775
39	NC_019653	TA	7	9881	9893	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	43179205
40	NC_019653	TAA	4	10190	10201	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	43179205
41	NC_019653	AAT	4	10210	10221	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	43179205
42	NC_019653	AAT	4	10265	10276	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	43179205
43	NC_019653	AT	6	10675	10685	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42869775
44	NC_019653	ATT	4	10792	10802	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42869776
45	NC_019653	AAT	4	10830	10841	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42869776
46	NC_019653	AATG	3	11245	11255	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	42869776
47	NC_019653	TAAA	3	11268	11278	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42869776
48	NC_019653	AAT	4	11281	11292	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42869776
49	NC_019653	AAATTA	3	12116	12133	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	42869776
50	NC_019653	TAA	4	12152	12164	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42869776
51	NC_019653	AAATAT	3	12567	12585	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
52	NC_019653	TTAC	3	13012	13022	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_019653	TAT	4	13108	13119	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_019653	AT	6	13255	13265	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_019653	T	15	14038	14052	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019653	A	14	14143	14156	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_019653	A	15	14295	14309	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Metacrangonyx repens mitochondrion